- •Содержание
- •Список сокращений
- •Введение
- •І. Тема: белки
- •Цели занятия:
- •Учебные задачи
- •Серин (сер)
- •1. Строение и биологическая роль аминокислот, пептидов, белков
- •Аспарагиновая кислота (асп)
- •Лизин (лиз)
- •1.1. Первичная структура белка
- •1.2. Варианты вторичной структуры белка
- •1.3. Третичная структура белка
- •1.4. Четвертичная структура белка – высший уровень организации
- •Свойства протеинов
- •2.1. Физико - химические свойства биополимеров
- •2.2. Особенности биологических свойств белков
- •3. Методы очистки и выделения белков
- •4. Классификация белков
- •4.1. Простые белки
- •4.1.1. Глобулярные белки
- •4.1. 2. Фибриллярные белки
- •Растворимые в воде и её солевых растворах
- •Нерастворимые в воде и водно-солевых растворах
- •4.2. Сложные белки
- •5. Биологическая роль протеинов
- •Вопросы для самоконтроля
- •Тестовые задания для оценки уровня знаний
- •Ситуационные задачи
- •II. Тема: ферменты
- •Цели занятия:
- •Учебные задачи
- •1. Особенности строения ферментов
- •1.1. Энзим – сложный белок
- •1.1.1. Природа и роль кофермента
- •1.1.2. Апофермент и его значение
- •1.2. Функциональные центры фермента
- •2. Энзимы как биокатализаторы
- •2.1. Теории, объясняющие механизм действия ферментов
- •I стадия. Образование es-комплекса
- •II стадия. Активация es-комплекса
- •III стадия. Образование eр-комплекса
- •IV стадия. Распад eр-комплекса
- •2.2. Специфичность действия энзимов
- •2.3. Кинетика ферментативных реакций
- •2.3.1. Зависимость скорости реакции от содержания субстрата
- •2.3.2. Влияние концентрации фермента на скорость реакции
- •2.3.3. Эффект колебаний температуры
- •2.3.4. Связь интенсивности процесса с величинами рН среды
- •3. Классификация, номенклатура ферментов
- •3.1. Классификация
- •2.1.1. Характеристика отдельных классов ферментов
- •4. Положительная и отрицательная регуляции работы ферментов
- •4.1. Механизмы аллостерической регуляции
- •4.2. Последствия белок - белкового взаимодействия
- •4.3. Регуляция путём ковалентной модификации
- •4.4. Частичный протеолиз как способ активации зимогена
- •Особенности конкурентного ингибирования
- •5. Использование ферментов в медицине
- •5.1. Энзимопатии
- •Энзимодиагностика
- •Энзимотерапия
- •Вопросы для самоконтроля
- •Тестовые задания для оценки уровня знаний:
- •Ситуационные задачи
- •Ответы Ответы на ситуационные задачи
- •Варианты правильных ответов на контрольные тесты
- •Список литературы
4.2. Сложные белки
Это структуры, содержащие белковую часть – апопротеин и небелковый компонент – простетическую группу. В зависимости от строения последней принято различать следующие их варианты.
Фосфопротеины – это сложные белки, простетической группой которых является остаток фосфорной кислоты. Тип связи между апопротеином и небелковым компонентом – сложноэфирная, которая образуется при взаимодействии ОН-группы серина или треонина с фосфорной кислотой. К протеинам этого класса относятся казеиноген молока, фосфорилированные модификации гистонов, ферменты (РНК-полимеразы, некоторые фосфотрансферазы, фосфатазы) и другие, а также вителлин, фосвитин желтка и овальбумин белка яиц, ихтуллин икры рыб.
Остатки фосфорной кислоты, включённые в белки, находятся в диссоциированом состоянии, что придаёт молекуле сильный отрицательный заряд. Поэтому фосфопротеины могут легко взаимодействовать с лигандами или отталкивать их. Так, например, они связывают ионы Са2+ и транспортируют их.
Но главная особенность данной простетической группы – это возможность изменения конформации и заряда белковой молекулы, что сказывается на её свойствах и функциях. Реакция взаимодействия с фосфорной кислотой называется фосфорилирование или дефосфорилирование и используется, например, для регулирования активности ферментов и изменения функциональной активности биомембран (проницаемости и др.).
Фосфопротеины необходимы для развития зародыша, плода, новорожденного, т.к. содержат оптимальный набор аминокислот, а фосфорная кислота используется для формирования скелета (связывание ионов Са2+), для образования макроэргов – АТФ, АДФ и др., которые требуются в качестве источников энергии в реакциях синтеза, особенно интенсивно протекающих в растущем организме.
Нуклеопротеины
– сложные
белки, простетической группой которых
являются нуклеотиды, и в первую очередь
нуклеиновые кислоты – ДНК и РНК. В
качестве апопротеина выступают белки
гистоны,
реже протамины.
Так как эти протеины положительно
заряжены, а нуклеиновые кислоты –
отрицательно, то связь, образуемая между
ними, ионная.
Множество октамеров гистонов,
комплексируясь с полинуклеотидом,
образует нуклеосомы, которые затем
компактно укладываются в органоидах
(рис. 13).
В функциональном отношении они отвечают за хранение и передачу наследственной информации и процессы биосинтеза белка.
Хромопротеины («цветные белки») своей окраской обязаны простетической группе – пигменту. В зависимости от строения различают следующие подклассы: гемопротеины, флавопротеины, родопсин.
Г
емопротеины
(красные) – сложные
белки, простетической группой которых
служит гем.
Он представлен порфирином, состоящим
из 4-х пиррольных колец, соединённых
метиновыми мостиками (—СН=). В центре
располагаются ионы Fe2+
(гем b)
или Mg2+
(гем а). Связь между апопротеином и
небелковым компонентом координационная
(донорно-акцепторная).
Гемопротеины различаются по составу и
структуре белка, обеспечивая разнообразие
биофункций. Чаще всего встречается гем
b
(рис. 14). Он входит в состав гемоглобина
(Hb)
и миоглобина,
обеспечивающих связывание газов,
транспорт их эритроцитами или накопление
кислорода миоцитами. Мицелла Hb
состоит из четырёх полипептидных цепей
и служит примером обладания биологическим
свойством кооперативность
(см. выше) – то есть у каждой последующей
субъединицы сродство к кислороду выше
предыдущей. Гемоглобин присоединяет
кислород в условиях его высокого
парциального давления и отдает
соответственно в среде с низким
содержанием этого газа. Сродство
гемоглобина к монооксиду углерода
больше, чем к кислороду, поэтому угарный
газ (СО) может вытеснять кислород из
оксигемоглобина. Образующийся
карбоксигемоглобин не способен служить
переносчиком кислорода, в тканях
развивается гипоксия,
опасная для клеток. Эта форма Hb
имеет вишнево-красную окраску,
обуславливающую цвет лица людей,
отравившихся диоксидом углерода, что
позволяет легко диагностировать
токсическое действие газа. Зародышевый
гемоглобин F (α2γ2)
обладает более высоким сродством к
кислороду, чем HbА
взрослых людей. Благодаря этому возможен
оптимальный перенос газа от матери к
плоду.
Миоглобин – небольшой глобулярный белок (Mr 16500 Да); молекула его состоит из одной полипептидной цепи (153 а/к) и одного гема. Сродство к кислороду у данного гемопротеида значительно больше, чем у гемоглобина, поэтому он может принимать газ от последнего для сохранения или использования его в мышечных клетках.
Гем b является также структурной единицей ферментов каталазы и пероксидазы, обезвреживающих пероксиды, и цитохромов – митохондриальных белков, участвующих в переносе электронов от окисляемых веществ в конечном итоге на кислород за счёт своей способности изменять валентность железа.
Гем а встречается в растительных гемопротеинах и участвует в процессе фотосинтеза.
Флавопротеины (flavus - жёлтый). Их простетической группой служат активные формы витамина В2 (рибофлавин) – ФАД (флавинадениндинуклеотид), ФМН (флавинмононуклеотид). Классический пример данного вида белков оксидоредуктазы — ферменты, катализирующие окислительно-восстановительные реакции в клетке. В некоторые флавоноиды включены ионы металлов - металлофлавопротеины или молекула гема – флавогемопротеины. Их типичными представителями, содержащими также негемовое железо, являются альдегидоксидаза, ксантинДГ, дигидрооротатДГ, ацил-КоА-ДГ. На долю последних приходится до 80 % митохондриальных белков, выполняющих важную роль в биоэнергетике клетки.
Родопсин (от греч. rhodos — пурпур и opsis — зрение) – это белок, простетической группой которого является активная форма витамина А – ретиналь. Апопротеин связан с ним иминной связью. Родопсин - основное светочувствительное вещество палочек сетчатки глаза. Его функция состоит в восприятии света в сумерках, т.е. он отвечает за сумеречное зрение.
Металлопротеины – сложные белки, где роль небелкового компонента выполняют катионы металлов. Связь между ними ионная или координационная (донорно-акцепторная). Типичными представителями таких белков являются железосодержащие белки.
Ферритин. В его составе ионы Fe3+ депонируются в клетках селезёнки, костного мозга, но богаче всего этим белком печень. Там может накапливаться до 700 мг железа, которое используется по мере надобности для синтеза гема. Гемосидерин – это комплекс гликопротеина и ионов железа, образуется в тканях при кумулировании избытка железа. Трансферрин – растворимый в воде железопротеин, содержащий ещё олигосахариды (металлогликопротеин). Этот белок вырабатывается гепатоцитами и секретируется в кровь, где служит для транспорта катионов этого металла к клеткам других органов. Молекула трансферрина удерживает два иона железа, которые захватывает в кишечнике или местах распада гема, и осуществляет их перенос к точкам депонирования и утилизации. Церулоплазмин аналогично трансферрину обеспечивает транспорт катионов металла, только восьми ионов меди.
Кроме того, многие ферменты в свой активный центр включают различные ионы металлов, выступающие в роли Ко-фактора: Zn2+ - в алкогольдегидрогеназу (алкогольДГ), Mn2+ - в аргиназу, Mg2+ - в гексокиназу, Мо2+ - в ксантинДГ и другие.
Гликопротеины, или гликоконъюгаты. В них простетическая группа представлена углеводными компонентами и связана с белком О-гликозидными (реже N-гликозидными) связями. Небелковый фрагмент некоторых гликопротеидов редко бывает представлен одним моносахаридом; как правило, это олиго- или полисахаридные разветвлённые цепочки. Причём на долю углеводов может приходиться от 1 до 85%.
Исходя из вклада в общую копилку, выделяют два подкласса белков, содержащих углеводы: протеогликаны и гликопротеины. Между ними имеются существенные отличия:
Таблица 1
Отличительные особенности строения углеводсодержащих белков
Гликопротеины |
Протеогликаны |
|
|
Как видно из таблицы
1, для собственно гликопротеинов
характерно
низкое содержание углеводов 15-20 %, которые
присоединены к амидному азоту аспарагина
N-гликозидной
связью, либо к гидроксигруппе остатка
серина, реже треонина, гидроксилизина.
В глициде отсутствует регулярность в
чередовании моносахаридов, регистрируются
манноза, галактоза, глюкоза, их
аминопроизводные, N-ацетилнейраминовая
кислота. Разнообразие гликановых
фрагментов используется при построении
мембранных рецепторов (рис. 15), для
обеспечения взаимодействия антиген-антитело,
с
пецифичных
контактов клеток между собой, а также
в защите ферментов от протеолиза. Почти
все внеклеточные белки, включая глобулины
(см. 4.1.1.) крови, относятся к гликопротеинам.
К ним же принадлежат некоторые гормоны
(тиреотропный, гонадотропные) являются
гликоконъюгатами. К типичным представителям
данного класса белков относятся все
антитела (иммуноглобулины), интерфероны,
факторы системы комплемента, групп
крови и др. Первые — синтезируются в
плазмоцитах, обезвреживают антигены
любой химической природы. Различают
пять классов иммуноглобулинов: IgG, IgM,
IgA, IgD и IgE. Интерфероны
(α, β, γ) — гликопротеины, образующиеся
в клетке в ответ на внедрение вирусов
и ингибирующие их размножение.
Другая группа
гликоконъюгатов – протеогликаны
– характеризуется наличием крупных
полисахаридов (рис. 16), в состав которых
входят гликозаминогликаны
(ГАГ): гиалуроновая кислота,
хондроитин-сульфаты, кератансульфаты,
дерматансульфаты и гепарансульфаты.
У
глеводные
фрагменты усиливают гидрофильные
свойства белков за счёт большого
количества гидроксильных групп и
кислотных группировок. Соотношение
компонентов: протеина - 10-15%, а углеводов
- 90-95%. Цепи последних недостаточно гибкие
и стремятся принять конформацию очень
рыхлого случайного клубка, занимая
огромный объём. Будучи гидрофильными,
они притягивают много воды и даже в
низких концентрациях образуют
гидратированные
гели. Подобная
способность создаёт во внеклеточном
пространстве тургор.
Протеогликаны хрящевого матрикса
содержат гиалуроновую
кислоту,
образующую студенистый гель, выполняющий
роль амортизатора в хрящах и суставных
поверхностях. Входя в межклеточное
вещество соединительной ткани она
регулирует её проницаемость.
Липопротеины – сложные белки, простетическая группа в которых – липиды: нейтральные жиры (ТАГ), эфиры холестерола, фосфолипиды (ФЛ). Между компонентами возникают гидрофобные взаимодействия, реже ионная или эфирная связи.
Все липопротеины имеют сходное строение (рис 17).
Внутри липопротеиновой частицы находится жировая капля – ядро, содержащее неполярные (гидрофобные) липиды: ТАГ и эфиры холестерола. Снаружи оно окружено однослойной мембраной, образованной ФЛ, белком и НЭХС. Белковый компонент получил название аполипопротеин(ы), некоторые из них прочно связаны со всеми фрагментами и не могут быть отделены от целой мицеллы, а другие способны переходить от одного липопротеина к другому. Их белки выполняют несколько функций: формируют структуру частицы, взаимодействуют с рецепторами на поверхности плазмоллем, определяя, каким тканям она необходима, служат ферментами или их активаторами.
Плотность белка выше плотности липидов, поэтому, чем меньше доля апопротеина в частице, тем она тяжелее. По соотношению входящих в частицу компонентов различают несколько классов липопротеинов: хиломикроны (ХМ), липопротеины очень низкой плотности (ЛПОНП), липопротеины промежуточной плотности (ЛППП), липопротеины низкой плотности (ЛПНП), липопротеины высокой плотности (ЛПВП).
Каждый из типов ЛП образуется в разных тканях и транспортирует определённые липиды. Благодаря наличию отрицательного заряда на поверхности ЛП хорошо растворимы в крови. Мицеллы небольших размеров способны легко проникать через стенки сосудов, а некоторым (ХМ) это делать трудно из-за больших размеров, поэтому они сначала попадают в лимфатические сосуды, затем через главный грудной проток вливаются в систему полых вен, правое предсердие, малый круг кровообращения и только потом оказываются в аорте и артериях, доставляющих их к органам.
Характеристика ЛП частиц представлена в таблице 2.
Таблица 2.
Характеристика липопротеиновых частиц
Класс ЛП |
Доля белка (%) |
Доля ФЛ (%) |
Доля ХС (%) |
Доля ТАГ (%) |
Плотность (г/мл) |
Места синтеза |
Функции |
ХМ |
2 |
3 |
5 |
85 |
< 1 |
Клетки эпителия тонкого кишечника (энтероциты) |
Транспорт в основном экзогенных жиров из кишечника к тканям |
ЛПОНП |
10 |
18 |
17 |
55 |
≈1 |
Клетки печени |
Транспорт эндогенных жиров из печени к тканям |
ЛППП |
11 |
23 |
38 |
26 |
1,02 |
Плазма крови (из ЛПОНП) |
Промежуточная форма превращения ЛПОНП в ЛПНП под действием ЛП-липаз |
ЛПНП |
25 |
21 |
50 |
7 |
1,06 |
Плазма крови (из ЛПОНП и ЛППП) |
Транспорт эндогенного ХС из печени к тканям |
ЛПВП |
50 |
27 |
20 |
3 |
1,21 |
Гепатоциты |
Транспорт не использованного ХС из тканей к печени |
Итак, главными транспортными формами ТАГ в организме являются ХМ и ЛПОНП, а перенос ХС осуществляют ЛПНП и ЛПВП. Нарушение баланса между фракциями может приводить к различной патологии. Наибольшую опасность представляет изменение соотношения ЛПНП и ЛПВП, приводящее к атеросклерозу.
