5) Получение чистых культур микроорганизмов.

В условиях естественного обитания чистые культуры микроорганиз­мов встречаются довольно редко. Тем не менее основная часть совре­менных представлений о свойствах микроорганизмов, а также их взаи­моотношениях получена при изучении чистых культур. Поэтому часто возникает необходимость выделить в виде чистых культур различные виды микроорганизмов, которые сосуществуют в естественных услови­ях. Получение накопительных культур представляет собой основной этап процесса, который позволяет получить чистые культуры. Оно также дает возможность оценить различные воздействия факторов окружающей среды на смешанную микробную популяцию, благодаря которым может проис­ходить отбор микроорганизмов, способных взаимодействовать со специ­фическими субстратами или хорошо расти в необычных условиях.

Выделение чистой культуры данного микроорганизма будет успеш­ным, если он присутствует в смешанной популяции в достаточно высо­кой концентрации, т. е. количественно преобладает. Разработанные ме­тоды накопления имеют целью добиться увеличения относительного ко­личества данного организма благодаря созданию лучших условий для его роста и выживания по сравнению с другими или путем пространст­венного отделения его от других членов популяции.

К физическим методам накопления следует относить регуляцию рос­та температурой, тепловую и ультразвуковую обработку, ультрафиоле­товое облучение, приводящие к гибели или подавлению роста других ор­ганизмов, присутствующих в популяции, но существенно не затраги­вающих выделяемые клетки. Можно также использовать преимущества в некоторых физических свойствах изучаемого микроорганизма, таких как его размеры и подвижность; это позволяет в значительной мере отделить данный организм от других в популяции.

В основе действия химических методов лежит использование токсич­ных веществ, которые подавляют рост оставшейся части популяции, не оказывая влияния на выделяемый микроорганизм. Кроме того, это могут быть вещества, служащие источниками питания, используемыми пре­имущественно отдельными микроорганизмами в смешанной популяции.

Как правило, накопительные культуры получают в закрытых систе­мах, т. е. микроорганизмы выращивают в обычных периодических (ста­ционарных) условиях на чашках Петри, в колбах или пробирках, где в среде культивирования концентрация питательных веществ и продуктов метаболизма постоянно изменяется в процессе роста клеток. Для полу­чения накопительных культур используются также открытые хемостатные системы, позволяющие контролировать концентрацию питательных веществ, лимитирующих рост клеток, что, в свою очередь, может изби­рательно влиять на скорость роста различных организмов в смешанной культуре, в результате чего какой-то микроорганизм начинает количест­венно преобладать.

Из накопительных культур бактерии обычно выделяют путем их про­странственного отделения от других форм на твердой среде, где они рас­тут в виде колоний. Для микроорганизмов, не растущих на твердых сре­дах, можно использовать метод предельного разведения, последователь­но перенося клетки в отдельные пробирки с жидкой средой. Поскольку обычные методы выделения не дают абсолютной гарантии чистоты по­лучаемых культур, некоторые исследователи применяют более сложные приемы, с помощью которых отдельную бактериальную клетку выделя­ют из смешанной популяции, используя для получения клона микроско­пический контроль.

Для выделения микроорганизмов в виде чистых культур известно сравнительно мало методов. Чаще всего используют способ изолирова­ния отдельных клеток на твердой питательной среде, применяя при этом метод посева штрихом или разлива по чашкам небольшого количества жидкой культуры (метод предельных разведений). Однако получение от­дельной колонии не всегда гарантирует чистоту культуры, поскольку ко­лонии могут вырасти не только из отдельных клеток, но и из их скопле­ний.