2.2.4. Идеологически верная графика

Несмотря на своё разнообразие, графическая система в R построена на основе строгих правил. Выбор типа графика, основных цветов и символов для изображения точек, расположение подписей и т.д. был тщательно продумано создателями. Одним из ключевых для R исследований является книга Уильяма Кливленда «Элементы графической обработки данных». Многие его идеи были осуществлены именно в S-PLUS, а затем и в R. Например, Кливленд нашёл, что традиционные «столбчатые» графики очень плохо воспринимаются, особенно когда речь идёт о близких значениях данных, и предложил им на замену: «точечные диаграммы». Вот так они реализованы в R :

> dotchart(Titanic[,,"Adult","No"],

Рис. 2.3. Точечная диаграмма. График-решётка

+ main=’Погибшие␣на␣"Титанике"’)

Встроенная таблица данных Titanic — это четырёхмерная матрица, которая отражает статистику по возрастным группам, типу билета и полу. Особенно активно Кливленд (и далеко не только он) возражал против использования трёхмерных графиков и так называемых «пирогов». Поначалу «пирожных» графиков в R вовсе не было3, причём по принципиальным соображениям. Трёхмерных графиков в R и сейчас немного (правда, есть особый пакет rgl, который позволяет строить такие графики на базе OpenGL), а если Вы хотите узнать, как меняется поведение двух переменных по отношению к третьей, R предлагает так называемые «Trellis graphs» или графики-решётки:

> coplot(log(Volume) ~ log(Girth) | Height, data = trees)

При выполнении этой команды на рисунке отображается как зависит объём древесины от объёма кроны (в логарифмической шкале) у деревьев различной высоты. Действительно, такое представление гораздо эффективнее трёхмерного. Странно, что распространённые пакеты статобработки почти не используют графики-решётки, хотя их наличие неоднократно называлось одной из главных при- чин коммерческого успеха S-PLUS.

2.2.5. Интерактивность

Интерактивная графика позволяет выяснить, где именно на графике расположены нужные Вам точки и разместить объект (скажем, подпись) в нужное место, а также проследить «судьбу» одних и тех же точек на разных графиках. Кроме того, если данные многомерные, то можно вращать облако точек в плоскости разных переменных с тем чтобы выяснить структуру данных. Ещё несколько лет назад пришлось бы написать, что здесь вместо R следует воспользоваться другими аналитическими инструментами, но R развивается так быстро, что все эти методы теперь доступны, причём в нескольких вариантах. Например, так можно добавлять подписи в указанную мышкой область графика:

> plot(1:20)

> text(locator(), "Моя␣любимая␣точка", pos=4)

После того как введена вторая команда, надо щёлкнуть левой кнопкой мыши на выбранной точке в графике, а затем уже без разницы где щёлкнуть правой кнопкой мыши. Интерактивная графика других типов реализована командой identify(), а также пакетами rggobi, TeachingDemos и iplot.

2.3. Как сохранять результаты

Начинающие работу с R обычно просто копируют результаты работы (скажем, данные тестов) из консоли R в текстовый файл. И действительно, на первых порах этого может оказаться достаточно. Однако рано или поздно возникает необходимость сохранять объёмные объекты (например, таблицы данных), созданные в течении работы. Можно использовать уже упомянутый в начале статьи внутренний бинарный формат, но это не всегда удобно. Лучше всего сохранять таблицы данных в виде текстовых таблиц, которые потом можно будет открывать другими приложениями или текстовыми редакторами. Для этого служит команда write.table():

> write.table(file="trees.csv", trees, + row.names=F, sep=";", quote=F)

В текущую рабочую директорию будет записан файл trees.csv, образованный из встроенной в R таблицы данных trees. А что, если надо записать во внешний файл результаты выполнения команд? В этом случае используется команда sink():

> sink("1.txt", split=T)

> 2+2 [1] 4

> sink()

В этом случае во внешний файл запишется строчка «[1] 4», то есть результат выполнения команды. Сама команда записана не будет, а если хочется, чтобы она была записана, то придётся ввести что-то вроде:

> print("2+2") [1] "2+2"

> 2+2 [1] 4

то есть повторять каждую команду два раза. Для сохранения истории команд служит команда savehistory(), а для сохранения всех созданных объектов — save.image(). Последняя может оказаться также полезной для сохранения про- межуточных результатов работы, если не уверены в стабильности работы компьютера.