- •Тема 1.4 "Білки і нуклеїнові кислоти"
- •Принципи побудови природних амінокислот
- •Властивості амінокислот
- •2 Структура, властивості, класифікація білків
- •2.1. Структура білків
- •2.2. Властивості білків
- •2.3. Класифікація білків
- •2.2. Властивості білків
- •Класифікація білків
- •Нуклеїнові кислоти
- •Властивості днк
- •Будова днк
- •Будова і функції рнк
- •Вільні нуклеотиди
Властивості амінокислот
Амінокислоти – безбарвні, кристалічні речовини, переважна більшість яких добре розчинна у воді, важко розчинна в органічних розчинниках;
Амінокислоти – амфотерні сполуки, які містять дві протилежні за властивостями функціональні групи – карбоксильну та амінну. Амінокислоти у водних розчинах та кристалічному стані іонізуються, тобто існують у вигляді біполярних іонів (цвіттеріонів):
HOH
R
—CH
COOH R---CH----COO-
NH2 NH3+
Вцілому такі амінокислоти є електронейтральні.
У кислому середовищі дисоціація СООН-групи пригнічується, молекула амінокислоти набуває при цьому позитивного заряду і реагує як катіон.
У лужному середовищі, під дією іонів ОН-, іонізація аміногрупи пригнічується, молекула набуває негативного заряду, реагує як катіон.
Значення рН, при якому загальний сумарний заряд амінокислоти дорівнює нулю, має назву ізоелектричної точки. У цьому випадку молекула амінокислоти електронейтральна. Ступінь іонізації карбоксильних груп вища, ніж аміногруп, тому ізоелектрична точка моноамінокарбонових кислот знаходиться при рН = 6.
2 Структура, властивості, класифікація білків
2.1. Структура білків
2.2. Властивості білків
2.3. Класифікація білків
До складу білків входить в основному 20 різних альфа-амінокислот, які сполучені між собою у певній послідовності. У молекулі білка розрізняють такі типи зв’язків:
Білкова молекула характеризується наявністю міцних ковалентних і відносно слабких нековалентних зв'язків:
A) електостатична взаємодія Б) водневі зв'язки
B) взаємодія неполярних бічних ланцюгів, викликана виштовхуванням гідрофобних радикалів у "суху" зону молекулами розчинника
Г) дисульфідні зв'язки
Ковалентні зв'язки в молекулі білка можуть бути двох типів — пептидні та дисульфідні.
Пептидний, або кислотноамідний зв'язок (—СО—NH—) є типовим ковалентним зв'язком за допомогою якого амінокислотні залишки з'єднуються один з одним, утворюючи основу білкової молекули.
Утворена сполука називається пептидом, а зв'язок - пептидним. При сполученні двох амінокислот утворюється дипептид, трьох - трипептид, а багатьох - поліпептид. Пептидний зв'язок міцний, він піддається гідролізу тільки при тривалому кип'ятінні в кислому або лужному середовищі.
Дисульфідні зв’язки мають велике значення у формуванні третинної структури білків. Нестійкі до дії водню. Утворюється внаслідок відщеплення атомів Гідрогену від сульфідних груп двох амінокислотних залишків цистеїну:
Водневі зв’язки
Водневі зв'язки виникають в результаті дипольних взаємодій між ковалентно зв'язаним водневим атомом, що має позитивний заряд, і негативно зарядженим ковалентно зв'язаним атомом - акцептором.
У білків розрізняють чотири рівні структурної організації – первинну, вторинну, третинну й четвертинну.
Первинна: певна послідовність залишків альфа амінокислот у поліпептидних ланцюгах молекул білка.
В торинна: просторова конфігурація поліпептидного ланцюга – спосіб укладання поліпептидного ланцюга в просторі у вигляді α-спіралі або β-складчастого шару. Формується за рахунок утворення водневих зв’язків. Водневий зв'язок формується між аміно та карбоксильною групами, між групами –ОН, між пептидним зв’язком та групою –ОН:
-
С-
N- H……O -C-NH-
О ………… H O……H H-O
α-спіраль вторинної структури білка правообертальна, водневі зв’язки знаходяться паралельно осі спіралі
β-складчастий шар-поєднання декількох поліпептидних ланцюгів, водневі зв’язки між якими розташовані перпендикулярно осі шару:
Третинна: розміщення поліпептидного ланцюга у вигляді клубків (глобулярні білки) та ниток (фібрилярні) білки.
Ф
ібрилярний
білок
Глобулярний білок
Цю структуру формують дисульфідні ковалентні зв’язки, ковалентні складноефірні зв’язки:
Н 2С-СООН +ОН-СН- Н2О+Н2С-СООСН-
А також не ковалентні зв’язки:
А)гідрофобні – виникають завдяки міжмолекулярній взаємодії між гідрофобними радикалами. Намагаючись уникнути контакту з водою, ці радикали орієнтуються всередину молекули, що зумовлює її специфічну форму.
Б)Іонні – виникають між негативно зарядженими СОО- та позитивно зарядженими NH3+ групами.
В) водневі зв’язки.
Четвертинна: просторове розміщення декількох поліпептидних ланцюгів. Утворюється завдяки не ковалентним зв’язкам (гемоглобін, білки-ферменти)
