- •1. Биохимия, ее задачи, значение биохимии для медицины.
- •2. Аминокислоты, строение, классификация по химической природе и свойствам боковой цепи. Уровни структурной организации белков. Характеристика связей, стабилизирующих белки. Понятие о доменных белках.
- •3. Физико-химические свойства белков как основа методов их исследования.
- •4. Принципы классификации белков. Характеристика простых белков.
- •5. Классификация сложных белков. Нуклеопротеины, структура, виды, биологическая роль. Строение мононуклеотидов, входящих в состав нуклеопротеинов.
- •7. Классификация сложных белков. Углевод-белковые комплексы, биологическая роль. Особенности строения гликопротеинов и протеогликанов.
- •8. Классификация сложных белков. Липид-белковые комплексы, биологическая роль. Особенности строения структурных протеолипидов и свободных липопротеинов.
- •9. Ферменты, их химическая природа, структурная организация, свойства. Сходство и отличия ферментов и небелковых катализаторов.
- •10. Коферменты, классификация, функции в ферментативных реакциях, примеры реакций.
- •11. Классификация и номенклатура ферментов. Характеристика ферментов первого и второго классов, примеры реакций.
- •12. Классификация и номенклатура ферментов. Характеристика ферментов третьего и четвертого классов, примеры реакций.
- •14. Современные представления о механизме действия ферментов. Стадии ферментативной реакции, молекулярные эффекты.
- •15. Ингибирование ферментов. Виды ингибирования, примеры. Лекарственные вещества как ингибиторы ферментов.
- •16. Характеристика основных видов регуляции активности ферментов в клетках живого организма.
- •17. Обмен веществ и энергии. Характеристика основных этапов обмена веществ. Общий и специфические пути катаболизма. Окислительное декарбоксилирование пирувата.
- •5 Коферментов
- •3 Фермента
- •18. Современные представления о биологическом окислении. Компоненты дыхательной цепи и их характеристика.
- •19. Пути синтеза атф в клетках, клеточная локализация процессов синтеза атф, примеры реакций. Молекулярные механизмы окислительного фосфорилирования (теория Митчелла).
- •20. Цитратный цикл, его биологическое значение, последовательность реакций. Сопряжение реакций цикла трикарбоновых кислот с дыхательной цепью ферментов.
- •21. Роль белков в питании. Превращение белков в органах пищеварительной системы. Роль соляной кислоты в переваривании белков. Характеристика протеолитических ферментов пищеварительного тракта.
- •23. Трансаминирование и декарбоксилирование аминокислот. Химизм процессов, биологическая роль.
- •24. Дезаминирование аминокислот. Окислительное дезаминирование. Непрямое дезаминирование, биологическая роль.
- •25. Синтез мочевины, химизм реакций, биологическая роль.
- •26. Реакции образования мочевой кислоты и креатинина, химизм реакций, биологическая роль процессов.
- •27. Современные представления о структуре и функциях нуклеиновых кислот. Строение мономеров нуклеиновых кислот. Генетический код и его свойства.
- •28. Репликация днк, условия, этапы, их характеристика.
- •29. Транскрипция, условия и этапы транскрипции, их характеристика.
19. Пути синтеза атф в клетках, клеточная локализация процессов синтеза атф, примеры реакций. Молекулярные механизмы окислительного фосфорилирования (теория Митчелла).
Окислительное фосфорилирование - процесс образования АТФ из АДФ и Н3РО4 за счёт энергии переноса электронов в дыхательной цепи.
Субстратное фосфорилирование - это процесс образования АТФ из АДФ и Н3РО4 за счёт энергии распада какого-либо субстрата.
В основной дыхательной цепи выделяются 3 пункта, где может образоваться АТФ: 1.) НАД KоQ; •НАДН2 — 3 АТФ 2.) ЦИТ.b ЦИТ.с •ФАДН2 — 2 АТФ З.) ЦИТ.а ЦИТ.а3
Теория окислительного фосфорилирования (Питер Митчелл, 1961). Основные положения теории: 1.) Мембрана митохондрий в норме не проницаема для протонов. 2.) В процессе транспорта электронов протоны «перекачиваются» в межмембранное пространство - образуется электрохимический потенциал. 3.) Обратный транспорт протонов в матрикс митохондрий сопряжен с синтезом АТФ.
Процесс транспорта электронов происходит во внутренней мембране, где расположены ферменты ЦПЭ. Реакции окисления субстратов происходят в матриксе митохондрий. Протоны переносятся в межмембранное пространство, а электроны продвигаются по дыхательной цепи.
Тканевое дыхание. Дегидрирование без пламени и взрыва с образованием эндогенной воды при участии оксидаз (оксидазный путь окисления): • процесс транспорта электронов и протонов; • происходит в митохондриях; • конечным акцептором является кислород; • конечный продукт тканевого дыхания – Н2О; • энергия выделяется постепенно; • процесс многоступенчатый; • процесс полиферментативный.
Тканевое дыхание многоступенчатый процесс транспорта электронов. И протонов от субстрата на кислород с образованием эндогенной воды, осуществляемый комплексом ферментов, сопряженный с постепенным выделением энергии.
Во время тканевого дыхания создаётся электрохимический потенциал: • концентрационный (протонный); • разности потенциалов (электрический). При этом наружная сторона внутренней мембраны заряжается «+», а внутренняя «-». Т.е. создается градиент концентрации протонов; • электрический и концентрационный потенциал составляют протондвижущую силу, которая перемещает протоны обратно в матрикс митохондрий; • через протонные каналы, образованные ферментом - АТФ-синтазой. АДФ + Н3РО4 → АТФ Протоны проходят обратно в матрикс, при этом активность АТФ-синтазы повышается. Образуется АТФ.
АТФ-синтаза: • интегральный белок внутренней мембраны митохондрий. • гидрофобная часть F0 пронизывает мембрану и образует канал, по которому протоны переносятся обратно в матрикс. • каталитическая часть F1 выступает в матрикс, соединяется с F0 при помощи γ-субъединицы, образующей вращающийся за счет изменения конформации стержень. • электрохимический потенциал заставляет двигаться протоны по каналу АТФ-синтазы обратно в матрикс и параллельно происходят конформационные изменения в F1. • в результате из АДФ и Фн образуется АТФ. • для синтеза 1АТФ используется электрохимический потенциал, генерируемый при перепаде напряжения в одном из пунктов сопряжения (перекачка 4H+).
Модель синтеза АТФ: - протон проваливается через полуканал с наружной стороны митохондриальной мембраны, протонирует аминокислоту ротора, на аминокислоте появляется дополнительный положительный заряд. - протонированная аминокислота на роторе перемещается к следующей половинке канала, ведущей внутрь митохондрии, протон попадает во второй полуканал и матрикс, аминокислота освобождается от положительного заряда. - заряды в роторе и статоре расположены таким образом, что протонирование – депротонирование приводит к повороту белка.
В соответствии с хемоосмотической теорией Митчелла окисление НАДH + H+ и ФАДН2 в дыхательной цепи создаёт сначала электрохимический протонный потенциал, градиент концентрации ионов на внутренней мембране, а обратный транспорт протонов через мембрану сопряжен с фосфорилированием АДФ, т.е. образованием АТФ.
Коэффициент окислительного фосфорилирования (Р/О): отношение количества фосфорной кислоты (Р), использованной на фосфорилирование АДФ, к атому кислорода (О), поглощённого в процессе дыхания. для НАДН+ + Н+ Р/О = 3, для ФАДН2 Р/О = 2. Дыхательный контроль - зависимость интенсивности дыхания митохондрий от концентрации АДФ. АТФ/(АДФ+АМФ)
Условия образования АТФ: 1.) Целостность мембраны - непроницаемость её для протонов. 2.) Наличие специальных каналов. 3.) Движение протонов в матрикс сопровождается выделением энергии, используемой для синтеза АТФ.
В обычных условиях процессы окисления и фосфорилирования сопряжены и сопровождаются синтезом АТФ. Разобщение окислительного фосфорилирования (свободное окисление) - окисление идёт, а фосфорилирования нет, вся энергия выделяется в виде тепла.
Причиной разобщения окислительного фосфорилирования могут стать: - нарушение целостности /функции мембран митохондрий; - протонофоры, ионофоры (липофильные вещества): 2,4–динитрофенол, билирубин, тироксин, высшие жирные кислоты.
Пути использования кислорода в организме (альтернативный путь окисления):
Свободнорадикальный
1% О2
Неферментативно
Не сопровождается синтезом АТФ
синтезом АТФ
Оксигеназный
9% О2
Не сопровождается синтезом АТФ
Оксидазный
90% О2
О2 + 4ē + 4Н+→2Н2О
в митохондриях
сопровождается синтезом АТФ
синезом АТФ
Оксигеназный путь
Монооксигеназный
Диоксигеназный
+Н
S-Н +O2 S-OOH
S-Н + O2 + Н S-OH + H2O
НАДФН
Стадии: 1.) Связывание кислорода с активным центром фермента. 2.) Восстановление кислорода и перенос его на субстрат. Биологическое значение: 1.) Обезвреживание чужеродных и эндогенных токсических веществ; 2.) Синтез гормонов и других биологически активных соединений; 3.) Метаболизм лекарств.
бензол
(цит.Р450)
гидроксилаза
+ НАДФ+ + Н2О
фенол
+ О2 + НАДФН2
