- •1. Визначення вірусів
- •2. Віруси живі чи неживі
- •3. Відкриття вірусів д.Й. Івановським ( характеристика експериментів)
- •4. Роль д.Й. Івановського та м. Бейєринка в становленні вірусології
- •5. Модельні системи, що використовуються в вірусології
- •6. Основні методи дослідження вірусів
- •Indirect Examination
- •7. Гіпотези походження вірусів
- •8. Роль вірусів в еволюції органічного світу
- •9. Еволюція вірусів та її докази
- •10. Поняття про «прості» та «складні віруси»
- •11. Фінальна стадія взаємодії складного вірусу з клітиною.
- •12. Хімічний (елементарний) склад вірусів.
- •13. Біохімічний склад вірусів.
- •14. Стадії взаємодії вірусу і клітини.( на прикладі бактеріофагу)
- •15. Структурні і не структурні білки вірусів.
- •16. Особливості будови структурних білків вірусів.
- •17. Типи вірусних днк
- •18. Типи вірусних рнк.
- •20. Типи симетрії вірусів.
- •21. Принцип самозбірки вірусів з ротаційно-трансляційним типом симетрії.
- •22. Принцип самозбірки вірусів з ікосаедричним типом симетрії
- •23.Роль зовнішніх факторів в самозбірці віріонів
- •24. Принцип класифікації вірусів.
- •25. Таксономічні категорії вірусів.
- •27. Порівняти таксономії царства « vira» з іншими царствами
- •28. Стадії взаємодії вірусу і клітини.
- •29. Характеристика екліпс-фази.
- •30. Типи генетичних карт у вірусів.
- •31. Генетична карта бактеріофагу т4. Genome and Structure
- •Бактериофаг т4
- •32. Генетична карта бактеріофагу лямбда.
- •33. Інтеграція геному фагу лямбда.
- •34. Генетична карта вірусу sv-40.
- •35. Генетичні карти рнк-вмісних вірусів
- •36. Організація геному втм
- •37. Геном вірусу грипу.
- •38. Реасортація геномів вірусу грипу
- •38. Генетична карта віл
- •39. Принцип методу плр
- •40. Принцип методу іфа
- •Класс I: вирусы, содержащие двуцепочечную днк
- •Класс II: вирусы, содержащие одноцепочечную днк
- •Класс III: вирусы, в которых рнк способна к репликации (редупликации
- •Классы IV и V: вирусы, содержащие одноцепочечную рнк
- •Класс V: вирусы, содержащие одноцепочечную (−)рнк
- •Класс VII: вирусы, содержащие двуцепочечную днк, реплицирующиеся через стадию одноцепочечной рнк
14. Стадії взаємодії вірусу і клітини.( на прикладі бактеріофагу)
Адсорбція (фаг зв’язується з рецепторними ділянками на поверхні бактеріальної клітини)
Проникнення до клітини ( бактеріофаг вводить ДНК у клітину бактерії)
“Роздягання” віріону ( ДНК фага кодує синтез ферментів фага, використовуючи білок синтезуючий апарат клітини хазяїна; бактеріофаг інактивує і розщеплює ДНК хазяїна. ДНК фага підпорядковує собі білоксинезуючий апарат хазяїна)
Екліпс-фаза (транскрипція, реплікація, трансляція) (ДНК фага реп лікується та кодує синтез нових білків оболонки)
Самозбірка вібріону ( утворення нових частинок бактеріофагів)
Вихід вірусу з клітини ( лізис клітини хазяїна: вона руйнується, звільняючи нових фагів, які проникнуть у нові клітини бактерій).
15. Структурні і не структурні білки вірусів.
Вірусні білки, як і клітинні, побудовані з амінокислот і являють собою поліпептидні ланцюги, сформовані у вторинні і третинні структури. Деякі вірусні білки, зокрема капсидні, мають ще й четвертинну структуру. Молекулярна маса вірусних поліпептидів коливається в межах від 8 х 103 до 275 х 103 Д.
У зараженій клітині вірусний геном кодує синтез двох груп білків: 1) структурні, які входять до складу віріонів потомства; 2) неструктурні, які забезпечують процес репродукції вірусу на різних етапах, але до складу віріонів не входять.
Структурні білки. Структурними називають усі білки, що входять до складу зрілих позаклітинних віріонів. Структурні білки у віріоні виконують ряд функцій:
1) захист нуклеїнової кислоти від зовнішніх факторів;
2) взаємодія з мембраною чуттєвих клітин у ході першого етапу їх зараження;
3) взаємодія з вірусної нуклеїновою кислотою в ході і після її упакування в капсид;
4) взаємодія між собою в ході самозбирання капсида;
5) організація проникнення вірусу в чуттєву клітину.
Неструктурні білки. Неструктурні вірусні білки - це всі білки, що кодуються вірусним геномом, але не входять у склад зрілих віріонів. Вони вивчені набагато гірше, ніж структурні, що пов'язано з незрівнянно великими труднощами, що виникають при їх ідентифікації і виділенні в порівнянні зі структурними білками. Неструктурні білки в залежності від їх функцій поділяють на п'ять груп:
1) регулятори експресії вірусного генома;
2) попередники вірусних білків;
3) нефункціональні пептиди;
4) інгібітори клітинного біосинтезу й індуктори руйнування клітин;
5) вірусні ферменти.
16. Особливості будови структурних білків вірусів.
У залежності від розташування того чи іншого білка у віріоні виділяють групи білків:
а) капсидні білки. У віріонах складно організованих вірусів ці білки можуть виконати тільки 2—3 функції - захист нуклеїнової кислоти, здатність до самозбирання і руйнування в ході звільнення нуклеїнової кислоти.
У віріонах простих вірусів їх функції звичайно більш різноманітні;
б) білки вірусної суперкапсидної оболонки. Маються у вірусів, що виходять із клітин шляхом брунькування (параміксо-, ортоміксо-, рабдо-, тога-, бунья-, корона-, аренавіруси). Їх роль зводиться в основному до організації брунькування віріонів, здатності до самозбирання, взаємодії з мембраною чуттєвих клітин, організації проникнення в чуттєву клітину, тобто до F-активності, і захисту нуклеїнової кислоти. Ці білки формують пепломери — білкові вирости на суперкапсидній оболонці - і є, як правило, глікопротеїдами;
в) матриксні білки. Це білки проміжного шару віріонів, розташованого відразу під суперкапсидною оболонкою деяких вірусів. Їх основні функції: організація брунькування, стабілізація структури віріону за рахунок гідрофобних взаємодій, посередництво в здійсненні зв'язку суперкапсидних білків з капсидними;
г) білки вірусних серцевин. Маються в покс-, іридо-, орбі-, рео-, герпесвірусів. Представлені в основному ферментами. Віруси, що мають багатошарові капсиди, можуть мати і захисну роль;
д) білки, асоційовані з нуклеїновою кислотою. Білки самого внутрішнього шару віріонів. Представлені в складних вірусів гістоноподібними білками, ферментами синтезу і модифікації нуклеїнових кислот
