Папа и сын

С очередной попыткой создать технику быстрого чтения ДНК недавно познакомил своих читателей журнал „Nature“ (2005, т. 437, с .376–380).Новый метод секвенирования описали несколько десятков авторов под руководством Марселя Маргулиса и Майкла Эгхольма (Marcel Margoulies, Michael Egholm) из „454 Life Science Corporation“ в Коннектикуте. (Кроме этой компании, в работе участвовали Калифорнийский университет, Рокфеллеровский университет и Ротберговский институт детских болезней.)

Имя Джонатана М. Ротберга в списке авторов стоит последним, тем не менее новый метод уже называют „секвенированием по Ротбергу“.И не просто так. Основатель корпорации „CuraGen“, одной из ведущих компаний в области фармакогенетики, знаменит не только научными достижениями, но и тем, что регулярно попадает в списки самых молодых среди богатых и самых богатых среди молодых жителей планеты — сейчас ему чуть больше сорока лет. Однако разработка супербыстрого секвенирования была для него не только перспективным вкладом денежных средств.

Такие трогательные истории чаще происходят в голливудовских научно-фантастических фильмах, но иногда случаются и в жизни. Шесть лет назад у Ротберга родился сын — и сразу же попал в отделение интенсивной терапии: мальчик не мог самостоятельно дышать. Отец не спал ночей от беспокойства, подозревая у ребёнка генетическую болезнь. Молодые папы вообще склонны к панике, но доходы Ротберга позволяли ему паниковать с размахом. Он пообещал себе, что расшифрует весь геном сына.

Обещания обещаниями, но после проекта „Геном человека“ всем известно, что это удовольствие стоит миллиарды долларов и занимает десятки лет. Столько Ротберг не мог ждать. Он основал „454 Life Science Corp.“ и поставил перед ней задачу: создать такой метод чтения ДНК, какого ещё не бывало. Чтобы немедленно и за реальные деньги — ну хотя бы миллионы, а не миллиарды…

Немедленно не получилось: понадобились годы. К счастью, здоровье Ротберга-младшего давно не внушает никаких опасений. Будет ли папа секвенировать его геном, неизвестно. Но в принципе такая возможность теперь есть.

С помощью нового метода можно прочесть 25 миллионов пар оснований (это весь геном низшего гриба) за четыре часа, а три миллиарда нуклеотидов, составляющих геном человека, — за сто дней, стоимость же такого проекта, по предварительным оценкам, составит всего-то около десяти тысяч долларов. Причём, в отличие от метода Сэнгера, для каждой реакции требуются не микролитры, а пиколитры раствора матрицы. Фактически дальше речь пойдёт об отдельных молекулах!

Джеймс Уотсон, один из первооткрывателей двойной спирали, уже пообещал предоставить умельцам из Коннектикута образец своей крови, чтобы они подарили его генотип мировой науке и истории. (Не хуже, чем завещать собственный мозг родному институту! Даже интереснее, потому что даритель может сам поучаствовать в исследовании препарата…) О новом методе одобрительно отозвался и Дж. Крэйг Вентер — ещё один гигант молекулярной генетики, основатель института своего имени, президент знаменитой „Celera Genomics“ (его статья, написанная совместно с Ю–Ху Роджерс, научным директором технологического центра при Институте Крэйга Вентера, опубликована в том же номере„Nature“). В Институте Крэйга Вентера тестировали новый метод секвенирования, так что слово двух этих учёных дорогого стоит. Не забыли они, впрочем, и указать на некоторые недостатки. Но сначала — о приятном.