Нуклеиновые кислоты

№122

Установите структуру нуклеотида, имеющего молекулярную формулу С₁₀Н₁₄N₅О₈Р.

№123

Установите структуру нуклеотида, имеющего молекулярную формулу С₁₀Н₁₄Н₅О₆Р.

№124

Установите структуру нуклеотида, имеющего молекулярную формулу С₉Н₁₄Н₃О₈Р.

№125

В одной из цепей ДНК аденина 29% (мольная доля), гуанина 26%, тимина 21%. Определите мольное содержание оснований в комплиментарной цепи.

№126

Органическое основание X образуется при гидролизе некоторых нуклеотидов. При полном сгорании 1,68 г этого основания образовалась газовая смесь, которую пропустили через трубку с негашеной известью (оксидом кальция). Масса трубки увеличилась на 3,18 г. Содержимое трубки промыли большим количеством воды. Масса нерастворившегося остатка составила 6,00 г. Установите структурную формулу вещества Х.

№127

При обработке продуктов гидролиза 4,83 г дезоксирибонуклеотида, содержащего 8,70% азота по массе, избытком известковой воды выпало 2,325 г осадка. Установите структурную формулу дезоксирибонуклеотида и напишите уравнения реакций.

№128

При жестком кислотном гидролизе РНК, молекула которой содержит 42 нуклеотида получено 31,5 г рибозы, 6,75 г аденина, 9,06 г гуанина и 8,4 г урацила. Определите нуклеотидный состав РНК и рассчитайте массу фосфорной кислоты.

№129

Некоторый дезоксирибонуклеотид содержит 8,7% азота по массе. Образец этого нуклеотида массой 9,66 г гидролизовали и продукты гидролиза обработали избытком раствора гидроксида бария, при этом выпало 9,015 г осадка. Напишите структурную формулу дезоксирибонуклеотида и уравнения химических реакций.

№130

При обработке продуктов гидролиза 3,63 г рибонуклеотида, содержащего 19,28 % азота по массе, избытком известковой воды выпало 1,55 г осадка. Установите структурную формулу рибонуклеотида и напишите уравнения реакции.

№131

При обработке продуктов гидролиза 1,655 г дезоксирибонуклеотида, содержащего 21,15 % азота по массе, избытком известковой воды выпало 0,775 г осадка. Установите структурную формулу дезоксирибонуклеотида и напишите уравнения реакции.

№132

При обработке продуктов гидролиза 4,83 г дезоксирибонуклеотида, содержащего 8,7 % азота по массе, избытком известковой воды выпало 2,325 г осадка. Установите структурную формулу дезоксирибонуклеотида и напишите уравнения реакции.

№133

При обработке продуктов гидролиза 6,14 г дезоксирибонуклеотида, содержащего 13,68 % азота по массе, избытком известковой воды выпало 3,10 г осадка. Установите структурную формулу дезоксирибонуклеотида и напишите уравнения реакции.

№134

Какая доля (в процентах) объема клетки Е. coli приходится на рибосомы (их количество 15 000)? Диаметр рибосом Е. coli составляет примерно 18 нм (условно можно принять, что они имеют сферическую форму).

№135

Рассчитайте концентрацию (моль/л) растворов при рН 7,0 и толщине слоя раствора 1,0 см, используя указанные выше значения молярного коэффициента поглощения: а) для раствора гуанина А = 0,325; б) для раствора тимина А = 0,09.

№136

Рассчитайте значение оптической плотности при К - 260 нм для водного раствора, содержащего аденин в концентрации 4,8∙10^-5 моль/л и урацил (3,2∙10^-5 моль/л).

№137

Единичная молекула ДНК в хромосоме Е. coli (Mr = 2800∙10³) содержит около 4,5 млн мононуклеотидных единиц, длина каждой из них составляет примерно 0,34 нм. Вычислите общую длину молекулы ДНК.

№138

Вычислите среднее число нуклеотидных пар в расчете на один микрометр двойной спирали ДНК.

№139

Вычислите среднее число нуклеотидных пар в расчете на 1∙106 единиц массы двойной спирали ДНК.

№140

Вычислите среднюю длину (в нанометрах) и среднюю молекулярную массу генов, координирующих: а) тРНК (90 мононуклеотидных остатков); б) рибонуклеазу (124 аминокислотных остатка); в) миозин (1800 аминокислотных остатков).

№141

Вычислите массу (в граммах) двойной спирали ДНК, имеющей длину, равную расстоянию от Земли до Луны (384 000 км).

№142

Сравните длину гена с длиной кодируемой этим геном полипептидной цепи, содержащей 150 аминокислотных остатков и находящейся в -спиральной конфигурации.

№143

Валиновая тРНК из дрожжей, первичная структура которой расшифрована А.А. Баевым и его сотрудниками, содержит 77 нуклеотидных остатков в молекуле.

Акцепторный конец этой тРНК биспирализован в наибольшей степени - 7 пар нуклеотидов. В антикодоновой петле заспирализовано 5 пар нуклеотидов. «Псевдоуридиновая» петля также имеет 5 пар нуклеотидов, соединенных водородными связями. В «дигидроуридиновой» петле биспирализованная часть содержит 3 пары нуклеотидных остатков. Рассчитайте в процентах долю нуклеотидных остатков, находящихся в биспирализованных областях молекулы и поддерживающих вторичную структуру дрожжевой валиновой тРНК.

№144

Определите отношение А/Т, Г/Ц, (А + Т)/(Г + Ц) во вновь образованном полинуклеотидном фрагменте после однократной репликации олигонуклеотида состава АЦАТАЦГАТ, если в качестве затравки использованы все четыре дезоксинуклеозидтрифосфата.

№145

Рассчитайте нуклеотидный состав участка двухцепочечной ДНК, если в мРНК содержание аденина, цитозина, гуанина и урацила составляет 21, 25, 24 и 30 % соответственно.

№146

Рассчитайте среднюю длину (в миллиметрах) двухцепочечных молекул ДНК, находящихся в одной клетке, если количество нуклеотидных пар в составе клеточной ДНК следующее, млн.: а) млекопитающие - 5500; б) амфибии - 6500; в) рыбы и птицы - 2000; г) ракообразные - 2800; д) моллюски - 1100; е) губки - 100; ж) грибы – 20. №147

Рассчитайте объем молекулы ДНК (в кубических нанометрах) с молекулярной массой 500 000, если она имеет форму цилиндра.

№148

АТФ может быть получен из других макроэргических соединений, называемых АТФ-генерирующими веществами, например: а) креатинфосфат + АДФ  АТФ + креатин; б) фосфоэнолпировиноградная кислота + АДФ  АТФ + пировиноградная кислота; в)1,3-дифосфоглицериновая кислота +АДФАТФ + 3-фосфоглицериновая кислота. Напишите уравнения этих реакций.

№149

Рассчитайте число нуклеотидных пар в отрезке двойной спирали ДНК длиной 1 мкм, находящейся: а) в А-форме и б) в В-форме.

№150

В-форма кристаллической ДНК устойчива в условиях 97%-ной относительной влажности. Если влажность понизить до 76%, то происходит резкий переход В-формы ДНК в А-форму. Вычислите, на какую величину (мкм) изменится длина фрагмента ДНК, относительная молекулярная масса которого равна 1000000, если из В-формы он перейдет в А-форму.

№151

Рассчитайте среднюю длину (мм) двухцепочечных молекул ДНК, находящихся в одной клетке у различных представителей животного мира, если известно количество нуклеотидных пар (в млн.) в составе клеточной ДНК: а) млекопитающие - 5500; б) амфибии - 6500; в) рыбы - 2000; г) птицы - 2000; д) ракообразные - 2800; е) моллюски - 1100; ж) губки - 100; з) грибы - 20; и) бактерии - 2.

№152

Клетка печени крысы содержит 9,1∙10¹² г ДНК. Допуская, что вся ДНК равномерно распределена между 42 хромосомами и существует в каждой хромосоме в виде единой молекулы, рассчитайте длину двухцепочечной ДНК, находящейся в одной хромосоме, принимая значение постоянной Авогадро равным 6∙10²³ моль.

№153

Относительная молекулярная масса фрагмента ДНК равна 500000. Рассчитайте объем фрагмента молекулы ДНК при условии, что она имеет форму цилиндра.

№154

В составе рибосомы кишечной палочки содержится по одной молекуле 23S, 16S и 5S РНК. Рассчитайте процентное соотношение трех видов РНК в рибосоме кишечной палочки.

№155

Валиновая тРНК из дрожжей, первичная структура которой расшифрована А. А. Баевым и его сотрудниками, содержит 77 нуклеотидных остатков в молекуле.

Акцепторный конец этой тРНК биспирализован в наибольшей степени - 7 пар нуклеотидов. В антикодоновой петле в спирализованной области находятся 5 пар нуклеотидов, сочетающихся водородными связями. В дигидроуридиновой петле биспирализованная часть включает 3 пары нуклеотидных остатков. Рассчитайте в процентах долю нуклеотидных остатков, находящихся в биспирализованных областях молекулы и поддерживающих вторичную структуру дрожжевой валиновой тРНК.

№156

Рассчитайте коэффициент молярной экстинкции аденина, если раствор, содержащий 500 мкг аденина в 100 мл 0,1 н. раствора гидроксида натрия, имеет оптическую плотность 0,458 при 262 нм (ширина кюветы равна 1 см). Относительная молекулярная масса аденина 135.

№157

Водный раствор, содержащий 57,8 мг/л натриевой соли УТФ, имеет оптическую плотность 1,014 при 262 нм (рН 7,0). Вычислите коэффициент молярной экстинкции указанного вещества в этих условиях. Относительная молекулярная масса натриевой соли УТФ равна 586.

№158

Коэффициент молярной экстинкции аденина в 0,1 н. растворе соляной кислоты при 262,5 нм равен 13,4∙10³ л/моль/см. Вычислите значение оптической плотности раствора аденина, содержащего 5 мкг основания в 1 мл раствора. Относительная молекулярная масса аденина равна 135.

№159

Рассчитайте молярную концентрацию: а) раствора гуанина, если оптическая плотность его при 260 нм и рН 7,0 равна 0,625; б) раствора тимина, если оптическая плотность его при 260 нм и рН 7,0 ,равна 0,075. Ширина кюветы 1 см. Коэффициент молярной экстинкции гуанина равен 7,2∙10³ л/(моль∙см); тимина — 7,4- 103 л/(моль-см).

№160

Укажите соединения, которые образуются в результате действия на олигорибонуклеотиды ЦфУфАфЦфАфГфУфГ и фГфУфАфГфАфАфЦфУфГ:

а) фосфодиэстеразы змеиного яда; б) панкреатической РНКазы; в) РНКазы Т 1; г) РНКазы Т 2; д) разбавленного раствора щелочи.

№161

Укажите соединения, которые образуются в результате действия на олигодезоксирибонуклеотиды фТфГфАфЦфАфТфЦфГфА и ТфАфГфГфЦфТфЦф: а) фосфодиэстеразы змеиного яда; б) ДНКазы I и фосфодиэстеразы из селезенки; в) ДНКазы II и диэстеразы змеиного яда; г) разбавленного раствора щелочи.

№162

Олигорибонуклеотид состава А2Ц4Г2У был инкубирован раздельно с тремя ферментами. Обработка олигорибонуклеотида панкреатической РНКазой дала 2 моль Цф; динуклеотид, содержащий А и У; динуклеотид, содержащий Г и Ц; тринуклеотид, содержащий Г, А, Ц и гуанозин. Обработка такадиастазой дала фЦ, фА, фГф и 2 нуклеотида, один из которых содержит А и Ц, а другой - Ц, У и Г. Кратковременная инкубация олигонуклеотида с фосфодиэстеразой змеиного яда выявила наличие фЦ. На основании данных определите первичную структуру олигонуклеотида.

№163

Укажите роль 5-фосфорибозил-1-пирофосфата в биосинтезе пуриновых и пиримидиновых нуклеотидов и напишите уравнения соответствующих реакций.