- •Каталог вычислительных формул для статистического анализа диагностических таблиц перекрестной классификации Наблюдаемые численности исходов при общепопуляционном формировании выборки
- •Статистическое оценивание
- •Два основных типа статистических оценок
- •Основная логика статистического оценивания: точечные оценки
- •Основная логика статистического оценивания: интервальные оценки
- •Доверительные интервалы
- •Точность и надежность статистических оценок
- •Идеальный и бесполезный тесты в терминах Se и Sp
- •Точечные статистические оценки предсказательных вероятностей наличия или отсутствия болезни у субъектов с положительными или отрицательными результатами проверяемого диагностического теста
- •Идеальный и бесполезный тесты в терминах ppv и npv
- •Точечные статистические оценки для отношений правдоподобий
- •Идеальный и бесполезный тесты в терминах lr
- •Показатели связи и согласованности Отношение шансов («оддов»)
- •Коэффициенты каппа Коуэна
- •Надежность доверительных интервалов (ди)
- •Точечные статистические оценки вероятностей наблюдать положительные или отрицательные результаты проверяемого диагностического теста у субъектов с болезнью или без нее
- •Исследования типа «случаи – контроли»
- •Наблюдаемые численности исходов при формировании выборок по схеме «случаи-контроли»
- •Построение доверительных интервалов для основных показателей согласованности, точности и информативности диагностического теста
- •Доверительные интервалы для показателей точности и информативности при формировании общепопуляционной выборки
- •Доверительные интервалы для ppv и npv при формировании выборок по схеме «случаи-контроли»
- •Доверительные границы для разности долей
- •Частотнический подход
- •Бейзовский подход
- •Доверительный интервал для коэффициента каппа Коуэна
- •Доверительный интервал для отношения шансов («оддов»)
- •Приложение Дополнительные показатели точности и информативности клинико-лабораторных диагностических тестов Дополнительные показатели точности
- •Дополнительные показатели информативности
- •Литература
Бейзовский подход
Границы бейзовского 100(1-α)%-го ДИ для разности двух независимых долей можно приближенно вычислить по формулам:
Для нижней границы:
Для верхней границы:
Источник:
Agresti A., Caffo B. Simple and effective confidence intervals for proportions and differences of proportions result from adding two successes and two failures // The American Statistician, 2002. - Vol. 54. - No. 4. P. 280-288.
Доверительный интервал для коэффициента каппа Коуэна
Для построения 100(1 – α)%-го ДИ для коэффициента каппа Коуэна вычисляют стандартную ошибку его точечной оценки по приближенной формуле (по Garner, 1991):
Тогда нижней границей 100(1 – α)%-го ДИ будет:
А верхней границей 100(1 – α)%-го ДИ будет:
Источник:
Blackman N.J.-M., Koval J.J. Interval estimation for Cohen' s kappa as a measure of agreement // Statist. Med., 2000. – Vol. 19. – N 5. - P. 723 – 741.
Доверительный интервал для отношения шансов («оддов»)
Дабы избежать неопределенности в оценивании отношения шансов («оддов») OR, возникающей при наличии нулевых численностей в анализируемой таблице перекрестной классификации 22, точечную статистическую оценку OR и ДИ для него лучше производить с поправками по формулам:
где
,
,
и
Для нахождения 100(1 – α)%-го ДИ для оцениваемого значения OR находят cтандартную ошибку для его логарифма lnOR по формуле:
Тогда статистическими оценками границ 100(1 – α)%-го ДИ для оцениваемого значения OR будут:
Статистическая оценка нижней границы:
Статистическая оценка верхней границы:
Источник:
Bolboacă S., Cadariu A.A. Binomial distribution sample confidence intervals estimation.
5. Odds ratio // Leonardo Journal of Sciences, 2004. – No. 4. – P. 26-43.
URL: http://ljs.academicdirect.org/A04/26_43.htm
Элементы планирования эксперимента в клинико-лабораторных диагностических исследованиях
Оценка объемов выборок для надежной оценки PPV и NPV в клинико-лабораторных диагностических при формировании выборок по схеме «случаи-контроли».
Оптимальное соотношение объемов выборок субъектов с болезнью и без нее для оценки PPV:
Для любого приемлемого диагностического теста Se + Sp > 1. Это означает, что это отношение всегда меньше 1. Например, если мы ожидаем, что и чувствительность и специфичность должны быть не меньше 0,8, то исследование должно включать в 4 раза больше прациентов без болезни, чем с болезнью. Если Se и Sp обе равны 0,9, то оптимальным будет соотношение 9:1. Если же объемы выборок будут равными, то асимтотические дисперсии оценок PPV будут, соответственно, на 36% и 64% больше, чем при указаных оптимальных соотношениях.
Ситуация с NPV симметрична. В этом случае оптимальное соотношение пациентов с болезнь и без нее задается выражением:
Таким образом, RNPV = 1 − RPPV и оптимальное соотношение для NPV требует больше субъектов с болезнью.
Интересное свойство заключается в том, что оптимально соотношение объемов выборок не зависит от распространенности болезни.
Для вычисления соотношения числа субъектов с болезнью и без нее до начала исследования необходимы предварительные оценки чувстивтельности и специфичности.
При некоторых исследованиях бывает так, что стоимость тестирования больных субъектов может превышать таковую для субъектов без болезни. Подобные различия в стоимости можно довольно легко учесть при планировании объемов выборок. Для этого в указанные формулы вводят величину с, которая есть соотношение стоимостей тестирования субъектов с болезнью и без нее:
для PPV и
для NPV.
Минимально необходимые объемы выборок находят по формулам:
для PPV и:
для NPV.
Здесь:
α – предпочитаемый исследователем уровень значимости, (1 – β) – предпочитаемая исследователем статистическая мощность, (1 – γPPV) и (1 – γNPV) минимальные значения PPV и NPV, которыми по мнению исследователя должен обладать проверяемый клинико-лабораторный диагностический тест (ПКЛДТ).
Источник:
Steinberg D.M., Fine J., Chappell R. Sample size for positive and negative predictive value in diagnostic research using case–control designs // Biostatistics, 2009. - Vol. 10. - N 1. – P. 94–105.
