- •Методические указания
- •4.2. Методы контроля. Биологические и микробиологические факторы Лабораторная диагностика гельминтозов и протозоозов
- •Область применения
- •Раздел 1. Лабораторная диагностика
- •1.1. Лабораторная диагностика кишечных гельминтозов
- •Отбор проб и условия доставки биологического материала в лабораторию для паразитологического исследования
- •Отбор проб кала
- •1.1.1.2.2. Методы седиментации Метод формалин-эфирной или уксусной седиментации
- •1.1.1.2. Микроскопические методы
- •1.1.1.2.1. Метод толстого мазка под целлофаном по Като и Миура
- •1.1.1.2.3. Модификация метода седиментации с применением одноразовых концентраторов "parasep"
- •1.1.1.2.4. Модификация метода седиментации с применением минисистемы "Real"
- •1.1.1.2.5. Методы исследования кала с применением флотационных растворов
- •1.1.1.3. Методы исследования кала на личинки гельминтов Метод Бермана
- •Метод Бермана в модификации Супряги
- •Метод Харада-Мори в модификации Маруашвили (метод культивирования личинок на фильтровальной бумаге)
- •1.1.1.4. Методы исследования перианальных отпечатков
- •Метод исследования перианального отпечатка с применением липкой ленты по Грэхэму
- •Метод исследования перианального отпечатка с применением стеклянных глазных палочек с клеевым слоем по Рабиновичу
- •1.1.1.6. Методы исследования желчи дуоденального содержимого (желчи, мокроты, лаважной жидкости и мочи)
- •Методы исследования дуоденального содержимого (желчи)
- •Методы исследования желчи с центрифугированием
- •Методы исследования мокроты и лаважной жидкости
- •Методы исследования нативного мазка мокроты
- •Методы исследования нативного мазка мокроты и лаважной жидкости с центрифугированием
- •Методы исследования мочи
- •Метод концентрации мочи
- •Метод фильтрации мочи
- •1.1.2. Диагностические признаки возбудителей гельминтозов
- •1.2.2. Лабораторная диагностика альвеолярного эхинококкоза
- •1.2.3. Метод исследования жизнеспособности паразита in vivo (биопроба)
- •1.3. Лабораторная диагностика трихинеллеза
- •1.3.1. Метод трихинеллоскопии
- •Компрессорная трихинеллоскопия
- •1.3.2. Методы переваривания в искусственном желудочном соке Классический метод переваривания по Березанцеву ю.А.
- •Ускоренный метод переваривания по Владимировой п.А.
- •1.4. Лабораторная диагностика филяриозов
- •1.4.1. Лабораторная диагностика онхоцеркоза
- •Метод исследования необогащенного нативного препарата
- •Метод исследования обогащенного препарата
- •1.4.2. Лабораторная диагностика филяриозов лимфатической системы (вухериоза и бругиоза)
- •Метод исследования нативного мазка крови из пальца
- •Микрокапиллярный метод обнаружения живых микрофилярий по Супряге
- •Методы исследования венозной крови
- •Метод концентрации микрофилярий в осадке по Кнотту
- •Метод мембранной фильтрации микрофилярий по Беллу, модифицированный Супрягой и Андреенковым
- •Микроскопическое исследование препаратов крови
- •1.4.3. Методы диагностики подкожного дирофиляриоза
- •1.4.4. Диагностика сердечно-легочного дирофиляриоза
- •Раздел 2. Лабораторная диагностика протозоозов
- •2.1. Лабораторная диагностика протозойных инфекций кишечника
- •2.1.1. Микроскопические методы исследования кала на простейшие кишечника
- •Основные методы исследования кала на простейшие кишечника
- •2.1.2. Специальные методы исследования кала на простейшие кишечника
- •Метод приготовления влажного мазка нативного кала с физиологическим раствором, растворами Люголя и метиленового синего
- •Методы приготовления постоянных окрашенных препаратов кала
- •Метод окрашивания трихромовой краской
- •Модифицированный метод окрашивания по Цилю-Нильсену
- •2.1.3. Диагностические признаки трофозоитов и цист кишечных простейших
- •2.1.4. Экспресс-тест для определения антигенов лямблий и криптоспоридий в пробах кала
- •2.2. Лабораторная диагностика трипаносомозов
- •2.2.1. Метод исследования нативных препаратов крови
- •Метод исследования толстой капли
- •2.2.2. Метод исследования неокрашенных мазков из лимфатических узлов
- •2.2.3. Метод исследования неокрашенных мазков из спинно-мозговой жидкости
- •2.2.4. Диагностические признаки возбудителей трипаносомоза
- •2.3. Лабораторная диагностика лейшманиозов
- •Отбор проб биологического материала на наличие возбудителей кожного лейшманиоза
- •Отбор проб биологического материала на наличие возбудителей висцерального лейшманиоза
- •2.3.1. Микроскопические методы исследований на лейшманиозы
- •2.3.2. Посев возбудителей лейшманиозов на питательную среду с последующим культивированием
- •Приготовление питательной среды
- •2.3.3. Диагностические признаки возбудителей лейшманиозов
- •Раздел 3. Автоматизированные системы микроскопирования с программным модулем "Паразитология"
- •Раздел 4. Лабораторная диагностика паразитозов методом полимеразной цепной реакции (пцр-диагностика) Введение
- •Аппаратура, материалы, лабораторная посуда, реактивы
- •4.1. Подготовка к анализу
- •4.1.1. Проведение анализа. Выделение днк. Метод выделения днк с помощью набора Diatom dna Prep 100/200
- •Амплификация
- •4.1.2. Проведение электрофореза в агарозном геле
- •4.2. Полимеразная цепная реакция и рестрикция (пцр) на идентификацию возбудителей лейшманиозов Аппаратура, материалы, лабораторная посуда, реактивы для пцр-исследования и рестрикции
- •4.2.1. Проведение полимеразной цепной реакции (пцр) Выделение днк
- •4.2.2. Выделение днк коммерческим набором*
- •Амплификация
- •Реакционная смесь для пцр
- •Условия амплификации
- •Проведение электрофореза в агарозном геле
- •Рестрикционный анализ
- •Реакционная смесь для рестрикции
- •Размеры фрагментов рестрикции
- •Информативность микроскопических методов исследований
- •Морфологическое строение яиц гельминтов
- •Взрослые особи возбудителей нематодозов
- •Морфологическое строение зрелых члеников цестод
- •Морфологическое строение личинок нематод
- •Морфологическое строение кишечных простейших
- •Морфологическое строение микрофилярий
- •Диагностические признаки взрослых дирофилярий
- •I. Химические консерванты, применяемые для консервации и хранения половозрелых гельминтов или их фрагментов, яиц и личинок гельминтов
- •II. Обесцвечивающий раствор спиртовой уксусной кислоты (n 1):
- •III. Раствор буферного метиленового синего (n 2)
- •IV. Буферный раствор для окраски по Романовскому-Гимза
- •Реагенты, растворы и методы их приготовления
- •V. Раствор глицерина с малахитовым зеленым или раствор глицерина с метиленовым синим:
- •VI. Спиртовый раствор йода:
- •VII. Раствор Люголя
- •VIII. Фосфатный раствор метиленового синего:
- •XIV. Раствор лимонно-кислого натрия 2%-й:
- •XV. Раствор краски трихром:
- •XVI. Приготовление раствора Като:
- •XVII. Пропись клея для исследования перианальных соскобов на энтеробиоз по методу Рабиновича:
Рестрикционный анализ
Для видовой идентификации образцов лейшманий используют различные методы. Одним из рациональных является рестрикционный анализ. Он особенно удобен для неэндемичных по лейшманиозу стран, когда возможен завоз любого вида лейшманий, а так же стран, где циркулирует не один вид лейшманий. Рестрикционный анализ амплифицируемой ITS1 области позволяет идентифицировать даже неизвестный изолят на уровне вида.
Идентификация вида лейшманий необходима для правильной диагностики и прогнозов болезни, а так же принятия правильного решения относительно лечения и мер контроля.
Рестрикция
Рестрикционный анализ необходимо провести с исследуемыми образцами, показавшими положительный результат. Также необходимо поставить положительный и отрицательный контроля рестрикции.
Для рестрикции использовать энзим Нае III, относящийся к классу рестрикционных эндонуклеаз типа II:
5’ - GG^CC - 3’;
3’ - CC^GG - 5’.
Реакционная смесь для проведения рестрикционного анализа в зависимости от интенсивности ПЦР-продукта (как наблюдали на геле) приведена в табл.5.
Таблица 5
Реакционная смесь для рестрикции
|
|
|
|
|
N п/п
|
Реактивы
|
Объем ITS1-продукта, мкл
|
||
|
|
10
|
15
|
20
|
1
|
10 буфер рестиктазы
|
1,5
|
2,0
|
2,5
|
2
|
Деионизированная вода
|
2,5
|
2,0
|
1,5
|
3
|
Рестрикционный энзим (10 Ед/мкл) НАЕ III
|
1,0
|
1,0
|
1,0
|
4
|
Общий объем
|
15,0
|
20,0
|
25,0
|
Примечание. Общую реакционную смесь готовить из расчета на одну больше необходимого количества проб, т.е. если 5 образцов, приготовьте из расчета на 6, так уменьшаться ошибки пипетки.
1) Для приготовления общей реакционной смеси реактивы в стерильную 0,5 мл микроцентрифужную пробирку вносить на холоде (целесообразно использовать настольный кулер для пробирок).
2) Аккуратно встряхните реакционную смесь и центрифугируйте ее несколько секунд для того, чтобы все капли со стенок опустились.
3) Внесите буфер и воду в пробирку первыми. Если сначала внести энзим, а затем буфер может начаться необратимая денатурация. Не используйте энзима более 10% от финального объема реакционной смеси. Рестриктазу хранить в "ледяном" штативе!
4) Подпишите стерильные 0,5 мл микроцентрифужные пробирки и разлейте по 5 мкл из общей реакционной смеси в каждую пробирку. Добавьте адекватную порцию ITS1 ПЦР-продукта и перемешайте. Центрифугируйте смесь короткое время, чтобы осадить все капли.
5) Инкубируйте при 37 °С в течение 2 ч на водяной бане или термостате.
6) Приготовьте агарозный гель.
Проведение электрофореза
1) После инкубации смешать не более 20 мкл рестрикционного продукта с 3 мкл раствора для нанесения на гель. (Можно добавить раствор в пробирку). Внести смесь в лунки геля. В 2 лунки (чаще в крайние) внести маркеры молекулярной массы (можно 10-100 Вр и 100-1000 Вр).
2) Поместить гель в камеру для электрофореза, заполненную буфером 1 ТБЕ. Толщина слоя буфера над поверхностью геля примерно 2-3 мм.
3) В режиме постоянного напряжения 100 V электрофорез длится примерно 110-130 мин.
4) Гель (без формы) поместить на фильтр трансиллюминатора и просмотреть в проходящем ультрафиолетовом свете.
5) Документировать результат электрофореза - либо на фотопленку "Микрат Изопан" (изопанхроматическая фотопленка чувствительностью 3 ед. ГОСТ, фотографическая широта - 10, разрешение - 300 линий/мм), либо при помощи гельдокументирующей системы. Фотокопия геля должна быть приложена к отчету по идентификации (при цифровой съемке - распечатывается на принтере с разрешением не менее 300 dpi).
Примечание. Клинические образцы и продукты реакций рекомендуется хранить в течение 1 месяца (для повторного анализа в случае возникновения спорных случаев диагностики).
Ожидаемые размеры фрагментов рестрикции представлены в табл.6.
Таблица 6