2011-veres-09--Obmin_bilkiv--Ch_2-G_I
.pdf
Корегуючий сайт
Акцепторне
стебло
Коректування аміноацил-
тРНК (Editing of AminoacyltRNA). «Рухлива» ССА-рука
аміноацил-тРНК |
може |
|
рухати |
амінокислоту |
між |
сайтами |
активації |
і |
корегуючим. |
Якщо |
|
амінокислота |
добре |
|
«підходила» до корегуючого |
|
сайту, то видалялася за |
|
допомогою гідролізу |
Антикодонова петля |
Сайт
активації
Комплекс треоніл-тРНК синтетази (Threonyl-tRNA Synthetase |
|
|
Complex). Структура комплексу треоніл-тРНК-синтетази і тРНК Тре |
|
|
показує те, що синтетаза зв'язує акцепторне стебло і антикодонову |
41 |
|
петлю. |
||
|
Акцепторне стебло
Пара основ
Антикодонова петля
Комплекс глутаміл-тРНК синтетази (Glutaminyl-tRNA Synthetase Complex).
Структура цього комплексу показує те, що синтетаза взаємодіє з парою основ , акцепторним стеблом та антикодоновою петлею.
42
Клас синтетаз І |
Клас синтетаз ІІ |
|
|
Класифікація і структура субодиниць |
Класи |
аміноацил-тРНК |
аміноацил-тРНК-синтетаз у E. coli |
синтетаз. |
|
|
Класи синтетаз І і ІІ впізнають різні «сторони» молекули тРНК. ССА-рука тРНК приймає різні конформації в комплексах з 2-ма класами синтетаз.
43
Елонгація. Етап 2.
Утворення пептидного зв‟язку між метіоніном і амінокислотою, яку несе тРНК, що є в акцеторному сайті (А-сайті). Поліпептидний ланцюг на даний момент: Met –Thr (Мет-Тре або метіоніл-треонін)
44
Утворення пептидного зв'язку (Peptide-Bond Formation).
Аміногрупа аміноацил-тРНК атакує карбонільну групу естерного звязку пептидил-тРНК для формування тетраедрального інтермедіату, який руйнується, утворюючи пептидний зв‟язок та
вивільняючи деацильовану тРНК.
45
Ріст поліпептидного ланцюга (Polypeptide-Chain Growth). Білки синтезуються через за допомогою успішного приєднання амінокислот до
карбоксильного кінця. |
46 |
|
Елонгація. Етап 3.
Рибосома рухається у напрямі 3„-кінця мРНК на три нуклеотидні основи на ній або зсув тРНК на один кодон і розташування поліпептидного ланцюга в пептидильному сайті (P-сайті). A-сайт (акцепторний сайт) є відкритим, а вільна тРНК розташована в E-сайті (сайті “вивільнення” або “виходу” тРНК).
47
Механізм транслокації (Translocation Mechanism).
Активований ГТФ фактор елонгації EF-G приєднується до EF-Tu-звязувального сайту на 50S субодиниці. Це стимулює GTP гідроліз, індукуючи конформаційну зміну в факторі елонгації EF-G, скеровуючи його стебло в A-сайт на 30S субодиниці. Для акомодації цього домену тРНК і мРНК рухаються через рибосому «кроком» в один кодон.
48
Елонгація. Етап 4.
тРНК звільнюється з Е- сайту.
49
Повторення елонгації (Етап 1 – 4)
Доти – поки не з‟явиться «Стоп-кодон» на мРНК.
50