- •1. Предмет и задачи биофизики
- •2. Термодинамика
- •3.Биоэнергетика.
- •Электронная схема жизни
- •Трансмембранный электрохимический потенциал – унифицированная форма энергии в клетке
- •Принцип энергетического сопряжения.
- •Законы биоэнергетики.
- •Третий закон биоэнергетики
- •Общая схема энергетических преобразований в клетке Молекулярные механизмы процессов энергетического сопряжения - хемиосмотическая теория Митчела
- •Химические свойства
- •[Править]Роль в организме
- •Пути синтеза
- •Энергетика фотосинтеза
- •Уникальность фотосинтеза как физико-химического процесса.
- •4. Кинетика биологических процессов Кинетическая классификация химических реакций. Типы реакций.
- •Кинетические признаки, лежащие в основе различий простой и сложной реакций
- •Типы простых мономолекулярных и бимолекулярных реакций
- •Особенности кинетики биологических процессов
- •Скорость реакции
- •Зависимость скорости реакции от температуры.
- •Уравнение Аррениуса
- •График Аррениуса для биологических процессов
- •2. Обменно-резонансный.
- •3. Экситонный механизм.
- •Индуктивно-резонансный перенос
- •Что такое свободные радикалы?
- •Классификация свободных радикалов, образующихся в нашем организме
- •Биологические последствия пероксидации липидов
- •9. Биофизика фотобиологических процессов Фотобиологические процессы. Классификация фотобиологических процессов.
- •Участие пигментов в преобразовании энергии квантов
- •Зрение: строение зрительной клетки. Родопсин, фотопревращение родопсина
- •Фотодеструктивные процессы. Их общая характеристика.
- •10. Молекулярная биофизика.
- •Уровни структурной организации белков:
- •Роль слабых взаимодействий ближнего и дальнего порядка в самоорганизации белковой молекулы
- •Структурные и энергетические факторы, определяющие динамическую подвижность белков, потенциал Леннард-Джонса.
- •Конформационные изменения в белке
- •Ферме́нты
- •Ферментативный катализ
- •Электронно-конформационные взаимодействия
- •11. Биофизика механохимических процессов.
- •12.Биофизика мембранных процессов.
- •Мембрана как универсальный компонент биологических систем.
- •Плазматическая мембрана, химический состав биологических мембран
- •Классификация, принципы построения и характеристика мембранных липидов
- •Модельные липидные системы: монослои, мицеллы, липосомы.
- •Фазовые переходы липидов, температура фазового перехода
- •Молекулярная подвижность липидов: сегментарная, вращательная, латеральная, флип-флоп переходы
- •13. Функции биомембран Барьерная функция биомембран
- •Транспорт веществ через биомембраны
- •Движущие силы мембранного транспорта
- •Классификация транспорта веществ через мембраны
- •Механизмы пассивного мембранного транспорта
- •Уравнение Фика
- •Электродиффузионное уравнение Нэрнста-Планка
- •Ионный транспорт через каналы
- •Ионофоры
- •Облегчённая диффузия
- •Транспорт глюкозы в эритроцит
- •Активный транспорт
- •14. Электрические явления в мембранах Ионные токи через возбудимую мембрану
- •Стационарный потенциал Гольдмана-Ходжкина-Катца
- •Изменение мембранного потенциала при возбуждении, потенциал действия.
- •Распространение потенциала действия по нервному волокну
- •Роль локальных токов в распространении пд
- •15. Молекулярные механизмы рецепторных процессов Общая ха-ка процессов передачи информации в клетке: первичные мессенджеры, взаимодействия эффектор-рецептор, пути трансдукции рецепторного сигнала
- •Виды внутриклеточной сигнализации: аденилатциклазный и фосфоинозитидный пути трансдукции рецепторного сигнала
- •Вторичные мессенджеры
Особенности кинетики биологических процессов
БИОЛОГИЧЕСКАЯ КИНЕТИКА
В основе процессов обмена клетки со средой и внутреннего метаболизма лежит сложная сеть организованных определенным образом во времени и пространстве различных реакций. В результате этих процессов изменяются концентрации различных веществ, численность отдельных клеток, биомасса организмов, могут изменяться и другие величины, например величина трансмембранного потенциала в клетке. Изменения всех этих переменных величин во времени и составляют кинетику биологических процессов. Основные исходные предпосылки при описании кинетики в биологических системах в общем такие же, как и в химической кинетике.
Рассмотрим простейший пример замкнутой популяции клеток, в которой одновременно происходят процессы размножения и гибели и в избытке имеются питательные вещества. Возникает вопрос, как меняется численность клеток в такой системе со временем и может ли в ней в конце концов установиться стационарное состояние, когда число клеток меняться не будет. Это типичная кинетическая задача, которая решается с помощью обычных дифференциальных уравнений. Пусть в некоторый момент времени t концентрация клеток в среде составит N. Скорость dN / dt изменения концентрации клеток в среде складывается из скорости их размножения Vразмн и скорости гибели Vгиб :
В простом случае скорость размножения, то есть увеличение концентрации клеток в единицу времени, пропорциональна их численности в каждый момент:
Vразмн = k1N,
где k1 - константа пропорциональности, зависящая от условий среды (температура, наличие питательных веществ и др.).
Аналогично
Vгиб = k2N,
где k2 - константа пропорциональности, определяющая интенсивность процессов гибели клеток. Отсюда следует, что
где k = k1 - k2 .
Решив это уравнение, мы найдем, как меняется концентрация клеток в среде N = N(dt):
N = N0e kt,
где N0 - концентрация клеток в начальный момент времени t = 0 наблюдения за системой.
Легко видеть, что в зависимости от состояния констант скоростей процессов гибели k2 и размножения k1 судьба этой популяции будет различной. Если k1 > k2 , k > 0, то и в системе будет происходить неограниченный рост числа клеток:
N(t) ? при t ?;
если k1 < k2 , то со временем популяция будет вымирать:
N(t) 0 при t ?,
и только в частном случае при k1 = k2 число клеток будет оставаться постоянным:
N = N0 .
Другим примером модели роста популяции в среде с ограниченным количеством питательных веществ служит известное уравнение логистической кривой. Логистическое уравнение Ферхлюста имеет вид
Здесь Nmax - максимальная численность популяции, возможная в данных условиях. Кривая N = = N(t), описываемая этим уравнением, приведена на рис. 1. В начальный период роста, когда N ! Nmax , кривая носит экспоненциальный характер. Затем после точки перегиба наклон постепенно уменьшается и кривая приближается к верхней асимптоте N = Nmax , то есть к максимально достижимому уровню в данных условиях.
Как видно, динамику биологических процессов можно описывать уравнениями, аналогичными уравнениям химической кинетики. Однако по сравнению с обычной химической кинетикой биологическая кинетика характеризуется следующими особенностями.
1. В качестве переменных выступают не только концентрации веществ, но и другие величины.
2. Переменные изменяются не только во времени, но и в пространстве.
3. Биологическая система пространственно гетерогенна, и условия взаимодействия реагентов могут быть различны в разных точках системы.
4. Существуют специальные механизмы саморегуляции, действующие по принципу обратной связи.
Основная задача в биофизике сложных систем состоит в том, чтобы получить характеристики различных динамических режимов и выяснить условия и значения параметров, при которых они реализуются в живой клетке.
