39. Каким образом рнк-полимераза регулирует процесс транскрипции согласно модели иванова-флорентьева ?

- РНК-полимераза ползёт по В-форме ДНК (обычная форма хеликса) и в месте контакта с ДНК переводит её в А-форму ДНК, что позволяет 2 или 3 азотистым основаниям легко "выворачиваться наружу" и образовывать комплементарные

пары с нуклеотидами, образуя нить РНК;

- РНК-полимераза реагирует на образование верной комплиментарной пары (дезоксирибонуклеотид матричной нити ДНК и рибонуклеозид 3'-фосфат) и если пара комплиментарно правильная РНК-полимераза изменяет свою конформацию и присоединяет этот нуклеотид к нити РНК;

- выделяющийся ПИРОФОСФАТ идет на передвижение фермента по матрице;

- освободившийся от РНК-полимеразы участок ДНК вновь превращается в В-

форму

40. Дайте определение процессу ТЕРМИНАЦИИ траскрипции

ТЕРМИНАЦИИ траскрипции - это:

- завершение синтеза РНК-полимеразой нити РНК по матрице ДНК (завершение

ЭЛОНГАЦИИ;

- отделение фермента (РНК-полимеразы) от нити РНК;

- отделение фермента (РНК-полимеразы) от матрицы ДНК

41. Из каких стадий состоит процесс ТЕРМИНАЦИИ транскрипции ?

ТЕРМИНАЦИИ транскрипции состоит из:

- завершение ЭЛОНГАЦИИ

- высвобождение нити РНК из комплекса

- отделение РНК-полимеразы

42. Поясните что такое неспецифическая ТЕРМИНАЦИЯ транскрипции ?

Неспецифическая ТЕРМИНАЦИЯ транскрипции происходит без участия специфического ТЕРМИНАТОРА при превышении длины синтезируемой молекулы РНК 200-250 нуклеотидов:

43. Поясните условия протекания независимая от РО-фактора специфическая ТЕРМИНАЦИЯ транскрипции ?

Независимая от РО-фактора специфическая ТЕРМИНАЦИЯ транскрипции происходит на ТЕРМИНАТОРЕ без участия РО-фактора при этом:

- для узнавания терминатора требуется определённая молярность ДНК в растворе (не менее 0,2-0,3 моля);

44. Поясните условия протекания зависимая от РО-фактора специфическая ТЕРМИНАЦИЯ транскрипции ?

Зависимая от РО-фактора специфическая ТЕРМИНАЦИЯ транскрипции происходит на ТЕРМИНАТОРЕ с участием РО-фактора при этом:

- РО-фактор взаимодействует не с терминатором, а с РНК-полимеразой, находящейся на терминаторе;

- взаимодействие РО-фактора с РНК-полимеразой облегчает узнавание последовательности нуклеотидов ТЕРМИНАТОРА и предшествующих ему участков

45. Какую структуру имеет ТЕРМИНАТОР ?

Сравнение строения 20 терминационных последовательностей у самых популярных бактерий показало, что это:

1 - терминатор – это инвертированный повтор (палиндром)

2 - перед сайтом терминации имеется ГЦ-богатый участок (от 3 до 11 пар), на

котором РНК-полимераща меняет конформацию и готовится к прекращению

синтеза

3 - на конце многих нитей РНК содержится последовательность УУУУУУ –

следовательно на конце ДНК перед терминатором в конце транскрипта должна

быть последовательность АААААА

Участие ро-фактора в терминации

Часть терминаторов узнается РНК-полимеразой только с помощью белкового фактора терминации - ро-фактора. Этот белок с молекулярной массой 46 кДа образует гексамер (6 по 46 кДа), способный связываться с областью терминатора.

Установлено, что он присоединяется к РНК-продукту непосредственно перед

терминатором.

Ро-фактор обладает NТРазной (нуклеозидтрифосфатазной) активностью, и катализируемая им реакция гидролиза нуклеозидтрифосфатов (NTP) ведет к высвобождению энергии, которая влияет на его конформацию.

Изменение конформации ро-фактора, вероятно, способствует вытеснению РНК или РНК-полимеразы из транскрипционного комплекса.