- •1. Наука вирусология
- •1.1 Развитие учения о вирусах
- •1.2 Вирусология как биологическая наука
- •1.3 Связь вирусологии с другими биологическими науками
- •1.4 Природа вирусов
- •1.5 Основные группы вирусов
- •2. Химический состав и физическая структура вирусов
- •2.1 Химический состав вирусов
- •2.2.1 Вирусные днк
- •2.2.2 Вирусные рнк
- •2.2 Вирусные нуклеиновые кислоты
- •2.3 Вирусные белки
- •2.4 Вирусные липиды
- •2.5 Вирусные углеводы
- •2.6 Структура вирусов
- •2.6.1 Вирусы с кубическим типом симметрии
- •2.6.2 Вирусы со спиральным типом симметрии (с трубчатым нуклекапсидом)
- •2.6.3 Взаимное расположение нуклеиновой кислоты и капсомеров
- •2.7 Вирусные липопротеидные оболочки
- •2.8 Структура фагов
- •3. Классификация вирусов
- •3.1 Номенклатура вирусов.
- •3.2 Критерии систематики вирусов
- •3.3. Краткая характеристика основных структур и свойств днк-вирусов
- •3.4 Семейства, роды и виды рнк-вирусов
- •3.5 Краткая характеристика основных структур и свойств классифицированных семейств рнк-вирусов
- •3.6 Порядки
- •4. Репродукция вирусов
- •4.1 Общее представление о репродукции вирусов
- •4.2 Первая фаза репродукции
- •4.2.1 Адсорбция вирионов на поверхности клетки
- •4.2.2 Проникновение вирусов в клетку
- •4.2.3 Раздевание вируса в клетке
- •4.3 Вторая фаза репродукции
- •4.3.1 Транскрипция
- •4.3.2 Трансляция информационных рнк
- •4.3.3 Репликация генома вирусов
- •4.3.4 Синтез вирусных белков
- •4.3.5 Сборка вирионов
- •4.3.6 Выход вирусных частиц из клетки
- •5. Взаимодействие вируса с клеткой
- •5.1. Типы взаимодействия вируса с клеткой
- •5.2 Реакция клетки на вирусную инфекцию
- •5.3 Влияние вирусов на хромосомный аппарат клетки
- •6. Генетика вирусов
- •6.1 Структурная организация генома клетки
- •6.2 Структурная организация генома вируса
- •6.3 Наследственность у вирусов
- •6.4 Мутации у вирусов
- •6.4.1 Спонтанные мутации
- •6.4.2 Индуцированные мутации
- •6.5 Репарации
- •6.6 Генетические и негенетические взаимодействия вирусов
- •7. О природе происхождении вирусов. Прионы
- •7.1 Теории происхождение вирусов
- •7.2 Прионы
- •7.3 Виройды
- •8. Противовирусный иммунитет
- •8.1 Естественная видовая резистентность
- •8.2 Неспецифические клеточные и общефизиологические реакции в противовирусном иммунитете
- •8.3 Роль фагоцитоза в противовирусном иммунитете
- •8.4 Интерферон
- •9. Библиографический список
1.2 Вирусология как биологическая наука
Вирусология по праву стала теперь одной из основные биологических наук. Подобно тому, как в начале нашего века из некоторой важной, но чисто практической области возникла микробиология как одна из отраслей биологии, так и в середине прошлого века вирусология превратилась в определенную совокупность знаний и концепции со своими собственными перспективами и путями развития. Возникнув вначале как ветвь патологии — патологии человека и животных, с одной стороны, и фитопатологии — с другой,— вирусология достигла того уровня, когда ее прогресс определяется логикой внутреннего развития в той же мере, как и требованиями практики.
Основным стимулом к становлению вирусологии явилось накопление знаний о вирусах бактерий, или бактериофагах, и объединение изучения бактериофагов с генетикой бактерий. Вирусологи, занимающиеся изучением вирусов животных и растений, при решении различных вирусологических проблем пытались использовать методы работы с фагами и концепции, возникшие при исследовании этих объектов. Это способствовало облегчению контактов между вирусологами, которые стали более плодотворными, доказательством чему служит преуспевание журнала «Virology», основанного в 1955 г.
В это же время возникла новая отрасль биологии — молекулярная биология, изучающая свойства, функции и организацию биологических макромолекул. Вирусология стала составной частью молекулярной биологии, поскольку она изучает субклеточные объекты - вирусы, структура и организация которых лежат на макромолекулярном уровне.
Что представляет собой вирусология сегодня? Основные биологические науки можно классифицировать в соответствии с природой изучаемого ими предмета как описательные, интегративные и редукционистские науки. Описательные науки, такие, например, как ботаника, микология, энтомология, ихтиология, характеризуются тем, что изучаемый ими предмет представляет собой группу организмов, образующих определенную таксономическую единицу, т. е. имеющих общее происхождение и историческое развитие. Интегративные науки — физиология, экология, генетика — анализируют общие или специализированные свойства живых организмов в их динамических связях и превращениях. Редукционистские науки, как, например, биохимия и биофизика, изучают элементарные процессы и функции организмов на уровне молекул, атомов, электронов, представляющих собой мельчайшие единицы материи.
Отнести вирусологию к одному из трех приведенных выше подразделений, на которые можно классифицировать биологические науки, непросто. Чтобы определить предмет, который изучает вирусология, т. е. вирусы, нельзя пользоваться теми обычными критериями, которые мы применяем для определения животных или растений. Само по себе определение вируса несколько произвольно, и было предложено много вариантов, что доказывает сложность задачи.
Львов предложил определять вирусы как «строго внутриклеточные, потенциально патогенные агенты, обладающие инфекционной фазой, содержащие лишь один тип нуклеиновой кислоты, репродуцирующиеся в форме генетического материала, неспособные к росту и делению и лишенные системы Липмана» (т. е. одной из ферментных систем, участвующих в производстве энергии). Это определение, подчеркивает неклеточную природу вирусов, их зависимость от метаболизма клетки-хозяина и тот факт, что на определенной стадии цикла репродукции специфический материал вируса представлен одной только нуклеиновой кислотой.
Согласно другому определению, вирусы рассматриваются как «элементы генетического материала, которые могут детерминировать в клетках, где они репродуцируются, биосинтез специфического аппарата, обеспечивающего их проникновение в другие клетки». Это определение подчеркивает в большей степени способность вирусов распространяться из клетки в клетку, нежели отсутствие у них собственной метаболической активности.
В настоящее время наиболее приемлемым является следующее определение: «Вирусы — это объекты, геном которых представлен нуклеиновой кислотой — ДНК или РНК; эта нуклеиновая кислота репродуцируется в живых клетках и, используя их синтетический аппарат, заставляет клетки синтезировать специализированные частицы, или вирионы, содержащие геном вируса и способные передавать его в другие клетки». Все эти определения отражают два качества вирусов: во-первых, наличие у вируса собственного генетического материала, который внутри клетки-хозяина ведет себя как часть данной клетки, и, во-вторых, существование внеклеточной инфекционной фазы, представленной специализированными частицами, или вирионами, которые репродуцируются в клетке под генетическим контролем данного вируса и служат для введения генома вируса в другие клетки. Предложенные определения отличаются друг от друга тем, какое место в них отводится другим свойствам вирусов, таким, например, как субмикроскопические размеры вирусных частиц, (подразумевая под субмикроскопическими размерами размеры менее 2000 А, что находится на пределе разрешения обычного светового микроскопа) или патогенность— свойство вируса, без которого невозможно установить его присутствие в клетке - хозяина. Патогенность вирусов может быть либо явной, когда инфицированные клетки и организмы изменяются или разрушаются, либо скрытой, когда клетки сосуществуют с геномом вируса на протяжении многих поколений без заметного фенотипического проявления. Все же вирус должен, в конце концов, вызвать изменение в синтетических процессах клетки, результатом которого будет образование инфекционных вирусных частиц, или вирионов.
Внутриклеточный паразитизм свойствен не только вирусам, но и другим классам паразитов, в том числе некоторым бактериям, грибам и простейшим. Однако в определениях вирусов подчеркивается особая природа их паразитизма, который можно назвать паразитизмом на генетическом уровне. Такие паразиты, как малярийный плазмодий, бациллы проказы, риккетсии, имеют клеточную организацию — хромосомные гены, рибосомный аппарат и митохондриальный аппарат или эквивалент последнего с более или менее сложными системами для освобождения и утилизации энергии. Очевидно, что эти паразиты являются клеточными организмами независимо от того, устроены ли они по принципу эукариотических клеток, т. с. клеток животных и растений, для которых характерно наличие набора хромосом и полностью развитой системы внутриклеточных мембран, либо по принципу прокариотических клеток, подобных бактериальным. Тот факт, что эти организмы способны выживать и размножаться только внутри других клеток, объясняется не отсутствием собственной клеточной организации, а их потребностью в поступлении «готовых» (экзогенных) источников питания.
Долгое время к вирусам относили группу внутриклеточных патогенных агентов, таких, например, как возбудители пситтакоза, венерической лимфогранулемы и других сходных болезней. В настоящее время эти возбудители классифицируются как Chlamydozoaceae, а по самой последней классификации как род Miyagawanella (в составе класса риккетсий). К вирусам их нельзя относить по двум причинам: они содержат два типа нуклеиновой кислоты, что предполагает наличие у них клеточной организации, и они сохраняют эту организацию внутри клетки, где они растут, т. е. увеличиваются в размерах и размножаются делением надвое.
Репликация вирусов находится в строгой зависимости от клетки-хозяина. Этим они отличаются от субмикроскопических, но свободно живущих организмов, таких, как Mycoplasma, которые обладают клеточной организацией и, являясь бактериями, лишенными жесткой клеточной стенки. Зависимость Mycoplasma практически от всех метаболитов, которые могут проникать через полупроницаемую мембрану, привела к крайнему сокращению их генома, ферментного аппарата, клеточных структур и соответствующему уменьшению их размеров. Образование так называемых L-форм, которые представляют собой обычные бактерии, утратившие в результате мутаций способность образовывать клеточную стенку, возможно, следует рассматривать как модель того процесса, который привел к появлению Mycoplasma.
Специфичность круга хозяев у вирусов является дополнительным доказательством того, что отношение вирус — хозяин не ограничивается лишь питанием, а носит более сложный характер. Если бы нашелся такой внутриклеточный паразит, который, будучи неспособен размножаться в свободном состоянии, тем не менее, мог бы размножаться в живых клетках любого типа, то мы вправе были бы допустить, что этот паразит будет размножаться и в свободном состоянии, если только он получит какие-то пока еще не известные нам (возможно, нестойкие) вещества, которые обычно ему поставляет клетка. Позднее мы увидим, однако, что взаимоотношения вирусов с клеткой-хозяином очень сложны; ожидать, что вирус будет размножаться в свободном состоянии, можно только в том случае, если нам удастся выделить из клетки и реконструировать in vitro клеточный аппарат, необходимый для того, чтобы макромолекулярные синтезы протекали упорядоченным образом.
Размеры частиц — вопрос, который мы будем детально обсуждать ниже, — являются недостаточным критерием для отнесения исследуемых частиц к категории вирусов. Это становится очевидным, если мы сопоставим эти размеры, с одной стороны, с мельчайшими клетками Мусоplasma (диаметр — 100 ммк, т. е. меньше, чем у самых больших вирусов) и, с другой, например, с молекулами гемоцианина (молекулярный вес 3- 106 дальтон — величина, сравнимая с массой достаточно мелкого бактериофага).
Возможно, в растительных и животных клетках могли бы образовываться вирусные частицы диаметром в несколько микронов. Но именно малые размеры вирусов сыграли в свое время важную роль в создании соответствующих вирусологических методов. С самого зарождения вирусологии для отделения инфекционных вирусных частиц от бактерий (загрязняющих препарат вируса) и для доказательства небактериальной природы изучаемых заболеваний использовались бактериальные фильтры. Отсюда и традиционное название фильтрующийся вирус, заменившее прежнее ультравирус, а затем в свою очередь замененное общепринятым в настоящее время словом вирус.
