- •В. В. Ревин г. В. Максимов о. Р. Кольс биофизика
- •Введение
- •Глава 1
- •Основные структуры и органеллы клетки
- •Основные типы клеток
- •Клетки животных
- •Клетки растений
- •Метод флуоресцентных зондов
- •1.3. Методы исследования клеток
- •Метод электронной микроскопии
- •Метод восстановленной флуоресценции после фотоотбеливания
- •Метод конфокальной лазерной сканирующей микроскопии
- •Метод спектроскопии комбинационного рассеяния
- •Микроспектроскопия комбинационного рассеяния
- •Метод динамической фазовой микроскопии
- •Глава 2 биологические мембраны
- •Методы исследования биологических мембран
- •Выделение и характеристика мембранных фракций
- •Исследование структурной организации мембран
- •2.2. Состав и структура биологической мембраны
- •Мембранные липиды
- •Фазовые переходы в липидном бислое
- •Мембранные белки
- •2.3. Плазматическая мембрана
- •Глава 3 основные функции клетки
- •Проницаемость и транспорт веществ в биологических мембранах
- •Методы изучения проницаемости
- •Пассивный и активный транспорт веществ через мембрану
- •Пассивный транспорт
- •Диффузия
- •Осмос и фильтрация
- •2. Активный транспорт
- •Хемиосмотическая теория Митчелла
- •Биоэлектрические явления
- •3.2.1. Физико-химические основы возникновения биопотенциалов
- •1.1. Физико-химические процессы формирования мембранного потенциала
- •1.2. Потенциал покоя
- •3.2.1.3. Потенциал действия
- •Полный цикл потенциала действия
- •Характеристика потенциала действии в нераах холоднокровных и теплокронных животных, мс
- •3.2.2. Распространение возбуждения
- •Проведение потенциалов действия (теория местных токов)
- •Ионный канал
- •Физические принципы при моделировании транспорта иона через канал
- •Поверхностный потенциал клеточной мембраны
- •Воротные механизмы в ионных каналах
- •Потенциалзависимые каналы
- •Потенциалзависимый натриевый канал
- •Сенсор Жидкая липидная мембрана
- •Потенциалзависимый калиевый канал
- •Потенциалзависимый кальциевый канал
- •Синтез ионных каналов
- •Энергообеспечение проведения возбуждения
- •Клеточная рецепция
- •Клеточная гормональная рецепция
- •Клеточная фоторецепция
- •Фотосинтез
- •Клеточная подвижность
- •Мышечное сокращение
- •Модель скользящих нитей
- •Элементарный акт мышечного сокращения
- •3.4.1.3. Рабочий цикл актомиозинового комплекса
- •Клеточные механизмы иммунитета
- •Сверхслабое свечение клеток
- •Глава 4 клеточная и мембранная патология
- •Перекисное окисление липидов
- •Гипертония
- •Сахарный диабет
- •Демиелинизация
- •Апоптоз
- •Справочный материал
Клеточные механизмы иммунитета
Проникновение микробов в ткани, их размножение служат сигналом к мобилизации защитных клеток. Каким образом защитные клетки, циркулирующие в крови или осевшие в органах и тканях иммунной системы, отдаленные от «входных ворот» инфекции, получают сигнал об опасности? Этот процесс осуществляется с помощью семейства молекул, получивших название цитокинов (греч. kytos — «клетка», kinetikos — «связанный с движением»). Данные молекулы являются переносчиками сигнала от клетки к клетке. В геноме клетки имеются специальные гены, ответственные за синтез определенных цитокинов. До поры они находятся в «неактивном» состоянии, но после получения сигнала о проникновении микробов-паразитов активизируются. С них считывается информация о структуре соответствующих белков, затем осуществляется их синтез, и готовые молекулы цитокинов начинают выделяться (секретироваться) клеткой в окружающую среду. Для восприятия и распознавания различных сигналов клетки несут на своей поверхности рецепторы, специфические для каждого цитокина. Таким образом, цитокины, являясь единицами своеобразного языка межклеточного общения, позволяют клеткам общаться, взаимодействовать, объединяя свои усилия в борьбе с микробами-паразитами (рис. 3.44).
Рис.
3.44. Продукция и рецепция цитокинов. На
поверхности бактерии-паразита
имеется сигнальная молекула (ЛПС),
которая распознается специальным
рецептором на поверхности макрофага.
От рецептора идет сигнал к активации
гена, ответственного за синтез
интерлейкина-1 (ИЛ-1), начинаются синтез
этой молекулы и ее секреция. Другой
макрофаг несет рецептор для ИЛ-1, через
который идет сигнал к его гену,
ответственному за синтез фактора
некроза опухолей (ФИО), и запускаются
синтез и секреция этого цитокина
Рассмотрим, как складываются такие межклеточные взаимоотношения, па примере макрофагов и Т-лимфоцитов. На поверхности макрофагов находятся молекулы-рецепторы, которые связываются с токсинами, выработанными микробами-паразитами. Распознавание токсина приводит к движению макрофага в область проникновения микробов. В очаге инфекции макрофаги осуществляют фагоцитоз микробов. Действие токсинов активирует многие гены макрофага и стимулирует производство цитокинов, таких, как ИЛ-1, которые с током крови попадают в мозг и действуют на центр терморегуляции. В результате повышается температура тела, т. е. запускается один из механизмов защиты организма, так как многие микробы снижают скорость размножения при повышении температуры. Те же молекулы ИЛ-1, действуя через соответствующие рецепторы, передают сигнал на лимфоциты, и запускается расширенный иммунный ответ. ИЛ-1 способен запускать каскад продукции других цитокинов, получивших название ИЛ-2,-3,-4 и т. д., которые находят соответствующие рецепторы на Т-, В-лимфо- цитах и других клетках, передавая им сигналы, активирующие их отдельные функции. Хотя иммунный ответ запускает макрофаг, только лимфоциты обладают рецепторами для распознавания чужеродных молекул — антигенов — и могут обеспечить иммунный ответ. От клеточной мембраны Т-лимфоцита к ядру идут одновременно два типа сигнала: от антигенраспознающего рецептора и от рецептора, связавшего ИЛ-1. При таком комплексном воздействии в геноме Т-лимфоцитов активируются гены не только самого ИЛ-2, но и рецепторов, специфичных к нему. Затем синтезированный в Т-лимфоците ИЛ-2 начинает действовать на произведшие его клетки, в них активируется процесс деления, и за счет этого усиливается функция клеточной популяции Т-лимфоцитов.
КЛЕТОЧНЫЕ МЕХАНИЗМЫ ПЕРЕСТРОЙКИ БЕЛКОВ
Известно, что нативная, трехмерная структура белка устанавливается в результате действия целого ряда энергетических и энтропийных факторов. Характерные времена многих внутримолекулярных изменений, в том числе и ферментативных процессов, не превышают 10-2 —
3 с и зависят от pH, температуры и ионного состава среды. Таким образом, изменения ионного гомеостаза могут непосредственно влиять на структурные изменения в клеточных белках и соответственно на их функции и активность. Рассмотрим в качестве примера конформационные перестройки белков, переносящих кислород, — гемоглобина и миоглобина. Строение этих белков, находящихся в кристаллической форме, детально изучено методом рентгеноструктурного анализа. Пространство между а-спиральными участками, в том числе полость активного центра гемовой группы внутри молекул белка, заполнено гидрофобными боковыми цепями аминокислот, а в окружающую водную среду выступает множество полярных белковых цепей. Молекула гемоглобина состоит из четырех субъединиц (две а и две Р), образующих правильный тетрамер. Молекулы воды, локализованные в области контактов субъединиц, образуют солевые мостики и дополнительно стабилизируют тетрамер. Железо может находиться в высоко- и пиз- коспиновом состоянии в зависимости от способа заполнения d- орбитали электронами, который определяется правилами Хунда. В связи с этим заполнение электронами внешних d-орбиталей ионов двух- и трехвалентного железа характерно для свободных ионов или ионов в составе соединений с ионной связью. Ситуация меняется, когда атомы железа находятся в комплексе, где связаны лигандными атомами ковалентной связью и входят в состав гема. Следует подчеркнуть, что спиновое состояние центрального атома в комплексе определяется характером лигандного окружения: симметрией, силой связывания лигандов в комплексе и т. д. В силу этого изменения в лигандном окружении могут приводить к изменениям в спиновом состоянии иона металла, что в свою очередь может вызвать изменения конформации белка, с которым связан ион металла. Изменения спинового состояния ионов железа, индуцированные присоединением субстратов, сменой температуры, были продемонстрированы для ряда гемопротеинов. Переход иона железа из низкоспинового состояния в высокоспиновое увеличивает диаметр иона и приводит к выходу его из плоскости гема, что обусловливает и конформационные изменения в ближайшем «белковом» окружении гема.
В высокоспиновом состоянии Fe2+ обладает координационным числом 5 и расположен вне плоскости гема на расстоянии 0,05 — 0,07 нм. Он координационно связан с четырьмя атомами азота пирролыгых групп плоского порфиринового кольца, а в 5-м положении взаимодействует с атомом N имидазольного кольца гистидина. Оксигенация и образование связи кислород — железо не меняют валентности атома железа, но переводят его из высокоспинового состояния в низкоспино- вое, увеличивая число лигандов в координационной сфере до 6. В б-м положении железо координируется с кислородом или другими лигандами.
Присоединение кислорода индуцирует ряд конформационных изменений в молекуле гемоглобина. Связывание кислорода с переводом атома железа в пизкоспиновое состояние сопровождается одновременным смещением железа на 0,07 нм в плоскость гемовой группы. Это смещение передается через гистидин, и спираль вместе с ним «подтягивается» в сторону гема к центру молекулы, выталкивая из полости остаток тирозина. Затем происходят поэтапный разрыв солевых мостиков между а-субъединицами и смещение их вдоль области контакта. Расстояние между гемом и а-субъединицами увеличивается, а между гемом и Р-субъединицами, наоборот, сокращается. Центральная полость гема при этом сжимается. Разрыв шести солевых мостиков и освобождение протонов (эффект Бора) характерны для этих конформационных изменений гемоглобина. В целом оксигенация переводит каждую из субъединиц из дезокси- в оксиконформацию. Разрыв четырех солевых мостиков из шести при оксигенации первых двух а-субъе- диниц способствует разрыву двух остальных мостиков и, следовательно, облегчает соединение следующих молекул кислорода с остальными субъединицами, увеличивая сродство их к кислороду в несколько сотен раз. В этом и состоит кооперативный характер присоединения кислорода к гемоглобину, при котором начало оксигенации последнего облегчает связывание остальных молекул кислорода.
Использование лазерного излучения с длиной волны поглощения в диапазоне ^-полосы порфирина и вблизи нее позволяет регистрировать спектры РКР протопорфиринов в целых клетках (эритроцитах). В этих спектрах доминируют линии, лежащие в области 1 ООО — 1 650 см-1, которые обусловлены плоскостными колебаниями связей С — С и С—N и деформационными колебаниями С — Н. Некоторые из них подвержены влиянию химических превращений, происходящих с атомом железа, и могут быть использованы для изучения структуры макроцикла. При изменении состояния окисления атома железа от Fe(III) к Fe(II) наблюдается снижение частоты некоторых скелетных колебаний порфирина. Положение этой и других характерных полос спектра РКР отражает заселенность электронами л-орбиталей порфирина. С ее увеличением связи в порфирине становятся менее прочными, что выражается в снижении частоты колебаний. Заселенность л-орбиталей порфирина возрастает за счет обратного перехода электронов с л-орбиталей атома железа. Поскольку процесс сильнее выражен для Fe (II), чем для Fe (III), полосы, характеризующие состояние окисления, сдвинуты в область более низких частот для гемов с Fe(II). При таком подходе любой эффект (в том числе изменения состояния окисленности атомов железа), который вызывает изменения в распределении электронов на л-орбиталях порфирииа, может повлиять на частоту соответствующих характеристических линий. Эта частота сильно меняется, например, если аксиальный лиганд, имеющий л-орбиталь, может взаимодействовать с орбиталями порфиринов через г/я-электро- ны атома железа. Аксиальный л-электронпый донор приводит к дополнительному переходу е?я-электронов атома железа на я-орбитали пор- фирина и вызывает снижение частоты полос, характеризующих состояние окисления, до «нетипичных» величин.
