- •Конспект лекций «Биофизика»
- •Биофизика как наука
- •Термодинамика биологических процессов
- •Первое начало термодинамики
- •Второе начало термодинамики
- •Т/д потенциал
- •Стационарное состояние
- •Градиенты
- •Ф значение т/д параметров в 1 и 2 точках
- •Второй закон т/д для открытых систем
- •Механизмы устойчивости стационарного состояния в био системах. Теорема Пригожина
- •Кинетика биопроцессов Динамические свойства биопроцессов
- •Основные особенности кинетики биопроцессов
- •Простейшая кинетическая модель открытой системы
- •Качественный анализ кинетической модели
- •Качественный критерий устойчивости стационарного состояния Ляпунова
- •Редукция числа уравнений. Принцип узкого места
- •Типы устойчивости особых точек
- •Биологические триггеры
- •Колебательные процессы
- •Предмет молекулярной биофизики
- •Виды взаимодействий биологических молекул
Основные особенности кинетики биопроцессов
-
В биокинетике в качестве переменных величин выступают не только концентрации веществ, но и другие параметры.
-
Биосистема пространственно гетерогенна, следовательно условия действия реагентов могут различаться в разных точках системы и переменные изменяются не только во времени, но и в пространстве.
-
Существуют специфические механизмы саморегуляции действия по принципу обратной связи.
-
Трудности биокинетики связаны так же с тем, что она описывает процессы открытых систем.
Схема системы с отрицательной обратной связью
ОУ – объект управления,
РВ – регулируемая величина,
ИУ – измерительное устройство (измерение параметров регулируемой величины)
АС – аппарат сравнения,
ОС – обратная связь,
f – сигнал от высших центров регуляции.
Простейшая кинетическая модель открытой системы
. Модель системы в которой происходит обмен веществ "а" и "b" с окружающей средой, внутри обратимые реакции превращения "а" в "b", во внешних резервуарах концентрация этих веществ постоянна и равна соответственно А и В.
da/dt = k1(A–a)–k2(a–k–2b)
db/dt = k2a–k3(b–B)–K–2b
Для стационарного состояния будет соблюдаться условие: da/dt = 0, db/dt = 0.
"а" стационарное и "b" стационарное не зависят от начальных условий, то есть от значений "а" и "b" в момент t = 0. "а" стационарное и "b" стационарное определяются только величинами констант k с 1 по 3 и концентраций веществ во внешних резервуарах системы, то есть А и В.
Вывод:
В каком бы начальном состоянии ни находилась система, в ней в конце концов установится один и тот же стационарный режим при котором а = а стационарное, b = b стационарное. Это свойство эквивалентности стационарных состояний. Оно присуще открытым системам и постоянно встречается при изучении свойств биополимеров.
Качественный анализ кинетической модели
Основная идея метода заключается в отказе от нахождения точных аналитических решений диф уравнений. Вместо этого используются качественные характеристики динамического поведения системы: устойчивость или неустойчивость стационарного состояния, переходы между стационарными состояниями, наличие колебательных движений в системе, качественная зависимость поведения системы от критических значений параметров. Наиболее важным свойством стационарного состояния является его устойчивость, она определяется спосбностью системы самопроизвольно в него возвращаться после внесения внешних возмущений, отклоняющих систему от исходно стационарной точки.
Очевидно, чтобы сделать заключение об устойчивость стационарного состояния необходимо иметь соответствующие критерии.
Бассейн с водой открытая система. С определенной Vпр в него поступает вещество а, но оно с определенной Vот из системы истекает. Vпр постоянна, Vпр = V0 = cosnt. Чтобы выяснить с какой скоростью меняется количество вещества в системе, нужно вычислить: da/dt = Vпр – Vот = V0 – ka, k – const Vот.
Рисунок. Стационарное состояние в т. а отвечает условию, что V = cosnt = 0. В стационарной точке da/dt = 0. Количество вещества в системе постоянно. Качетвенный анализ дается графическим методом. Случайные отклонения а будут компенсироваться системой. Стационарное состояние а устойчиво.
