- •Учреждение образования «Международный государственный экологический университет имени а.Д.Сахарова»
- •Глава 1. Метилирование днк: методы исследования ……………..……........... 37
- •Введение
- •Список сокращений
- •Содержание
- •Раздел 1. Обзор литературы …………………………………………… 8-36
- •Глава 1. Метилирование днк у млекопитающих …………………………… 8-10
- •Глава 2. Метилирование днк: биохимия …………………………................ 13-18
- •Глава 3. Биологическое значение метилирования днк ……………………. 19-22
- •Глава 4. Роль метилирования днк в канцерогенезе ……………………….. 23-36
- •Раздел 2. Материал, методология и методики ………............ 37-45
- •Обзор литературы
- •1. Метилирование днк у млекопитающих
- •1.1 Метилирование днк: общие сведения
- •1.2 Метилирование днк генома млекопитающих
- •1.3 Распределение CpG динуклеотидов в геноме человека
- •1.6 Метилирование одиночных CpG-динуклеотидов
- •2. Метилирование днк: биохимия
- •2.1 Ацетилирование гистонов
- •2.3 Необходимость метилирования днк у эукариот
- •2.4 Dnmtl: днк-метилтрансфераза 1 белок и Dnmt3: днк-метилтрансфераза 3 белок
- •2.5 Метилирование генома как динамический процесс
- •2.6 Метилирование днк: влияние на структуру хроматина
- •3. Биологическое значение метилирования днк
- •3.1 Импринтинг: общебиологический аспект
- •3.2 Регуляция метилирования днк в эукариотических клетках
- •3.3 Метилирование днк во время эмбриогенеза
- •3.4 Регуляция экспрессии с помощью метилирования днк
- •4. Роль метилирования днк в канцерогенезе
- •4.1 Мутации метилированной днк
- •4.2 Региональное гиперметилирование в опухолях
- •4.3 Роль метилирования при канцерогенезе
- •4.4 Нарушения метилирования днк при канцерогенезе
- •4.5 Опухолевые клетки: свойства и метилирование днк
- •4.6 Метилирование CpG-островков в геноме опухлевых клеток
- •4.7 Полное гипометилирование генома и локальное гиперметилирование. Их роль. 5-МеС как эндогенный мутаген
- •4.8 Гены инактивированные метилированием в опухолях
- •Материал, методология и методики
- •1. Метилирование днк: методы исследования: общие сведения
- •1.1 Выделение днк
- •1.2 Бисульфитный метод и постановка амплификации. Определние гиперметилирования генов pten, mgmt, p16.
- •Заключение
- •Список использованных источников
Заключение
В ходе проделанной работы, были изучены основные теоретические аспекты метилирования ДНК: общие сведения, физиологическая роль и роль в канцерогенезе, биохимия метилирования. Значимое место в работе приобрело изучение основных методов исследования метилирования ДНК.
Опираясь на изученный материал, следует отметить, что характерной чертой опухолевых и трансформированных in vitro клеток млекопитающих является дисбаланс метилирования геномной ДНК, который вносит значимый вклад в создание генетической и фенотипической нестабильности. В тоже время, нестабильность 5-МеС в составе CpG динуклеотидов, приводящая к эпимутациям, может иметь тот же конечный итог. Таковым образом, метилирование, являясь эпигенетической модификацией ДНК, может в случае нарушения приводить к генетическим изменениям, делая очевидной взаимосвязь меж генетическими и эпигенетическими действиями при возникновении и развитии опухоли.
Нарушение паттерна метилирования проявляется на ранешних стадиях злокачественной трансформации клеток млекопитающих. С медицинской точки зрения это открывает способности для ранешней диагностики и исцеления заболевания. Тем более, что в различие от мутаций, которые принципиально необратимы, модификации ДНК, хотя и очень стабильны, но принципиально обратимы.
Список использованных источников
1. Гвоздев, В.А. Механизмы регуляции активности генов в процессе транскрипции /В.А. Гвоздёв //Соросовский образовательный журнал. -1996. -№ 2. - С. 22 - 31.
2. Gardiner-Garden, M. CpG islands in vertebrate genomes /M. Gardiner-Garden, [et al.] //Journal Molecular Biology. - 1987. – Vol. 196, №2. – P. 261 - 282.
3. Лихтенштейн, А.В. Метилирование ДНК и канцерогенез /А.В. Лихтенштейн.// Биохимия. – 2001. - № 3, С. 293 – 317.
4. Bestor, T.H. Gene silencing. Methylation meets acetylation / T.H. Bestor, G.L. Verdin : red. T.N Bestor. - New York : Nature Publishing Group, 1998. – Vol. 36, №9, Р. 311 - 312.
5. Киселев, Ф.Л. Метилирование ДНК /Ф.Л. Киселёв.// Молекулярная биология. – 1998. - №32, С. 197 – 205.
6. Greenblatt, M. Mutations in the p53 tumor suppressor gene: clues to cancer etiology and molecular pathogenesis /M.S. Greenblatt, [et al.] //Genome Stability & Expression. - 1994. – Vol.18, №3, – P. 18.
7. Paul, D. Anomalous Rapid Electrophoretic Mobility of DNA /D.Paul, [et al.] // The Journal of Physical Chemistry. – 1995. – Vol. 34, №4. – P. 49.
8. Marnie Blewitt, E. Dynamic Reprogramming of DNA Methylation at an Epigenetically Sensitive Allele in Mice /E.Blevitt, [et al] // Plos Genetics. – 2006. – Vol.2, №2. – P. 399 – 404.
9. Mara Robu E, p53 Activation by Knockdown Technologies /E.Mara Robu, [et al] // Plos Genetics. – 2007. – Vol.3, №4. – P. 787 – 788.
10. Jennifer Jordan J, Noncanonical DNA Motifs as Transactivation Targets by Wild Type and Mutant p53 /J. Jennifer Jordan, [et al] // Plos Genetics. – 2008. – Vol.4, №4.– P. 2 – 5.
11. Veronica Beaudry G, Loss of the p53/p63 Regulated Desmosomal Protein Perp Promotes Tumorigenesis /Veronica Beaudry G, [et al] // Plos Genetics. – 2010. – Vol.6, №4.– P. 12 – 13.
12. Driscoll, B. Methods in Molecular Medicine. Lung Cancer. Molecular Pathology. Methods and Reviews / B. Driscoll, [et al] // Humana Press, – 2004. – P. 391 – 397.
13. Boyd, V. L., Zon, G. Bisulfite conversion of genomic DNA for methylation analysis: protocol simplification with higher recovery applicable to limited samples and increased throughput / V. L. Boyd, G. Zon// The Journal of Analytical Biochemistryю – 2004. – Vol.6, №3. – P. 16-19.
14. Holm, K. RMolecular subtypes of breast cancer are associated with characteristic DNA methylation patterns /R. Holm, [et al] // BioMed Central. – 2010. – Vol.12, №36. – P. 2.
15. Bediaga, N. DNA methylation epigenotypes in breast cancer molecular subtypes /N. Bediaga, [et al] // BioMed Central. – 2010. – Vol.11, №3. – P. 15.