- •Предисловие
- •Введение
- •Глава 1. Питание микроорганизмов
- •1.1. Транспорт веществ в клетку бактерий
- •1.2. Автотрофные способы питания микроорганизмов
- •1.3. Ассимиляция со2 хемогетеротрофными микроорганизмами
- •Глава 2. Метаболизм микроорганизмов
- •2.1. Общая характеристика типов метаболизма
- •2.2. Общая характеристика энергетического метаболизма
- •2.2.1. Аэробное дыхание
- •2.2.2. Процессы анаэробного дыхания
- •Нитратное дыхание, или денитрификация
- •Сульфатное дыхание, или диссимиляционная сульфатредукция
- •Серное дыхание
- •Карбонатное дыхание
- •Анаэробное дыхание с использованием в качестве акцепторов электронов других неорганических ионов
- •Фумаратное дыхание и другие типы анаэробного дыхания с использованием органических веществ в качестве акцепторов электронов
- •2.2.3. Процессы брожения
- •Спиртовое брожение
- •Молочнокислое брожение
- •Маслянокислое и ацетонобутиловое брожение
- •Пропионовокислое брожение
- •Брожение смешанного типа, или муравьинокислое брожение
- •2.2.4. Неполное окисление органических веществ микроорганизмами
- •2.2.5. Разложение микроорганизмами природных высокополимерных органических соединений
- •Разложение целлюлозы
- •Разложение гемицеллюлоз
- •Разложение крахмала и других глюканов
- •Разложение лигнина
- •Разложение пектиновых веществ
- •Разложение хитина и хитозана
- •2.2.6. Использование белков микроорганизмами
- •Аэробное расщепление аминокислот
- •Сбраживание аминокислот микроорганизмами
- •2.2.7. Использование микроорганизмами азотистых оснований
- •Анаэробное разложение (сбраживание) азотистых оснований
- •Аэробное окисление азотистых оснований
- •2.2.8. Окисление липидов и фосфолипидов микроорганизмами
- •2.2.9. Разложение углеводородов микроорганизмами
- •Разложение алканов (парафинов) микроорганизмами
- •Разложение ароматических углеводородов (аренов) микроорганизмами
- •2.2.10. Разложение ксенобиотиков микроорганизмами
- •2.2.11. Окисление неорганических соединений бактериями
- •Процесс нитрификации
- •Окисление восстановленных соединений серы
- •Окисление ионов железа
- •Окисление молекулярного водорода
- •Окисление оксида углерода
- •2.2.12. Использование микроорганизмами одноуглеродных соединений
- •2.2.13. Использование микроорганизмами солнечной энергии
- •Фотосинтез у прокариот
- •Глава 3. Конструктивный метаболизм микроорганизмов
- •3.1. Биосинтез аминокислот
- •3.2. Биосинтез нуклеотидов
- •3.3. Биосинтез липидов
- •3.4. Биосинтез углеводов
- •3.5. Биосинтез пептидогликана
- •Глава 4. Фиксация молекулярного азота (азотфиксация, диазотрофия) микроорганизмами
- •4.1. Биохимия азотфиксации
- •Глава 5. Биолюминесценция бактерий
- •Глава 6. Регуляция метаболизма у бактерий
- •6.1. Регуляция активности ферментов
- •6.2. Регуляция на уровне генов, или регуляция синтеза ферментов
- •Литература
- •Оглавление
Процесс нитрификации
Нитрификация – окисление восстановленных соединений азота (аммиак, азотистая кислота, гидроксиламин и другие неорганические соединения азота). Нитрифицирующие бактерии относятся к протеобактериям и входят в семейство Nitrobacteriaceae, которое состоит из 8 родов.
В природе процесс нитрификации идет в 2 фазы, за каждую из которых ответственны свои возбудители. Первую фазу – окисление солей аммония до солей азотистой кислоты – осуществляют нитрозобактерии, к которым относятся представители родов Nitrosomonas, Nitrosococcus, Nitrosolobus, Nitrosospira и Nitrosovibrio:
NH + 1½ O2 → NO + H2O + 2H+
Вторую фазу – окисление нитритов в нитраты – осуществляют нитробактерии, к которым относятся бактерии родов Nitrobacter, Nitrospina, Nitrococcus:
NO + ½ O2 → NO
Нитрифицирующие бактерии – это грамотрицательные микроорганизмы, различающиеся формой и размером клеток. В эту группу входят бактерии с палочковидной, сферической, спиралевидной, грушевидной формой клеток. Все нитрифицирующие бактерии, кроме представителей рода Nitrobacter, размножаются бинарным делением. Бактерии, принадлежащие к роду Nitrobacter, размножаются почкованием. Среди нитрифицирующих бактерий есть подвижные (с полярным или перитрихиальным жгутикованием) и неподвижные.
Все нитрифицирующие бактерии – облигатные аэробы; большинство – облигатные автотрофы, рост которых ингибируется органическими соединениями в концентрациях, обычных для гетеротрофных прокариот. Ассимиляция СО2 осуществляется в цикле Кальвина.
Оптимальные условия для роста нитрифицирующих бактерий – 25–30 °С и рН 7,5–8,0.
Процесс нитрификации происходит в цитоплазматической мембране. Ему предшествует поглощение NH4+ и перенос его через цитоплазматическую мембрану с помощью медьсодержащей транслоказы.
Как мы уже отметили, процесс нитрификации состоит из 2 фаз:
- окисление аммиака до нитрита;
- окисление нитрита до нитрата.
Окисление аммиака в нитрит осуществляется в несколько этапов. На первом этапе аммиак окисляется до гидроксиламина с помощью фермента монооксигеназы. Этот фермент катализирует присоединение к молекуле аммиака 1 атома кислорода; второй атом кислорода взаимодействует с НАДН, что приводит к образованию Н2О:
NH3 + O2 + НАДH → NH2OH + H2O + НАД+
Этот этап окисления является эндергоническим, так как здесь проис-ходит потребление энергии.
Далее гидроксиламин с помощью гидроксиламиноксидоредуктазы окисляется до нитрита:
N H2OH + O2 NO + H2O + H+
В качестве промежуточного продукта предполагается образование нитроксила:
N H2OH HNO + 2е–+ 2H+
Электроны от NH2OH поступают в дыхательную цепь на уровне цитохрома с и далее на терминальную оксидазу и конечный акцептор – молекулярный кислород.
Транспорт электронов по электронтранспортной цепи, расположенной в цитоплазматической мембране, сопровождается переносом двух протонов через мембрану. Это приводит к созданию протонного градиента и в конечном итоге к синтезу молекул АТФ (в этом процессе участвует фермент АТФ-синтаза).
Вторая фаза нитрификации – окисление нитрита до нитрата – катализируется молибденсодержащим ферментом нитритоксидазой. Это происходит по следующему уравнению:
N O + H2O NO + 2H+ + 2е–
Электроны поступают на цитохром а1 и через цитохром с на терми-нальную оксидазу аа3, где акцептируются молекулярным кислородом. При этом происходит перенос через мембрану двух протонов, что приводит к синтезу АТФ. Схематически вторую фазу нитрификации, осуществляемую нитробактериями, можно представить следующим образом:
Внешняя сторона
Внутренняя сторона
2е–
2Н+ цит. с
цит. а1
NO
+ H2O
NO
2е– 1/2 O2 + 2H+
цит. аа3 H2O
Цитоплазматическая мембрана
Таким образом, суммарно процесс окисления аммиака можно представить в следующем виде:
NH3 → NH2OH → [HNO] → NO → NO
Энергетически выгодными являются только стадии окисления гидроксиламина в нитрит и нитрита в нитрат, так как в результате происходит образование молекул АТФ.
Каким же образом у нитрифицирующих бактерий происходит обра-зование восстановителя НАДН, который необходим для ассимиляции СО2 в цикле Кальвина?
Поскольку субстраты (аммиак, нитриты), которые окисляют нитрифицирующие бактерии, обладают сильно положительным окислительно-восстановительным потенциалом, который для пары NH / NH2OH составляет +899 мВ, для пары NO /NO – +420 мВ, а окислительно-восстановительный потенциал НАД+/НАДН имеет отрицательную величину – 320 мВ, то окисление NH или NO по термодинамическим причинам не может быть прямо связано с восстановлением НАД+. Образование НАДН в таком случае происходит за счет функционирования обратного транспорта электронов, который имеется у нитрифицирующих бактерий наряду с прямым транспортом по дыхательной цепи. Обратный транспорт электронов сопровождается затратой энергии.
Схематически перенос электронов у нитрифицирующих бактерий можно представить следующим образом:
Неорганические доноры электронов
NO , NH3
H2
е–
Цепь переноса электронов
Н
АД+
О2
е–
е–
Обратный транспорт, Прямой транспорт,
сопровождающийся приводящий к получению энергии
затратами энергии
NO , NО
Нитрифицирующие бактерии обнаружены в водоемах разного типа (озера, моря, океаны) и в почвах, где они, как правило, развиваются совместно с бактериями, жизнедеятельность которых приводит к образованию исходного субстрата нитрификации – аммиака.
Процесс нитрификации, являясь важным звеном в круговороте азота в природе, имеет как положительные, так и отрицательные стороны. Переведение азота из аммонийной формы в нитратную способствует обед-нению почвы азотом, потому что нитраты как весьма растворимые соединения легко вымываются из почвы. В то же время известно, что нитраты – это хорошо используемый растениями источник азота. Кроме того, связанное с нитрификацией подкисление почвы улучшает растворимость и, следовательно, доступность некоторых жизненно необходимых элементов, в первую очередь фосфора и железа.
Нитрифицирующие бактерии косвенно участвуют в разрушении разного рода сооружений, для которых строительным материалом служат известь и цемент (т. е. различных зданий, автострад и т. д.). Это связано с тем, что нитрифицирующие бактерии окисляют аммиак, присутствующий в атмосфере или выделяющийся из фекалий животных, до азотной кислоты.
