4. Отдел Наноархеота - Nanoarchaeota.

Название отдела происходит от греческих слов, обозначающих «древний карлик».

Представлен только одним известным видом, Nanoarchaeum equitans.

Морфология клетки: ультрамикроб, клетки около 400 нм (0.4 мм) в диаметре. Считается самым маленьким из известных организмов.

Физиология: облигатный симбионт археи рода Ignicoccus (Crenarchaeota). Развивается только в контакте с клетками хозяина. Nanoarchaeum equitans не может синтезировать липиды, и получает их от хозяина.

Отношение к температуре: термофил, развивается при температуре около +80.

Особенности генома: геном малого размера, 491 тыс. п.н. (самый маленький не-вирусный геном, секвенированный полностью, вслед за Candidatus Carsonella ruddii). Геном представлен единственной циркулярной хромосомой. Средний ГЦ% - 31.6. Отсутствуют почти все гены, ответственные за биосинтез аминокислот, нуклеотидов, кофакторов, липидов. Присутствуют гены, кодирующие все биомолекулы, необходимые для репликации и репарации ДНК.

Местообитания: обнаружен в морском гидротермальном выходе близ Исландии, в субполярной части океана, а также в водоемах Йеллоустоунского национального парка (Сев. Америка).

5. Отдел Таумархеота - Thaumarchaeota.

Название отдела происходит от греческого слова 'thaumas' ‒ блуждающий. Отдел предложен в 2008 г.

Включает 3 рода.

Значимые молекулярные признаки: обладают топоизомеразой типа I, которая ранее считалась уникальной для эукариот.

Физиология: хемолитоавтотрофные окислители аммония.

Роль в биогеохимических циклах: предположительно, имеют важную роль в круговороте азота и углерода.

Особенности генома: полностью секвенированный геном Cenarchaeum symbiosum значительно отличается от геномов представителей Crenarchaeota. Отдел предложен главным образом на основе сиквенсов генов рРНК.

Местообитания, экология: морской вид Cenarchaeum symbiosum живет эндосимбиотически внутри губки Axinella mexicana.

Представители: Cenarchaeum symbiosum, Nitrosopumilus maritimus, Nitrososphaera gargensis, and Nitrososphaera viennensis.

Домен Bacteria

6. Отдел Термотоги – Thermotogae.

Включает 10 родов, относящихся к 1 классу.

Филогенетическое положение: В разных филогенетических схемах отдел соперничает с Aquificae как наиболее древний из эубактерий.

Биохимические маркеры: в пептидогликане клеточной стенки отсутствует мезодиаминопимелиновая кислота. Клетки содержат уникальные для отдела липиды.

Окраска по Граму: грамотрицательные (однако монодермные – окружены одинарной липидной биомембраной).

Морфология клетки: Клетки покрыты особым чехлом – тогой (toga), который выходит в виде вздутий на концах клетки. Отсюда названия всех родов включают слово «toga». Тога – это зимняя одежда в древнем Риме, полоса шерстяной ткани, обворачиваемая вокруг туники. Неспорообразующие палочки; неподвижные или подвижные из-за полярных, латеральных или перитрихиальных жгутиков.

Физиология: хемогетеротрофы, обладают функциональным гликолитическим путем. Могут развиваться анаэробно на углеводах и продуктах расщепления белков. Основные продукты брожения – лактат, ацетат, углекислый газ, молекулярный водород. В среде с водородом и серой образуют сероводород. Морские виды растут при повышенной концентрации NaCl.

Отношение к кислороду: анаэробные.

Отношение к температуре: термофильные или гипертермофильные (оптимальные температуры 70‒80С, растут при 90С), редко мезофильные.

Местообитания: обитают в геотермально нагретых морских осадках или горячих источниках (активные геотермальные участки, где найдены термотоги, включают морские гидротермальные выходы и наземные сольфатарные источники – грязевые вулканы, участки с вулканической активностью).

Практическое значение: представляют интерес как объекты биотехнологии (промышленной микробиологии) из-за термоустойчивости, способности использовать в пищу углеводы и продуцировать газообразный водород (который является одной из основ альтернативной энергетики).