- •Глава 1. Интегральный метаболом человека
- •1.1. Ионный и газовый метаболом жидких сред организма
- •2.1. Метаболизм и метаболические пути
- •3.1. Последовательность аналитических процедур в метаболомике
- •3.2. Методы анализа (обнаружения) и определения количества компонентов фракций
- •3.2.1. Хроматография
- •4. Метаболомика
- •Глава 5. Ксенометаболомика (ксенобиотики)
- •6.1. Токсикокинетические модели
- •Глава 6. Токсикокинетика
- •Метаболомика: здоровы ли вы или больны? ответ даст анализ метаболизма вашего организма
- •Метаболомика: к вопросу о разработке более эффективных антибиотиков
2.1. Метаболизм и метаболические пути
Метаболизм (от греч. metabole - «движение, изменение, превращение») - совокупность биохимических превращений веществ, поступающих в организм, и взаимопревращения веществ, из которых состоит организм.
Превращения (обмен) веществ в процессах метаболизма осуществляются через цепи последовательных реакций. Эти цепи последовательных реакций называют метаболическими путями (МП).
Характер метаболизма в тканях во многом определяется питанием.
• У человека и других млекопитающих метаболическим превращениям подвергаются продукты, абсорбируемые после переваривания содержащихся в пище белков, жиров и углеводов.
• У жвачных животных (и в меньшей степени у других травоядных) целлюлоза переваривается симбиотическими микроорганизмами с образованием низших гомологов органических кислот (уксусной, пропионовой, масляной); тканевый метаболизм у этих животных адаптирован к утилизации в качестве основного субстрата низших жирных кислот.
При экспериментальном исследовании метаболического пути, во-первых, индентифицируют реагирующие компоненты, выясняют стехиометрию и механизм для каждой из последовательных стадий процесса. Заключительным этапом такого исследования является воспроизведение ферментативных реакций в пробирке. Во-вторых, идентифицируют генетические, аллостерические и гормональные механизмы, с помощью которых осуществляется регуляция скорости данного метаболического процесса.
Метаболические пути в целом организме изучают либо методом определения вводимых в организм и выводимых из него веществ (в норме, а также в условиях стресса и патологии), либо методом перфузии (промывки) отдельных органов, либо методом переживающих срезов ткани. Очень перспективным считают метод, основанный на изучении полученных мутантных организмов с генетическими дефектами, а также метод меченых атомов.
Таблица 2.1. Взаимосвязь общего катаболизма (расщепления) и анаболизма (синтеза)
Метаболизм включает катаболизм и анаболизм.
Катаболизм - фаза распада, ферментативное расщепление сложных молекул на более простые, метаболический путь от сложного к простому.
Анаболизм - синтез сложных молекул из малых, метаболический путь от простого к сложному.
В свою очередь, каждый из этих процессов (катаболизм и анаболизм) состоит из двух одновременно протекающих взаимосвязанных процессов:
• промежуточного метаболизма - последовательности ферментативных реакций распада или синтеза, промежуточные продукты которой носят название «метаболиты»;
• энергетического сопряжения - превращений энергии в реакциях метаболизма, в результате которых энергия либо запасается в высокоэнергетичных соединениях (АТФ, NADPH), либо расходуется при распаде этих соединений (табл. 2.1).
Процессы общего катаболизма можно разбить на три основные стадии (рис. 2.1).
Рис. 2.1. Три основные стадии катаболизма
Первые две стадии катаболизма - расщепление белков, полисахаров и липидов до пирувата и ацетил-кофермента-А (ацетил-КоА). Третья стадия - цикл лимонной кислоты, основной процесс, обеспечивающий организм энергией и различными метаболитами.
Процессы анаболизма также включают три стадии. Исходными веществами, или строительными блоками, служат для анаболизма соединения, поставляемые процессами катаболизма.
Катаболические и анаболические пути не совпадают между собой.
Метаболизм пищевых веществ. Поступающая в организм пища, в значительной мере состоящая из белков, углеводов и жиров, должна быть деструктурирована до таких компонентов, как аминокислоты, гексозы, жирные кислоты, которые непосредственно участвуют в процессах метаболизма. Превращение исходных веществ в резорбируемые субстраты происходит поэтапно в результате процессов катаболизма, проходящих с участием различных ферментов.
