- •Хромова
- •Полиморфизм системы hla у представителей разных славянских этнических групп (русской, белорусской и украинской)
- •Бубнова л.Н.
- •Особенности распределения специфичностей гена drb1 в исследованных популяциях.
- •Особенности распределения специфичностей гена dqa1 в исследованных популяциях.
- •Особенности распределения специфичностей гена dqb1 в исследованных популяциях.
- •Особенности распределения трехлокусных гаплотипов в исследованных популяциях.
- •Выводы:
- •Практические рекомендации
- •Список работ, опубликованных по теме диссертации
Особенности распределения трехлокусных гаплотипов в исследованных популяциях.
В выборках русских, украинцев и белорусов были определены частоты трехлокусных гаплотипов (DRB1 - DQA1 - DQB1)
Распределение частот трехлокусных гаплотипов в исследованных популяциях показано в табл. 4.
Сравнительный анализ представленных данных выявляет наличие общих и индивидуальных особенностей распределения гаплотипов в каждой популяции.
Среди белорусских популяций определяется высокая частота гаплотипов: DRB1*11-DQA1*0501-DQB1*0301 и DRB1*15-DQA1*0102-DQB1*0602-8, а также DRB1*01-DQA1*0101-DQB1*0501.
В украинских популяциях отмечается высокие частоты гаплотипов DRB1*11-DQA1*0501-DQB1*0301 и DRB1*01-DQA1*0101-DQB1*0501, а также гаплотипа DRB1*07-DQA1*0201-DQB1*0201, а среди западных украинцев (Львовская область) выявлена высокая частота гаплотипа DRB1*04-DQA1*0301-DQB1*0302.
В русской популяции обнаружены высокие частоты гаплотипов: DRB1*01-DQA1*0101-DQB1*0501, DRB1*15-DQA1*0102-DQB1*0602-8, а также DRB1*04-DQA1*0301-DQB1*0302 и DRB1*07-DQA1*0201-DQB1*0201.
В среднем наблюдается однотипность частотного распределения трехлокусных гаплотипов DRB1-DQA1-DQB1 у всех представленных популяций. Отличительной особенностью является отсутствие или низкие частоты гаплотипов: DRB1*09-DQA1*0301-DQB1*0303 и DRB1*12-DQA1*0501-DQB1*0301, которые более характерны для монголоидной популяции.
Несмотря на определенную схожесть частотного распределения, в отдельных популяциях отмечается наличие гаплотипов, которые отсутствуют у других, например: в северной белорусской популяции (Витебская область) - DRB1*12-DQA1*0601-DQB1*0301, в полесской популяции (Брестская область) - DRB1*01-DQA1*0102-DQB1*0502/4, DRB1*03-DQA1*0501-DQB1*0301, в восточной украинской популяции (Хмельницкая область) - DRB1*11-DQA1*0103-DQB1*0602-8, DRB1*15-DQA1*0102-DQB1*0502/4, у западных украинцев (Львовская область) - DRB1*09-DQA1*0301-DQB1*0201, DRB1*14-DQA1*0101-DQB1*0501 и DRB1*14-DQA1*0101-DQB1*0502/4, в северной русской популяции (Вологодская область) - DRB1*04-DQA1*0301-DQB1*0305.
Таблица 4. Распределение трехлокусных гаплотипов в исследованных популяциях.
Гаплотипы DRB1-DQA1-DQB1 |
Белорусы север. (Вит. обл.) N=100 (%) |
Белорусы южн. (Брест. обл.) N=105 (%) |
Украинцы вост. (Хмел. обл.) N=137 (%) |
Украинцы запад. (Львов. обл.) N=102 (%) |
Русские
(Волог.обл.) N=121 (%) |
*01-0101-0501 |
10,0 |
10,0 |
9,5 |
12,2 |
12,4 |
*01-0102-0502/4 |
0,0 |
0,5 |
0,0 |
0,0 |
0,0 |
*03-0501-0201 |
7,0 |
8,7 |
5,5 |
7,8 |
7,0 |
*03-0501-0301 |
0,0 |
0,5 |
0,0 |
0,0 |
0,0 |
*04-0301-0201 |
0,0 |
0,5 |
0,4 |
0,0 |
0,0 |
*04-0301-0301 |
1,5 |
1,9 |
2,9 |
1,0 |
1,6 |
*04-0301-0302 |
5,5 |
9,5 |
7,3 |
10,3 |
11,6 |
*04-0301-0304 |
0,5 |
0,5 |
0,0 |
0,0 |
0,0 |
*04-0301-0305 |
0,0 |
0,0 |
0,0 |
0,0 |
0,8 |
*04-0301-0401/2 |
0,0 |
0,5 |
0,4 |
0,0 |
0,0 |
*07-0201-0201 |
7,5 |
7,6 |
12,4 |
11,3 |
10,7 |
*07-0201-0303 |
3,0 |
2,9 |
2,2 |
3,9 |
4,1 |
*08-0101-0401/2 |
0,0 |
0,0 |
0,4 |
0,0 |
0,0 |
*08-0301-0302 |
0,0 |
0,0 |
0,7 |
2,4 |
0,0 |
*08-0401-0401/2 |
4,0 |
2,9 |
2,5 |
2,0 |
5,0 |
*08-0601-0301 |
1,5 |
0,0 |
0,0 |
0,0 |
0,4 |
*09-0301-0201 |
0,0 |
0,0 |
0,0 |
0,5 |
0,0 |
*09-0301-0303 |
0,0 |
1,9 |
0,4 |
1,0 |
2,5 |
*10-0101-0501 |
0,0 |
0,5 |
1,1 |
0,0 |
0,4 |
*11-0103-0602-8 |
0,0 |
0,0 |
0,4 |
0,0 |
0,0 |
*11-0501-0301 |
15,0 |
13,3 |
18,2 |
18,6 |
9,1 |
*11-0501-0303 |
0,0 |
0,0 |
0,0 |
0,0 |
0,4 |
*12-0501-0301 |
3,5 |
3,8 |
2,2 |
0,5 |
1,2 |
*12-0601-0301 |
0,5 |
0,0 |
0,0 |
0,0 |
0,0 |
*13-0102-0602-8 |
7,0 |
0,9 |
2,2 |
2,4 |
2,5 |
*13-0103-0602-8 |
8,0 |
7,6 |
7,3 |
4,9 |
8,7 |
*13-0301-0301 |
0,0 |
0,0 |
0,0 |
0,0 |
0,4 |
*13-0501-0301 |
1,0 |
3,3 |
2,9 |
3,4 |
3,3 |
*14-0101-0501 |
0,0 |
0,0 |
0,0 |
0,5 |
0,0 |
*14-0101-0502/4 |
0,0 |
0,0 |
0,0 |
0,5 |
0,0 |
*14-0101-0503 |
1,0 |
2,9 |
2,2 |
1,0 |
1,2 |
*15-0102-0502/4 |
0,5 |
0,0 |
0,4 |
0,0 |
0,0 |
*15-0102-0602-8 |
16,5 |
11,4 |
8,8 |
9,3 |
14,0 |
*15-0103-0601 |
1,5 |
1,9 |
0,7 |
0,5 |
0,4 |
*16-0102-0502/4 |
5,0 |
6,7 |
8,8 |
5,9 |
1,6 |
Сравнение частоты трехлокусных гаплотипов в исследованных популяциях.
При попарном сравнении (0,05 и 0,01 уровни значимости) распределения трехлокусных гаплотипов (DRB1-DQA1-DQB1) между исследованными восточнославянскими популяциями было установлено, что достоверно различаются восточные украинцы из Хмельницкой области и русские из Вологодской области частотным содержанием следующих гаплотипов: DRB1*11-DQA1*0501-DQB1*0301 и DRB1*16-DQA1*0102-DQB1*0502/4.
Изучение распределения гаплотипических сочетаний показало, что наиболее информативным был сравнительный анализ трехлокусных гаплотипов. Исходя из этого, было бы целесообразным провести сравнение распределения трехлокусных гаплотипических сочетаний в исследованных популяциях с аналогичными данными из литературных источников. Однако данные по трехлокусным гаплотипам в доступной нам литературе практически не были представлены, поэтому в анализ были включены сведения о HLA–профиле некоторых популяций по локусу DRB1 как наиболее полиморфному из исследованных [Terasaki P.I., Gjertson D.W., 1997].
Результаты многомерного кластерного анализа изученных популяций в сравнении с некоторыми народами Европы выявили следующие особенности. Все популяции, представленные на дендрограмме (рис.2), образовали три кластера: «североевропейский», «центрально-европейский» и «южно-европейский». Русские из Вологодской области вошли в «североевропейский» кластер, наряду с немцами, датчанами, голландцами, финнами, ирландцами и англичанами. «Центрально-европейский» кластер включил в себя белорусов, чехов, бельгийцев, австрийцев, швейцарцев, французов, хорватов, украинцев, словаков и венгров. Внутри этого кластера в зависимости от генетической близости популяции распределяются следующим образом: белорусы (Витебская и Брестская области) составляют одну группу с чехами, бельгийцами, австрийцами и швейцарцами, украинцы (Хмельницкая и Львовская области) - со словаками и венграми. В «южно-европейский» кластер вошли болгары, греки и итальянцы.
Те же данные представлены в виде двухмерного графика многомерного шкалирования. (рис.3) Центральное место на графике занимают популяции, составляющие «центрально-европейский» кластер. Северные белорусы (Витебская область) несколько отдалены от основного «ядра» популяций, что, вероятно, обусловлено своеобразием указанной популяционной группы (возможным влиянием балтских племен) или недостаточным размером выборки, взятой для анализа.
С одной стороны к «центрально-европейскому» кластеру примыкают «североевропейские» популяции, из которых ближе всех к центру расположены русские из Вологодской области. Положение русских на графике свидетельствует о сочетании в генофонде указанной группы «североевропейских» и «среднеевропейских» генов. С другой стороны от «ядра» основных популяций расположились «южно-европейские» популяции: болгары, греки и итальянцы.
Подобную картину можно объяснить особенностями расселения и освоения земель древними славянами и историей формирования изученных популяционных групп.
Рис.2 Дендрограмма генетических расстояний на основании частот аллелей DRB1 локуса у представителей восточнославянских популяций и некоторых народов Европы
Рис 3. График многомерного шкалирования генетических расстояний на основе частот гена DRB1 у представителей восточнославянских популяций и некоторых народов Европы.
Бел. сев. – белорусы северные (Витебская область), Бел. южн. – белорусы Полесья (Брестская область), Укр. вост. – украинцы восточные (Хмельницкая область), Укр. зап. – украинцы западные (Львовская область), Рус. – русские (Вологодская область), Болг. - болгары, Хорв. – хорваты, Слов. – словаки, Венг. - венгры, Бельг. – бельгийцы, Австр. – австрийцы, Нем. – немцы, Франц. – французы, Датч. – датчане, Гол. – голландцы, Фин. – финны, Швейц. – швейцарцы, Ирлан. – ирландцы, Англ. – англичане, Итал. - итальянцы
Представленный в этой работе анализ полиморфизма аллелей генов HLA можно рассматривать как часть популяционных исследований, проводимых среди восточнославянских этносов: антропологические исследования, анализ митохондриальных и Y-хромосомных, а также других аутосомных маркеров ДНК. Наиболее полная информация по восточнославянским народам была получена в ходе нескольких антропологических экспедиций: «Русской антропологической экспедиции» (В.В. Бунак, 1965), «Украинской и Прибалтийской антропологических экспедиций» (Дьяченко, 1965, Витов, Чебоксаров, 1959). Для исследований были использованы следующие методы: оценка антропологических признаков (размеры головы и лица, показатели цвета волос и глаз, интенсивности роста бороды, форма носа), дерматоглифика, география фамилий и т.п. Ареал славянских народов находится в рамках той обширной зоны, которая разделяет ареалы северных и южных европеоидов, выделяющихся, в пределах европеоидной расы, максимально светлой и максимально темной пигментацией. Население этой переходной зоны отличается большим разнообразием локальных сочетаний антропологических признаков.
Принято объединять эти локальные варианты в две группы – западноевропейскую и центрально-восточноевропейскую. На территории Восточной Европы распространены, в основном, четыре расы: среднеевропейская, альпо-карпатская, индо-средиземноморская и лапоноидная. Каждая из них, за исключением лапоноидной, представителями которой являются саамы, представлена рядом антропологических типов. На крайнем востоке Европы у многих из этих типов проявляется древняя уралоидная примесь, которая может сочетаться с понтийским компонентом (характерным для южных европеоидов), а также - с относительно недавним влиянием южно-сибирской монголоидности.
На северо-западе Восточной Европы по побережью Балтики среднеевропейская раса включает атланто-балтийский компонент. В беломоро-балтийской зоне черты северных европеоидов сочетаются с определенным уралоидным компонентом. У восточнославянских народов наиболее заметно присутствуют черты среднеевропейской расы. На юго-западе расселения восточных славян присутствует заметное участие альпо-карпатского компонента. На юге и юго-востоке – понтийского, который может быть отмечен у болгар и албанцев, живущих на Украине; на востоке – субуральского, на севере – беломоро-балтийского [Алексеева Т.И., 1999].
В настоящее время широко используется относительно новый метод - геногеография, где для анализа используются генетически наследуемые мало полиморфные системы, в частности система ABO, некоторые биохимические маркеры. Информация о генофонде населения Восточной Европы содержит данные из литературных источников, опубликованных с 1985 по 1995 гг. Геногеография народонаселения способна напрямую связывать генетическую действительность современных поколений с древностью. В результате исследования было обнаружено, что из всех воздействий на генофонд за все время существования населения Восточной Европы главное формообразующее значение имели воздействия в направлении запад-восток. Они носили характер проникновения с запада – юго-запада и распространения по Восточной Европе генных комплексов европейского и балканского происхождения и их носителей – древних народов и племен. Население Восточной Европы постепенно и достаточно равномерно генетически становилось европейским, но эта генетическая «европеизация» не дошла до конца. Возникло некое равновесие между европейскими и азиатскими влияниями, возникло своего рода евразийское равновесное состояние генофонда народов Восточной Европы [Алексеева Т.И., 1999].
Несмотря на то, что типирование генов HLA – относительно новый подход, создающий новые возможности в оценке генетического профиля популяций, трудно сравнивать результаты, представленные в этой работе, с данными анализа других генетически наследуемых факторов, полученными в ходе многолетних исследований из-за разницы в количестве обследованных популяционных групп. Тем не менее, даже такое небольшое количество изученных популяций отражает основные закономерности геногеографического взаиморасположения исследованных восточнославянских групп. В результате этого можно заключить, что, несмотря на влияние естественного направленного отбора, система генов HLA сохраняет свое разнообразие, приуроченность различных вариантов её генов к определенным этническим группам и адекватно отражает геногеографию различных популяций, и, следовательно, может быть использована в популяционных исследованиях.
