- •II часть
- •1.Миниатюризация
- •1.1.Мотивация проведения исследований в области нт
- •1.2.Планы и стратегия развития
- •1.3.Границы изменения масштабов
- •1.4.Связь размеров структур с их функциональностью
- •1.4.1.Распределение атомов и связанные с этим свойства
- •1.4.2.Отношения величина - свойства
- •2.1.Введение
- •4 Связь размеров структур с их функциональностью
- •2.2.Биологические строительные блоки
- •2.2.1. Размеры строительных блоков и наноструктуры
- •2.2.2.Основные объекты нанобиотехнологии
- •2.2.3.Строительные блоки.Синтетические и биологические.
- •2.3.Принципы самосборки
- •2.3.1.Нековалентные взаимодействия
- •2.3.2.Межмолекулярная упаковка
- •2.3.3.Биологическая самосборка
- •2.4.1.Самосборка (Другой источник информации): Понятия и определения
- •2.4.2.Типы межмолекулярных взаимодействий
- •2.4.3.Измерение свойств веществ в наномировом масштабе.
- •3.Нанобиотехнология
- •3.1.Проблемы определения используемых понятий
- •3.2.Технологии типа от нано к био
- •3.3.Технологии типа от био к нано
- •3.4.Нанобиотехнология и молекулярные устройства
- •3.4.1.Общие вопросы
- •3.1. Основные направления развития биотехнологии
- •3.4.2. Молекулярные устройства.3.4.2.1. Общие вопросы
- •3.4.2.2.Молекулярные пинцеты
- •4.4.2.3.Ротаксаны и катенаны
- •4.4.2.4.Вращательное движение
- •4.4.2.5.Возвратно-поступательное движение
- •4.4.2.6.Схемы сборки путем нанизывания кольцевых молекулярных
- •4.Биотехнология, медицина и здравоохранение
- •4.1. Состояние исследований и разработок
- •4.2. Цели, проблемы и решения
- •4.3. Инфраструктура, стратегия и приоритеты
- •4.4. Достижения и новые парадигмы
- •4.4.1. Изучение особенностей биологических систем
- •4.4.2. Нанонаука и нанотехнология в процессах создания биологических тканей (тканевая инженерия)
- •4.4.3. Биологическое детектирование боевых отравляющих веществ
- •4.4.4. Флуоресцентные биологические метки на основе полупроводниковых нанокристаллов
- •4.5.5. Нанотехнология изготовления днк-чипов
- •4.5.Иомиметические нанотехнологии
- •4.5.1. Днк как строительный материал нанотехнологий
- •4.5.1.1. Направленная сборка с помощью днк
- •4.5.1.2. Днк как шаблон для молекулярной электроники
- •4.5.1.3. Моторы и наномашины на основе днк
- •4.5.2.1. Действие биологических моторов
- •4.5.2.2. Биологические моторы как часть синтетических систем
- •4.5.3. Искусственный фотосинтез
- •4.7. Использование наноустройств в космических исследованиях
- •5.2.1.Основные технические характеристики микроскопа "supra 60vp"
- •5.3. Сканирующая зондовая микроскопия
- •5.3.1. Общие принципы сканирующей зондовой микроскопии
- •5.4.Сканирующая зондовая микроскопия
- •5.5.Сканирующая туннельная микроскопия
- •5.7.Атомно-силовые измерения в биологических системах
- •6. Технология рекомбинантных днк
- •6.1.Векторы для Escherichia coli
- •6.2.Идентификация клонированных днк
- •6.3.Экспрессия эукариотических белков в е. Coli
- •6.4. Генетическая инженерия с участием других клеток-хозяев
- •6.5.Получение инсулина на основе методов генетической инженерии
- •6.6.Синтез соматотропина
- •6.7.Получение интерферонов
- •6.8.Генная инженерия растений
- •6.8.1.Получение трансгенных растений
- •6.8.1.6.Применение методов генетической инженерии для улучшения аминокислотного состава запасных белков растений
- •6.8.1.7.Повышение эффективности процесса фотосинтеза
- •6.8.1.8.Генно-инженерные подходы к решению проблемы усвоения азота
- •6.8.1.9.Устойчивость растений к фитопатогенам
- •6.8.1.10.Устойчивость растений к гербицидам
- •6.8.1.11.Устойчивость растений к насекомым
- •6.8.1.12.Устойчивость растений к абиотическим стрессам
- •6.9.1.Типы питания микроорганизмов
- •6.9.2.Типы энергетического обмена у микроорганизмов
- •6.9.3.Питательные среды для культивирования микроорганизмов
- •6.9.4.Источники углерода
- •6.9.5.Источники азота
- •6.9.6.Источники витаминов, гормонов и микроэлементов
- •6.9.7.Биохимические и биофизические факторы роста
- •6.9.8.Конструирование питательных сред для выращивания микроорганизмов
- •6.9.9.Технология приготовления питательных сред
- •6.9.10.Пастеризация как вариант термической стерилизации
- •6.9.11.Стерилизация фильтрацией
- •6.9.12Особенности культивирования эукариотических клеток в качестве продуцентов.
- •10. Что такое паспорт культуры?
- •1. Каковы причины введения международных правил в фармацевтическую практику?
- •9. Экобиотехнология
- •9.1. Введение
- •9.2. Состояние исследований и разработок
- •9.3. Цели, проблемы и решения
- •9.4. Инфраструктура, стратегия и приоритеты
- •9.5. Достижения и новые парадигмы
- •9.6.Биотехнология утилизации твердых отходов.
- •9.6.1. Биотехнология утилизации твердых отходов
- •9.6.2.Биотехнология очистки сточных вод
- •9.7.Биоэнергетика
- •9.8. Ксенобиотики и их биодеградация
2.3.Принципы самосборки
Термин «самосборка» употребляется в нескольких значениях, зависящих от контекста. Например, в гл. 1 и 3 «самосборка» описывает рост полупроводящих квантовых точек в особом режиме метода МПЭ. В таком контексте «самосборка» относится к спонтанному образованию квантовых точек вследствие особых условий роста (полей деформации) без точно заданных размеров или формы точек. В контексте же молекулярных материалов термин «самосборка» описывает обратимую коллективную сборку предопределенных компонентов в упорядоченную надструктуру. Различают две категории такой самосборки. Статическая самосборка равновесных систем, которые не рассеивают энергию. Образование такой структуры может потребовать энергии, но после образования она остается в устойчивом положении равновесия. При динамической самосборке, напротив, образование надструктуры сопровождается рассеиванием системой энергии. Примером могут послужить структуры, образуемые в ходе превращений и диффузии в системе колебательных химических реакций. Эта глава посвящена материалам, образующим статическую самособирающуюся надструктуру, хотя будут кратко охарактеризованы и возможные способы изготовления наномоторов, которые, разумеется, невозможны без динамической самосборки.
Самосборка в мягких материалах основана на том факте, что флуктуации положений и ориентации молекул или частиц при их броуновском движении имеют энергии, сравнимые с тепловой. Тепловая энергия имеет значительное влияние на мягкие материалы на нанометровом уровне, поскольку слабые не-ковалентные связи легко рвутся и преобразуются. Это позволяет системе достичь термодинамического равновесия, которое зачастую не является однородным состоянием. В силу относительной слабости взаимодействий между молекулами можно легко вынудить систему совершить переход от одной структуры к другой, немного изменив условия, например температуру или рН. Подобные внешние переключатели, вызывающие фазовые переходы, могут приводить к массе чувствительных материалов или, вкупе с подходящим источником энергии, к наномеханическим системам. Фазовые переходы между различными структурами мягких материалов крайне разнообразны, и некоторые из них будут рассмотрены в последующих подразделах.
2.3.1.Нековалентные взаимодействия
Очевидно, для осуществления самосборки необходимо, чтобы силы между молекулами были гораздо слабее ковалентных сил, поддерживающих целостность молекул. Слабые межмолекулярные взаимодействия, ответственные за молекулярное упорядочение в мягких материалах, — это водородные связи, координационные связи в лигандах и комплексах, ионные взаимодействия, дипольные взаимодействия, Ван-дер-Ваальсовы силы и гидрофобные взаимодействия. В этом подразделе они и будут рассмотрены.
Гидрофобный эффект возникает при введении неполярного растворенного вещества в воду. Гидрофобный эффект не надо путать с гидрофобным взаимодействием, которое является следствием ассоциации двух неполярных частей в воде. Гидрофобный эффект принято объяснять упорядочением молекул воды вокруг несвязанной гидрофобной молекулы, что приводит к понижению энтропии. Эта потеря энтропии может компенсироваться при ассоциации гидрофобных молекул в мицеллы, приводящей к возрастанию энтропии, поскольку этот процесс сопровождается разрушением «структурированной воды». Изменение энтальпии при смешивании воды с растворенным веществом также перевешивается возрастанием энтропии так, что изменение свободной энергии Гиббса при мицеллизации оказывается отрицательным. Модель структурированной воды основана на ориентационном упорядочении молекул воды вокруг введенной в раствор молекулы растворенного вещества. Альтернативная модель предлагает объяснение высокой свободной энергии, необходимой для введения неполярного растворенного вещества, трудностью обнаружить полость достаточного размера между маленькими молекулами воды. Однако утверждается, что гидрофобный эффект довольно слабо зависит от размеров, а равно и от формы растворенного вещества.
В биологических системах решающую роль играют водородные связи, поддерживающие целостность большинства белковых структур. Само существование жизни в том виде, как мы ее знаем, зависит от водородных связей, стабилизирующих Н20 в жидком виде. Внутримолекулярные водородные связи между группами N—Ни С^О, отстоящими друг от друга на четыре аминокислотных звена, скрепляют структуру ar-спирали. С другой стороны, водородные связи между соседними пептидными цепями приводят к образованию /?-листов. Аналогично, коллагеновые волокна состоят из тройных спиралей белков, удерживаемых вместе водородными связями. Структура свернутых белков также поддерживается внутренними водородными связями. Чем меньше в свернутом белке водородных связей, тем выше его свободная энергия и тем менее он стабилен. Причина, по которой природа так часто прибегает к водородным связям, состоит в ее особых свойствах. С одной стороны, водородная связь гораздо слабее ковалентной (около 20 кДж/моль водородной связи против порядка 500 кДж/моль ковалентной), поэтому надструктура может образовываться без участия химических реакций, а с другой — она достаточно прочна, чтобы удерживать образовавшуюся структура в целости, поскольку ее энергия больше тепловой (2,4 кДж/моль).
Сочетание способности искусственных рецепторов к молекулярному распознаванию и самоорганизации позволяет программировать самосборку наноструктур. В супрамолекулярной химии можно использовать самые разные типы нековалентных взаимодействий: водородные связи, донор-акцепторную связь и металл-координационное комплексообразование. Для создания ионных и молекулярных рецепторов применяют самые разные подходы. Еще одним важным примером являются циклодекстрины, применяемые в качестве носителей для доставки лекарств или пестицидов.
В повседневной жизни, например для продуктов питания или средств личной гигиены, крайне важна стабилизация коллоидных дисперсий относительно агрегации (именуемой коагуляцией, в случае необратимой агрегации, и фло-куляцией, в случае обратимой). Системы типа диспергированного масла в воде могут быть стабилизированы поверхностно активными добавками, например амфифильными веществами или белками. Они сегрегируются на поверхности раздела масло—вода и стабилизируют эмульсию, снижая поверхностное натяжение, а также образуя прочные эластичные мембраны, которые предотвращают коалесценцию. Для увеличения срока хранения коллоидные золи, применяемые в красках и пастах, также нуждаются в стабилизации, которую можно осуществить разными способами. Во-первых, в случае заряженных коллоидных частиц в растворе электролита можно сбалансировать электростатическое отталкивание и Ван-дер-Ваальсово притяжение так, чтобы создать потенциальный барьер агрегации. Явление зарядовой стабилизации может быть проанализировано с помощью теории Дерягина—Ландау—Вервея—Овербека (ДЛВО), описываемой в большинстве учебников по коллоидной химии. Вторым способом предотвратить агрегацию является стерическая стабилизация. Здесь к коллоидным частицам присоединяют длинноцепные молекулы, создающие силу отталкивания, возникающую вследствие взаимопроникновения цепей при сближении частиц. Присоединенная молекула может быть и хемосорбиро-ванной (например, длинноцепная жирная кислота), но более распространенной практикой является адсорбция полимера. В отличие от зарядовой стабилизации стерическая работает в неводных растворах и в широком диапазоне концентраций частиц. Выбор полимера и его концентрация крайне важны для стерической стабилизации, поскольку при низкой концентрации полимерные молекулы могут прикрепляться к двум (или даже более) частицам, что приводит к флокуляции за счет образования полимерных мостов. С другой стороны, при слишком высоких концентрациях полимера, если полимер не адсорбируется, может происходить флокуляция обеднения, механизм которой впервые был предложен Асакура и Оосава. Полимеры не могут проникать в частицы, поэтому вокруг частиц образуется зона обеднения. При сближении коллоидных частиц зоны обеднения перекрываются, при этом рассеивание полимера внутрь раствора более выгодно с энтропийной точки зрения. Осмотическое давление, возникающее в промежутке между частицами, приводит к эффективному притяжению между ними, а значит, и к флокуляции. При условии, что концентрация коллоидных частиц такова, что в среднем они удалены друг от друга на расстояние больше радиуса полимерного клубка, и концентрация полимера высока, становится возможной стабилизация обеднения. Притяжение между частицами будет требовать «расслоения» полимера и растворителя, что увеличивает свободную энергию. Поэтому эффективное взаимодействие между частицами носит отталкивательный характер.
