- •Часть II
- •Содержание
- •Лабораторная работа № 4
- •Ферменты
- •Отличие ферментов от неорганических катализаторов
- •Номенклатура и классификация ферментов
- •Коферменты
- •Свойства и функции коферментов
- •Изоферменты
- •Специфичность ферментов
- •Сравнительное действие ферментов и катализаторов неорганической природы
- •Лабораторная работа № 5
- •Активный центр фермента
- •Молекулярные механизмы ферментативного катализа
- •Мультисубстратные комплексы
- •Количественное определение ферментативной активности
- •Факторы, влияющие на активность ферментов
- •Регуляция каталитической активности ферментов
- •Регуляция путем изменения биосинтеза ферментов
- •Компартментализация ферментов в клетке
- •Лабораторная работа № 6
- •Кинетика ферментативных реакций
- •Уравнение Михаэлиса-Ментен
- •Графическое определение константы Михаэлиса (Кm)
- •Упростив уравнение, получаем:
- •Ингибирование активности ферментов
- •Конкурентное ингибирование аналогами субстрата
- •Графическая оценка констант конкурентного ингибирования
- •Бесконкурентное ингибирование
Уравнение Михаэлиса-Ментен
Важнейшим фактором, определяющим скорость ферментативной реакции, является концентрация реагирующих веществ, концентрация субстратов. Как было указано выше, фермент взаимодействует с субстратом с образованием фермент-субстратного комплекса. Затем фермент-субстратный комплекс распадается с образованием продукта реакции, а катализатор остается в исходном состоянии. Ниже приведено уравнение, отражающее процесс ферментативного катализа с образованием продукта реакции:
Как видно из этого уравнения, фермент Е взаимодействует с субстратом S с образованием фермент-субстратного комплекса ES. Этот процесс характеризуется константой скорости – k1. Комплекс ES способен распадаться на исходные компоненты – Е и S с константой скорости k−1. Константа k2 представляет собой константу скорости распада комплекса ES с образованием продукта реакции.
Вполне очевидно, что фермент-субстратный комплекс способен к обратимой диссоциации в соответствии с уравнением:
Исходя из закона действующих масс, скорость образования комплекса ES можно записать следующим образом:
,
где k1 – константа скорости реакции образования комплекса ES.
Поскольку комплекс ES способен диссоциировать без образования продукта реакции скорость распада комплекса ES можно выразить уравнением:
,
где k−1 – константа скорости реакции распада комплекса ES.
При равенстве скоростей V1 и V2 получим выражение:
Разделив обе части уравнения на величину k1, получим: [E][S] = k−1/k1 [ES], где k−1/k1 представляет собой величину называемую константой диссоциации – KS.
После соответствующего преобразования выражение приобретает вид:
В последнем уравнении величину [E] можно представить как [E0]–[ES], что представляет собой концентрацию свободного фермента за вычетом концентрации фермента, связанного с субстратом [ES]. Величина [E0] – общая концентрация фермента в начале реакции. Подставив в предыдущее уравнение вместо [E] – [E0]–[ES] получим:
После преобразования последнего уравнения получаем:
Максимальная скорость ферментативной реакции достигается в ситуации, когда концентрация комплекса ES равна начальной концентрации фермента Е0 т.е. [ES] = [E0]. Таким образом, можно записать следующее выражение:
Поскольку из предыдущего выражения следует, что:
то получаем:
или
Последнее уравнение получило название уравнения Михаэлиса-Ментен. Графически зависимость между концентрацией субстрата и скоростью реакции отображает рис. 6.1. Из этого рисунка видно, что при низких концентрациях субстрата реакция характеризуется первым порядком, а при его высоких концентрациях становится реакцией нулевого порядка, когда скорость реакции становится постоянной величиной.
Следует, однако, помнить, что уравнение Михаэлиса-Ментен справедливо только для начального времени реакции, когда присутствует избыток субстрата и образуется небольшое количество продукта. Именно поэтому уравнение Михаэлиса-Ментен носит несколько ограниченный характер, поскольку оно учитывает только первую часть процесса и не учитывает его вторую стадию – влияние продукта реакции и его взаимодействие с ферментом. В связи с этим Холдейном и Бриггсом было предложено усовершенствованное выражение уравнения Михаэлиса-Ментен:
,
где КM – константа Михаэлиса, которая равна концентрации субстрата (выраженной в молях/литр), при которой скорость реакции составляет половину максимальной скорости. Численное значение константы Михаэлиса может быть выражено следующим образом:
Преобразованное Холдейном и Бриггсом уравнение Михаэлиса-Ментен, которое имеет вид
описывает поведение многих ферментов при изменении концентрации их субстратов. Используя это уравнение можно рассмотреть несколько ситуаций, отражающих влияние [S] и КM на начальную скорость ферментативной реакции:
Значение [S] намного меньше величины КM (рис. 6.1). В этом случае величину [S] в знаменателе можно опустить, и он будет практически равен величине КM. Отношение двух постоянных величин – Vmax и КM, можно заменить новой константой К. Таким образом, имеем:
;
( означает «примерно равно»).
Другими словами, когда концентрация субстрата значительно ниже величины КM – начальная скорость реакции, V0, пропорциональна концентрации субстрата [S];
Значение [S] намного больше величины КM (рис. 6.1). Тогда величиной КM в знаменателе можно пренебречь, т.е.
;
Это означает, что при концентрации субстрата [S], намного превышающей КM, начальная скорость V0 равна максимальной скорости – Vmax;
Наконец, при равенстве величин [S] и КM (рис. 6.1) в знаменателе уравнения Михаэлиса-Ментен получим удвоенное значение [S].
;
Это означает, что при концентрации субстрата, равной КM, начальная скорость реакции V0 составляет половину максимальной скорости – Vmax.
