Задачи для самостоятельного решения

1. Дипептид карнозин, найденный в мышцах человека, представляет собой -аланил-гистидин. Напишите его структуру, определите рН в растворе пептида, его изоэлектрическую точку и суммарный заряд при рН 7,3-7,5.

2. В регуляции кровяного давления важнейшую роль играет ангиотензин II-линейный октапептид, который образуется из декапептида ангиотензина I путем отщепления дипептидного фрагмента Гис-Лей. Напишите структуру этого дипептида. Определите рН в его растворе и его изоэлектрическую точку и суммарный заряд в крови (рН 7,3-7,5).

3. Смесь пяти пептидов Р₁, Р₂, Р₃, Р₄;. Р₅ подвергалась электрофорезу при рН 8,5. После окончания разделения и окраски получена электрофореграмма, показанная на рисунке. Все пептиды имели одинаковую молярную массу. Зная рI каждого пептида (9,0 для Р₁; 5,5 для Р₂; 10,2 для Р₃; 8,2 для Р₄, 7,2 для Р₅). Определите, какая зона соответствует каждому пептиду.

4. После 10-летнего тщательного испытания в США разрешено использовать аспартам в качестве низкокалорийной добавки для придания продуктам сладкого вкуса (в 200 раз слаще сахара). По химической природе аспартам представляет собой метиловый эфир дипептида L-аспартил-L-фенилаланина. Напишите его структуру и схему образования метилового эфира из соответствующего дипептида. Укажите механизм реакции.

5. Глутатион защищает SH-группы белков в организме от окисления. Трипептид глутатион (-глутамилцистеинилглицин) отличается по строению от других пептидов тем, что глутаминовая кислота в его составе представляет для образования пептидной связи не -карбоксильную, а -карбоксильную группу. Напишите его структуру, предположите за счет какой функциональной группы он может проявлять окислительно-восстановительные свойства, напишите схему окислительно-восстановительной реакции.

6. Тетрапептид тафцин является регулятором иммунной системы, обладает противоопухолевым и антибактериальным действием. Он имеет следующее строение: Тир-Лиз-Про-Арг. Определите область рН в изоэлектрической точке данного тетрапептида и его заряд в крови (рН 7,3-7,5).

7. Напишите продукты гидролиза пептида в присутствие ВrCN и трипсина:

Гли–Мет–Гли–Фен–Ала–Вал–Арг–Мет–Лей–Тир–Лиз–Гли–Ала.

Поясните роль частичного гидролиза в определении первичной структуры пептидов и белков.

8. В автоматическом приборе секвенаторе для определения аминокислотной последовательности пептидов используется метод Эдмана. Полученное на каждой стадии расщепления фенилтиогидантоиновое (ФТГ) производное идентифицируется методом хроматографии. Напишите схемы реакций, протекающих при расщеплении трипептида Лиз-Асп-Вал по методу Эдмана. Чем различаются ФТГ-производные аминокислот?

9. Пентапептид при полном гидролизе образует аргинин, аспарагиновую кислоту, лейцин, серин и тирозин. Для определения аминокислотной последовательности провели три последовательных расщепления по Эдману. После первого расщепления в составе пептида остались Арг, Асп, Лей, Сер, после второго-Арг, Асп, Сер, после третьего-Арг и Сер. Какова последовательность пентапептида? Напишите его структуру и приведите схему определения N-концевой аминокислоты по Эдману.

10. В 1995 году открыта группа пептидов, которые оказывают влияние на передачу нервных импульсов (энкефалины, опиатные пептиды). Первыми в этой группе открыты два пентапептида, оказывающих сильный обезболивающий эффект. Напишите структуру этих пептидов по указанной последовательности аминокислот. Определите рН среды в их растворе и изоэлектрическую точку пептидов.

а) Тир-Гли-Гли-Фен-Мет

б) Тир-Гли-Гли-Фен-Лей.

11. Гормон гипофиза вазопрессин имеет следующую последовательность аминокислот: Цис-Тир-Фен-Глн-Асн-Цис-Про-Арг-Глу. Прогнозируйте связи, которые могут фиксировать вторичную и третичную структуры данного пептида. Изобразите их схематично.

12. В фиброине шелка полипептидные цепи имеют вторичную структуру в виде антипараллельной -структуры. Изобразите схематично ее строение, укажите типы связи, фиксирующие -структуру.

13. -спиральная вторичная структура полипептидной цепи полностью характерна для -кератина шерсти; в белках миоглобине и гемоглобине содержание -спирали составляет 75% вторичной структуры, в сывороточном альбумине 50%. Изобразите схематично строение -спирали, укажите типы связей, фиксирующие ее.

14. Опишите, что вы знаете о природе различных типов связей и их роли в структуре белков:

а) пептидной связи;

б) дисульфидной связи;

в) водородной связи;

г) электростатических взаимодействий;

д) гидрофобных взаимодействий.

15. Схематично изобразите взаимодействия, фиксирующие третичную структуру белковой молекулы на участке полипептидной цепи:

а) – Цис-Асп-Вал-Цис-Лиз-Вал-

б) – Тир-Арг-Лей-Асп-Глу-Лей-