- •II часть
- •1.Миниатюризация
- •1.1.Мотивация проведения исследований в области нт
- •1.2.Планы и стратегия развития
- •1.3.Границы изменения масштабов
- •1.4.Связь размеров структур с их функциональностью
- •1.4.1.Распределение атомов и связанные с этим свойства
- •1.4.2.Отношения величина - свойства
- •2.1.Введение
- •4 Связь размеров структур с их функциональностью
- •2.2.Биологические строительные блоки
- •2.2.1. Размеры строительных блоков и наноструктуры
- •2.2.2.Основные объекты нанобиотехнологии
- •2.2.3.Строительные блоки.Синтетические и биологические.
- •2.3.Принципы самосборки
- •2.3.1.Нековалентные взаимодействия
- •2.3.2.Межмолекулярная упаковка
- •2.3.3.Биологическая самосборка
- •2.4.1.Самосборка (Другой источник информации): Понятия и определения
- •2.4.2.Типы межмолекулярных взаимодействий
- •2.4.3.Измерение свойств веществ в наномировом масштабе.
- •3.Нанобиотехнология
- •3.1.Проблемы определения используемых понятий
- •3.2.Технологии типа от нано к био
- •3.3.Технологии типа от био к нано
- •3.4.Нанобиотехнология и молекулярные устройства
- •3.4.1.Общие вопросы
- •3.1. Основные направления развития биотехнологии
- •3.4.2. Молекулярные устройства.3.4.2.1. Общие вопросы
- •3.4.2.2.Молекулярные пинцеты
- •4.4.2.3.Ротаксаны и катенаны
- •4.4.2.4.Вращательное движение
- •4.4.2.5.Возвратно-поступательное движение
- •4.4.2.6.Схемы сборки путем нанизывания кольцевых молекулярных
- •4.Биотехнология, медицина и здравоохранение
- •4.1. Состояние исследований и разработок
- •4.2. Цели, проблемы и решения
- •4.3. Инфраструктура, стратегия и приоритеты
- •4.4. Достижения и новые парадигмы
- •4.4.1. Изучение особенностей биологических систем
- •4.4.2. Нанонаука и нанотехнология в процессах создания биологических тканей (тканевая инженерия)
- •4.4.3. Биологическое детектирование боевых отравляющих веществ
- •4.4.4. Флуоресцентные биологические метки на основе полупроводниковых нанокристаллов
- •4.5.5. Нанотехнология изготовления днк-чипов
- •4.5.Иомиметические нанотехнологии
- •4.5.1. Днк как строительный материал нанотехнологий
- •4.5.1.1. Направленная сборка с помощью днк
- •4.5.1.2. Днк как шаблон для молекулярной электроники
- •4.5.1.3. Моторы и наномашины на основе днк
- •4.5.2.1. Действие биологических моторов
- •4.5.2.2. Биологические моторы как часть синтетических систем
- •4.5.3. Искусственный фотосинтез
- •4.7. Использование наноустройств в космических исследованиях
- •5.2.1.Основные технические характеристики микроскопа "supra 60vp"
- •5.3. Сканирующая зондовая микроскопия
- •5.3.1. Общие принципы сканирующей зондовой микроскопии
- •5.4.Сканирующая зондовая микроскопия
- •5.5.Сканирующая туннельная микроскопия
- •5.7.Атомно-силовые измерения в биологических системах
- •6. Технология рекомбинантных днк
- •6.1.Векторы для Escherichia coli
- •6.2.Идентификация клонированных днк
- •6.3.Экспрессия эукариотических белков в е. Coli
- •6.4. Генетическая инженерия с участием других клеток-хозяев
- •6.5.Получение инсулина на основе методов генетической инженерии
- •6.6.Синтез соматотропина
- •6.7.Получение интерферонов
- •6.8.Генная инженерия растений
- •6.8.1.Получение трансгенных растений
- •6.8.1.6.Применение методов генетической инженерии для улучшения аминокислотного состава запасных белков растений
- •6.8.1.7.Повышение эффективности процесса фотосинтеза
- •6.8.1.8.Генно-инженерные подходы к решению проблемы усвоения азота
- •6.8.1.9.Устойчивость растений к фитопатогенам
- •6.8.1.10.Устойчивость растений к гербицидам
- •6.8.1.11.Устойчивость растений к насекомым
- •6.8.1.12.Устойчивость растений к абиотическим стрессам
- •6.9.1.Типы питания микроорганизмов
- •6.9.2.Типы энергетического обмена у микроорганизмов
- •6.9.3.Питательные среды для культивирования микроорганизмов
- •6.9.4.Источники углерода
- •6.9.5.Источники азота
- •6.9.6.Источники витаминов, гормонов и микроэлементов
- •6.9.7.Биохимические и биофизические факторы роста
- •6.9.8.Конструирование питательных сред для выращивания микроорганизмов
- •6.9.9.Технология приготовления питательных сред
- •6.9.10.Пастеризация как вариант термической стерилизации
- •6.9.11.Стерилизация фильтрацией
- •6.9.12Особенности культивирования эукариотических клеток в качестве продуцентов.
- •10. Что такое паспорт культуры?
- •1. Каковы причины введения международных правил в фармацевтическую практику?
- •9. Экобиотехнология
- •9.1. Введение
- •9.2. Состояние исследований и разработок
- •9.3. Цели, проблемы и решения
- •9.4. Инфраструктура, стратегия и приоритеты
- •9.5. Достижения и новые парадигмы
- •9.6.Биотехнология утилизации твердых отходов.
- •9.6.1. Биотехнология утилизации твердых отходов
- •9.6.2.Биотехнология очистки сточных вод
- •9.7.Биоэнергетика
- •9.8. Ксенобиотики и их биодеградация
6.4. Генетическая инженерия с участием других клеток-хозяев
Е. coli— излюбленный объект подавляющего большинства работ по клонированию и генетической инженерии, поскольку этот организм наиболее детально изучен на молекулярном уровне. В то же время Е. coli практически не известна в микробиологической промышленности; будучи грамотрицательной бактерией, Е. coli содержит в своей наружной оболочке токсичные липополисахариды (заражение крови Е. coli приводит к летальному исходу в 50% случаев) и не секретирует белки в среду. К тому же как прокариота Е. coli не способна осуществлять характерные для эукариотических клеток сплайсинг и посттрансляционную модификацию белков. В силу этих и ряда других причин большой интерес представляет разработка систем клонирования и экспрессии в других, отличных от Е. coli организмах. При этом во всех случаях важно иметь в виду следующие факторы, которые могут препятствовать экспрессии чужеродного гена:
1. Разрушение чужеродных ДНК или РНК нуклеазами клетки-хозяина.
2. Несрабатывание механизма репликации вектора.
3. Низкая активность промотора или терминатора транскрипции.
4. Неполный сплайсинг мРНК.
5. Неэффективная трансляция.
6. Гидролиз протеазами.
Кроме того, необходима эффективная методика, обеспечивающая введение вектора в клетку-хозяина с высоким выходом.
Известны методы клонирования и экспрессии генов в нескольких бактериях. Из последних наиболее хорошо изучена, по-видимому, Bacillus subtilis — грамположительный, непатогенный, непаразитический микроорганизм, использовавшийся до начала эры генетической инженерии в микробиологической промышленности для производства ряда ферментов и полипептидных антибиотиков. В. subtilis секретирует некоторые свои белки в среду. В генетической инженерии последнее свойство особенно удобно, поскольку секретируемые белки обычно не загрязнены большим количеством очень близких внутриклеточных белков. К тому же секреция белка в среду в принципе позволяет достичь более высокой концентрации синтезируемого белка по сравнению с внутриклеточными белками. (Каков верхний
В последние годы удалось добиться больших успехов в генетической инженерии эукариотических клеток. Особенно интенсивно изучались дрожжи Saccharotnyces cerevisiae; этот микроорганизм выгодно отличается мощной генетической системой, способной к прямой экспрессии как некоторых эукариотических, так и ряда прокариотических генов, а также способностью трансформироваться с помощью чистой ДНК. Дрожжи также осуществляют по меньшей мере некоторые из типичных для эукариот посттрансляционных модификаций и секретируют некоторые белки в среду. Например, рекомбинантные S. cerevisiae продуцируют антиген австралийского гепатита В, который по степени гликозилирования и агрегации, по-видимому, не отличается от антигенов, обнаруженных в организме страдающих этим заболеванием людей. Генетически модифицированные дрожжи синтезируют и секретируют в среду иммунный интерферон человека (INF-'y).
Клонирование и экспрессия генов в клетках млекопитающих пока что осуществлялись только с помощью векторов на основе вируса SV40. Геном этого вируса (ковалентно замкнутая кольцевая ДНК) может реплицироваться в клетках млекопитающих как самостоятельно, так и после включения в хромосомы клетки-хозяина. Процесс экспрессии клонированного гена обеспечивается наличием в вирусе SV40 как промоторов, так и участка начала репликации, функционирующими в клетках млекопитающих.
Наиболее удобным для клонирования и идентификации ДНК остается все же быстрорастущий организм Е. coli, к которому применимо большинство методик генетической инженерии. Поэтому, если конечной целью являются многократная репликация вектора и экспрессия его генов в другом организме, часто оказывается удобным прибегнуть к помощи так называемого челночного вектора, который может реплицироваться как в Е. coli, так и в другом организме. Очевидно, что челночный вектор должен обладать двумя участками начала репликации — по одному на каждый организм-хозяин. На рис. 6.6 приведена схема челночного вектора, предназначенного для продуцирования иммунного интерферона .(INF-'y) в клетках обезьян. В этом векторе фрагмент из 342 пар оснований, содержащий участок начала репликации и «поздний» промотор из SV40, связан с фрагментом кДНК, в состав которой входят кодирующая последовательность npe-INF-f, а также с фрагментом pBR322, включающим ген устойчивости к ампициллину и участок начала репликации Е. coli. Трансфекция (инфекция клеток чистой вирусной ДНК) трансформированных клеток обезьян линии COS-7 через 3—4 дня привела к INF-f-активности порядка 50—100 единиц в 1 мл культуральной жидкости. Этот пример может служить иллюстрацией тех преимуществ, которыми обладают генетически модифицированные клетки-хозяева млекопитающих ш синтезе белков млекопитающих, когда все стадии 5иосинтеза белков и их секреции должны с максимально дости-симой точностью воспроизводить соответствующие стадии, Осуществляющиеся при синтезе и транспорте этих белков in vivo.
Успешно развиваются также работы по введению чужеродных генов в целые организмы растений и животных и их после-
РИС.6.6. Схема челночного вектора для E. coli и клеток обезьяны, осуществляющего экспрессию иммунного интерферона в клетках обезьяны и его секрецию.
дующей экспрессии. Хотя анализ методологии этих работ не входит в тематику настоящей книги, их потенциальная значимость для человека очевидна. Открывающие новые перспективы научные и технические достижения в то же время стимулировали широкие дискуссии (в том числе и в литературе) о возможности неблагоприятного воздействия биотехнологии на общество [24].
Заключение
Приведенный в табл. 6.1 перечень основных этапов синтеза белка с помощью рекомбинантных ДНК может служить кратким обзором темы настоящего раздела. Запомните, что клонирование необходимого гена и его экспрессия эффективно выполняются как отдельные последовательные операции. Следует еще раз подчеркнуть необходимость постоянного контроля любых превращений ДНК путем определения нуклеотидной последовательности и изучения фрагментов, образующихся при расщеплении рестриктазами.
Объем нашей книги позволяет изложить тему этого раздела только в очень сжатой форме. Принимая во внимание ту большую роль, которую будет играть технология рекомбинантных ДНК в будущем, технологу-биохимику необходимо значительно глубже изучить основы молекулярной биологии и соответствующей методологии. Знание этих отраслей науки необходимо при знакомстве с современной биологической литературой, а также
Таблица 6.8. Последовательность этапов работы по клонированию гена и экспрессии соответствующего белка методами технологии рекомбинантных ДНК
при разработке в сотрудничестве с молекулярными биологами оптимальных организмов и процессов. Факторы, определяющие продуктивность рекомбинантных популяций (уровни экспрессии гена, активности внутриклеточных протеаз, генетическая стабильность и т. п.), зависят от нуклеотидной последовательности вектора, генетических свойств клетки-хозяина, состава среды» конструкции биореактора и условий его работы. Для понимания этих зависимостей, а также различных взаимосвязей в генетически видоизмененном организме необходимы совместные усилия специалистов в области биохимической технологии и молекулярной биологии.
Егорова 132- 157
