- •Список умовних скорочень
- •Розділ і Огляд літературних джерел
- •1.1 Загальна характеристика а-вірусу винограду
- •Будова віріону а-вірусу винограду
- •1.1.2 Морфологія. Білки та нуклеїнові кислоти
- •Геномна організація
- •1.1.6.1 Головні хвороби
- •1.1.4 Особливості реплікації
- •1.1.5 Біохімічні та біофізичні властивості а-вірусу винограду
- •1.1.6 Симптоматика
- •1.1.6.2 Рослини-господарі і симптоматика
- •1.1.7 Передача а-вірусу винограду
- •1.1.8 Штами
- •Методи діагностики а-вірусу винограду
- •1.2.1 Серологія
- •Умови плр
- •Цикли плр
- •1.2.3 Біотест
- •1.3 Заходи боротьби та профілактики вірусних захворювань винограду
- •1.4 Філогенетичні методи діагностики
- •Розділ 2 Проведення філогенетичного аналізу а-вірусу винограду
- •Розділ 3 з ясування ролі вірусів у біотехнології
- •Висновок
- •Список використаної літератури
Висновок
За результатами проведеного огляду літературних джерел можна зробити наступні висновки:
одними із найнадійніших, найчутливіших і найспецифічніших методів діагностики А-вірусу винограду є серологічні і молекулярно-біологічні. Використання імуноферментного аналізу (ІФА) та полімеразної ланцюгової реакції зі зворотною транскрипцією (ЗТ-ПЛР) уможливлює за короткий термін проведення скринінгу великої кількості зразків та вивчення поширення збудника вірусного захворювань на виноградниках
– полімеразно-ланцюгова реакція дозволяє не просто ідентифікувати А-вірус винограду, а й оцінити суворість штаму;
– дані методи є більш надійними порівняно з іншими методами, включаючи біотест, метод включень та ін;
– при проведенні філогенетичного аналізу нуклеотидних та амінокислотних послідовностей з використанням методів максимальної парсимонії; попарного внутрішньовидового невиваженого середнього (Unweighted Pair-Group Method Using Arithmetic Averages, UPGMA) – модель Кімури і модель Джукса-Кантора та методу максимальної подібності, нами показано, що канадський ізолят А-вірусу винограду найбільш подібний до ізолятів із США, і найбільш віддалений від ізолятів, які походять з Греції.
Список використаної літератури
Вердеревская Т. Д., Маринеску В. Г. Вирусные и микоплазменные заболевания плодовых культур и винограда. – Кишинёв: Штиинца, 1985. – 312 с.
Жунько И. Д. Применение ИФА для выявления вирусов винограда // Виноградарство и виноделие: Сб. науч. тр. ИВиВ «Магарач». – Ялта: ИВиВ «Магарач», 2003. – С. 16–18.
Жунько І.Д., Ліманська Н. В., Мілкус Б. Н., Конуп Л.О. ЗТ-ПЛР ідентифікація представників родів Vitivirus та Foveavirus, що паразитують на винограді // Вісник ОНУ. – 2005. – Т. 10, № 3. – С. 136–142.
Мілкус Б. Н., Конуп Л. О., Жунько І.Д., Ліманська Н. В. Тестування деяких сортів винограду на наявність збудника бактеріального раку і вірусів коротковузля та скручування листя // Мікробіол. журн. – 2005. – Т. 67, № 1. – С. 41–48.
Мілкус Б. Н., Ліманська Н. В., Жунько І.Д., Конуп Л.А., Агєєва О.В. Вірусні та бактеріальні хвороби винограду. – Одеса: Одеса, 2012. – 157 с.
Al Rwahnih. M., Dolja, V.V., Daubert S. Genomic and biological analysis of Grapevine leafroll-associated virus 7 reveals a possible new genus within the family Closteroviridae // Virus Research. – 2012. – V. 163. – P. 302–309.
Andret-Link P., Laporte C., Valat L. et al. Grapevine fanleaf virus: still a major threat to the grapevine industry // J. Plant Pathol. – 2004. – V. 86, № 3. – P. 183–195.
Boscia, Aslouj, Elicio, Savino, Castellano & Martelli, Archives of Virology 127: 185, 1992.
Boscia, Minafra & Martelli, in Filamentous Viruses of Woody Crops, p. 19, ed. P. L. Monette, Trivandrum: Research Signpost, 1997a.
Boscia et al., in Sanitary Selection of the Grapevine. Protocols for the Detection of Viruses and Virus-like Diseases, p. 129, ed. B. Walter, Les Colloques INRA N° 86, Paris: INRA Editions, 1997b.
Boscia D., Digiaro M., Fresno J. et al. ELISA for the detection and identification of grapevine viruses // Sanitary selection of the grapevine: Protocols for detection of viruses and virus-like diseases. – Paris: INRA, 1997. – P. 128–155.
Boulila M. Selective pressure, putative recombination event and evolutionary relationships among members of the family Closteroviridae. A proposal for a new classification // Biochemical Systematics and Ecology. – 2010. – V. 38. – P. 1185– 1192.
Castrovilli & Gallitelli, Phytopathologia Mediterranea 24: 219, 1985.
Conti, Milne, Luisoni & Boccardo, Phytopathology 70: 394, 1980.
Demangeat G., Komar V., Van-Ghelder C. et al. Transmission competency of single-female Xiphinema index lines for Grapevine fanleaf virus // Phytopathology. – 2010. – V. 100. – P. 384–389.
Faoro F., Tornaghi R., Gugerli P. Cytopathology of grapevine leafroll associated virus 1 (GLRaV-1) // Proc. XIth ICVG Meeting (Montreux, Switzerland, 6–9 September 1993). – Montreux, 1993. – P. 19–20.
Fazeli C. F., Rezaian M. A. Nucleotide sequence and organization of ten open reading frames in the genome of grapevine leafroll-associated virus 1 and identification of three subgenomic RNAs // J. Gen. Virol. – 2000. – V. 81. – P. 605– 615.
Fauquet C.M., Mayo M.A., Maniloff J., Desselberger U., Ball L.A. (eds.) (2005): Virus Taxonomy. Eighth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses. Elsevier Academic Press, London.
Fuchs M., Pinck M., Serghini M. A. et al. The nucleotide sequence of satellite RNA in grapevine fanleaf virus, strain F13 // J. Gen. Virol. – 1989. – V. 70. – P. 955– 962.
Galiakparov N., Tanne E., Sela I., Gafny R. Functional analysis of the grapevine virus A genome // Virology. – 2003. – V. 306, № 1. – P. 42–50.
Gambino G., Angelini E., Gribaudo I. Field assessment and diagnostic methods for detection of grapevine viruses // Methology and results in grapevine research. – Vienna: Springer, 2011. – P. 211–228.
Gambino G., Cuozzo D., Fasoli M. et al. Effects of grapevine rupestris stem pitting-associated virus on Vitis vinifera L. // Proc. 17th ICVG Congress (Davis, California, USA, 7-17th October 2012). – Davis, 2012. – P. 90–91.
Goszczynski D. E. Divergent molecular variants of grapevine virus B (GVB) from corky bark (CB)-affected and CB-negative LN33 hybrid grapevines // Virus Genes. – 2010. – V. 41. – P. 273–281.
Graniti & Martelli, Proceedings of the International Symposium on Virus and Vectors on Perennial Hosts with Special reference to Vitis, Davis 1965 : 168, 1965.
Gugerli P. 25 years of serological identification of grapevine leafroll-associated viruses: antiserum and monoclonal antibodies to GLRaV-1 to GLRaV-9 // Proc. 16th ICVG Meeting (Dijon, France, 31thAugust-4thSeptember 2009). – Dijon 2009. – P. 24–28.
Guta I. C., Buciumeanu F. C. Grapevinen chemotherapy for elimination of multiple virus infections // Romanian Biotechnolgical Letters. – 2011. – V. 16. – P. 6535–6539.
Hadidi, A., Khetarpal, R. and Koganezawa, H. (1998) Plant Virus Disease Control. Chapter: 20. APS Press. The American Phytopathological Society.St. Paul, MN
Haviv S., Moskovitz Y., Mawassi M. The OFR3-encoded proteins of vitiviruses GVA and GVB induce tubule-like and punctate structures during virus infection and localize to the plasmodesma // Virus Research. – 2012. – V. 163. – P. 291–301.
Hommay G., Komar V., Lemaire O.et al. Grapevine virus A transmission by larvae of Parthenolecanium corni // Eur. J. Plant Pathol. – 2008. – V. 121. – P. 185–188.
Jelkmann W., Mikona C., Turturo C. et al. Molecular characterization and taxonomy of grapevine leafroll-associated virus 7 // Arch. Virol. – 2012. – V. 157. – P. 359–362.
King A., Adams M. J., Carstens E. B., Lefkowitz E. J. Virus taxonomy: Classification and Nomenclature of Viruses: Ninth report of the International Committee on Taxonomy of Viruses. – London: Elsevier – Academic Press, 2011. – 1327 p.
Konup L., Limanskaja N., Zhunko I., Milkus B. The production of grapevine certified planting material in the Ukraine // Proc. 14th ICVG Meeting (Locorotondo, Italy, 12–17th September 2003). – Locorotondo, 2003. –P. 164.
Le Maguet J. L., Beuve M., Herrbach E. et al. Transmission of six ampeloviruses and two vitiviruses to grapevine by Phenacoccus aceris // Phytopathology. – 2012. – V. 102. – P. 717–723.
Ling K. S., Zhu H. Y., Gonsalves D. Complete nucleotide sequence and genome organization of grapevine leafroll-associated virus 3, type member of the genus Ampelovirus // J. Gen. Virol. – 2004. – V. 85. – P. 2099–2102.
Little A., Rezaian M. A. Gene function analysis and improved detection of Grapevine leafroll associated virus 1 // Proc. 14th ICVG Meeting (Locorotondo, Italy, 12–17th September 2003). – Locorotondo, 2003. – P. 35.
Mannini F. Virus elimination in grapevine and crop performance // Proc. 14th ICVG Meeting (Locorotondo, Italy, 12–17th September 2003). – Locorotondo, 2003. – P. 234–239.
Martelli G. P.(Ed.). Graft-transmissible diseases of grapevines: Handbook for detection and diagnosis. – Rome: FAO Publication Division, 1993. – 263 p.
Martelli G. P., Sabanadzovic S., Abou Ghanem-Sabanadzovic N., Saldarelli P. Maculavirus, a new genus of plant viruses // Arch. Virol. – 2002. – V. 147, № 9. – P. 1847–1853.
Martelli G. P. Grapevine virology highlights: 2010–2012 // Proc. 17th ICVG Congress (Davis, California, USA, 7-17th October 2012). – Davis, 2012. – P. 13–31.
Martelli, Candresse & Namba, Archives of Virology 134: 451, 1994.
Meng B., Li C., Wang W. et al. Complete genome sequences of two new variants of grapevine rupestris stem pitting-associated virus and comparative analyses // J. Gen. Virol. – 2005. – V. 86, № 5. – P. 1555–1560.
Minafra A., Saldarelli P., Martelli G.P. (1997): Grapevine virus A: nucleotide sequence, genome organization, and relationships in the Trichovirus genus. Archives of Virology, 142: 417–423
Palestinian Central Bureau of Statistics. Agricultural Statistics 1995/1996.
Pinck L. The grapevine fanleaf Nepovirus challenge: where do we stand? // Proc. XIIIth ICVG Meeting (Adelaide, Australia, 12–17 March 2000). – Adelaide, 2000. – P. 60–62.
Ra’ed Al-Kowni. (1997) Institute agronomique Mediterraneen De Bari. M. Sc Thesis.
Ritzenthaler C., Laporte C., Gaire F. et al. Grapevine fanleaf virus replication occurs on endoplasmic reticulum-derived membranes // J. Virol. – 2002. – V. 76, № 17 – P. 8808–8819.
Rosciglione & Castellano, Phytopathologia Mediterranea 24: 186, 1985.
Rowhani A., Golino D. A., Sim S. T. et al. Grapevine leafroll associated viruses effects on yield, vine performance and grape quality // Proc. 17th ICVG Congress (Davis, California, USA, 7-17th October 2012). – Davis, 2012. – P. 52–53.
Roy A. S. EPPO certification scheme for grapevine // Proc. 14th ICVG Meeting (Locorotondo, Italy, 12–17th September 2003). – Locorotondo, 2003. – P. 149.
Sabanadzovic S., Abou Ghanem-Sabanadzovic N., Saldarelli P., Martelli G. P. Complete sequence and genome organization of grapevine fleck virus // J. Gen. Virol. – 2001. – № 82. – P. 2009–2015.
Schterenberg P.M., Milkus B.N., Berezovskaja E.A. Virusnije bolezni vinograda // Zaschita rastenij. – 1971. - V. 8, 5. – P. 18-19
Serghini M. A., Fuchs M., Pinck M. et al. RNA 2 of grapevine fanleaf virus: sequence analysis and coat protein cistron location // J. Gen. Virol. – 1990. – V. 71, № 7 – P. 1433–1441.
Shi B. J., Habili N., Symons R. H. Nucleotide sequence variation in a small region of the grapevine fleck virus replicase provides evidence for two sequence variants of the virus // Annals of Applied Biol. – 2003. – V. 142. – P. 349–355.
Stewart S., Nassuth A. RT-PCR based detection of Rupestris stem pitting associated virus within field grown grapevine throughout the year // Plant Disease. – 2001. – V. 85, № 6. – P. 617–620.
Tamura K., Dudley J., Nei M., Kumar S. (2007): MEGA4: Molecular evolutionary genetics analysis (MEGA) software version 4.0. Molecular Biology and Evolution, 24: 1596–1599.
Tsay C. W., Rowhani A., Golino D. A. et al. Mealybug transmission of grapevine leafroll viruses: an analysis of virus-vector specificity // Phytopathology. – 2010. – V. 100. – P. 830–834.
Virus_Taxonomy_Classification_and_Nomenclature_of_Viruses_1_/ [C.M. Fauquet, M.A. Mayo, J. Maniloff, U. Desselberger and L.A. Ball (2005) ] – 2005 – 1221-1223 p.
Walter B.(Ed.). Sanitary selection of the grapevine: Protocols for detection of viruses and virus-like diseases. – Paris: INRA Editions, 1997. – 225 p.
Zorloni A, Prati S, Bianco P.A, Belli G. Transmission of Grapevine virus A and Grapevine leafroll-associated virus 3 by Heliococcus bohemicus // J. Plant Pathol. – 2006. – V. 88, № 3. – P. 325–328.
Zhun’ko I. D., Limanska N. V., Milkus B. N. The spread of grapevine viruses on the South Ukraine // Вісник КНУ імені Тараса Шевченка . – 2008. – Т. 51. – С. 56–57.
Биотехнология. [Електронний ресурс] – Режим доступу до ресурсу: http://myreferat.net/referats/20/3025/?page=1
Вирусные заболевания винограда. [Електронний ресурс] – Режим доступу до ресурсу: http://vinograd.info/info/raznoe/virysnye-zabolevaniya-vinograda.html
Использование вирусов и бактериофагов в биотехнологии. [Електронний ресурс] – Режим доступу до ресурсу: http://www.studfiles.ru/preview/3577628/
Grapevine virus A. [Електронний ресурс] – Режим доступу до ресурсу: http://www.dpvweb.net/dpv/showadpv.php?dpvno=383
Vitivirus . [Електронний ресурс] – Режим доступу до ресурсу: http://viralzone.expasy.org/all_by_species/270.html
