Номенклатура трансфераз

Трансферазы катализируют реакции переноса различных радикалов от молекулы-донора к молекуле-акцептору, общая схема которых приведена ниже:

Д-Г + А ↔ Д + Г-А

где:

• Д-Г – молекула донор группы Г,

• А – молекула акцептор,

• Г – переносимая группа

А, Д ≠ Н₂О

Реакции гидролиза, которые также соответствуют этой схеме, выделены в отдельный класс.

Систематические названия ферментов класса трансфераз строятся следующим образом: название донора группы: название акцептора группы – название переносимой группы – название класса (тире между названием переносимой группы и названием класса не ставится).

В тривиальные названия трансфераз включают название донора группы и название переносимой группы.

Рассмотрим ряд примеров.

К первому подклассу трансфераз относят ферменты, катализирующие реакции переноса одноуглеродных остатков, например:

1). Карбомоилирование аспартата (перенос карбамоильной группы):

Систематическое название фермента КФ 2.1.3.2. – карбомоилфосфат:L-аспартат-карбомоилтрансфераза, тривиальное – аспартат-карбомоилтрансфераза.

К второму подклассу трансфераз относят ферменты, катализирующие реакции переноса альдегидных или кетонных остатков, например:

2). Транскетолазная реакция (перенос гликольальдегидной группы):

Символом показаны места разрыва углерод-углеродной связи.

Систематические названия ферментов КФ 2.2.1.1. – D-седогептулозо-7-фосфат:D-глицеральдегид-3-фосфат-гликольальдегидтрансфераза

К третьему подклассу трансфераз относят ферменты, катализирующие реакции переноса ацильных остатков (ацилтрансферазы). В большинстве этих реакций принимает участие кофермент А (КоА-SH, см. уч. пособ. Ч II, стр.17).

3). Образование ацетилфосфата (перенос ацетильной группы):

KoA-SCOCH₃ + HOPO₃^2– ↔ CH₃COOPO₃^2– + KoA-SH

Фермент катализирующий эту реакцию по систематической номенклатуре называется – ацетил-КоА:ортофосфат-ацетилтрансфераза и имеет классификационный номер КФ 2.3.1.8. Тривиальное название этого фермента – фосфат-ацетилтрансфераза.

Рассмотрим очень кратко номенклатуру остальных классов ферментов (подробнее см. в пособии «Ферменты. Номенклатура»)

Номенклатура гидролаз

Гидролазы катализируют реакции гидролиза.

Систематические названия гидролаз содержат наименование гидролизуемого субстрата и наименование отщепляемой группы в сочетании со словом гидролаза. Рекомендованные тривиальные названия многих гидролаз образуют из названия гидролизуемого субстрата с добавлением окончания – аза. Следует отметить, что специфичность действия многих гидролаз имеет сложный и не всегда выясненный характер. Это не позволяет дать таким гидролазам систематическое название. В этих случаях используются эмпирические названия, присвоенные им при первом описании. Так не имеют систематических названий большинство ферментов катализирующих гидролиз биополимеров – ДНК, РНК, белков и полисахаридов. Подклассы гидролаз образованы в зависимости от природы гидролизуемой связи. Известны гидролазы катализирующие гидролиз сложноэфирных, пептидных, гликозидных, ангидридных и других связей.

Гидролазы, катализирующие гидролиз сложноэфирных связей, образуют подкласс КФ 3.1 – эстеразы. Эстеразы в зависимости от природы сложноэфирной связи и класса субстрата делятся на следующие подподклассы и группы. По рекомендованной тривиальной номенклатуре эстеразы, катализирующие гидролиз жиров называются – липазы; моноэфиров фосфорной кислоты – фосфатазы; диэфиров фосфорной кислоты – фосфодиэстеразы; лактонов – лактоназы; эфиров серной кислоты – сульфатазы; ДНК – дезоксирибонуклеазы; РНК - рибонуклеазы и др. Рассмотрим ряд примеров: