- •1)Вступ
- •2)Екологія вірусів, основні терміни та поняття.
- •3)Загальна характеристика та відомості про віруси.
- •3.1 Вірусна морфологія.
- •3.2 Структура вірусів.
- •3.3 Структура та функції вірусних протеїнів.
- •3.4 Склад та структура вірусних нуклеїнових кислот.
- •3.5 Інші складові вірусів.
- •4)Історія та сучасні принципи номенклатури та класифікації вірусів рослин.
- •4.1 Фітовірусні родини та групи.
- •4.2 Одноланцюгова рнк, без суперкапсиду, двофрагментна.
- •4.3 Одноланцюгова рнк, без суперкапсида, трифрагментна.
- •5)Функціональні особливості будови та експансії геному фітовірусів.
- •5.1 Біологічне функціонування вірусних компонентів.
- •5.2 Вірусне інфікування та вірусний синтез.
- •5.3 Особливості реплікації фітовірусів із позитивним та негативним геномами.
- •5.4 Функціональність продуктів вірусних генів.
- •5.5 Загальний процес вірусного синтезу.
- •6)Патогенез та передача вірусних інфекцій.
- •6.1 Вірусіндуковані симптоми на рослинах.
- •6.2 Передача фітовірусів.
- •6.3 Механічна передача вірусів через сік.
- •6.4 Передача вірусів через насіння.
- •6.5 Передача пилком.
- •6.6 Передача комахами.
- •6.7 Передача кліщами.
- •6.8 Передача нематодами.
- •7.2 Противірусний імунітет.
- •8)Діагностика та ідентифікація вірусів.
- •8.1 Полімеразно-ланцюгова реакція .
- •8.2Принцип методу полімеразної ланцюгової реакції.
- •8.4 Переваги методу плр як методу діагностики інфекційних захворювань.
- •8.5 Обмеження методу плр.
- •9) Мікрональне розмноження та оздоровлення рослин.
- •9.1 Основні етапи мікроклонального розмноженн.
- •9.2 Індукція розвитку пазушних меристем.
- •9.3 Утворення придаткових пагонів.
- •9.4 Регенерація рослин з калюсу.
- •9.5 Основні етапи мікроклонального розмноження.
- •9.6 Фактори, що впливають на процес мікроклонального розмноження.
- •9.7 Одержання безвірусного посадкового матеріалу.
- •10) Роль вірусів в біосфері.
- •10.1 Чинники, що пов'язані з рослиною-господарем.
- •10.2 Чинники, що впливають на сприйнятливість рослин до зараження.
- •2. Температура.
- •10.4 Шляхи розповсюдження вірусів рослин в природі та агроценозах.
- •11)Література.
8.4 Переваги методу плр як методу діагностики інфекційних захворювань.
1. Пряме визначення наявності збудників. Багато традиційних методів діагностики, наприклад иммуноферментный аналіз, виявляють білки-маркери, що є продуктами 44 життєдіяльності інфекційних агентів, що дає лише опосередковане свідоцтво наявності інфекції. Виявлення специфічної ділянки ДНК збудника методом ПЛР дає пряма вказівка на присутність збудника інфекції.
2. Висока специфічність. Висока специфічність методу ПЛР обумовлена тим, що в досліджуваному матеріалі виявляється унікальний, характерний тільки для цього збудника фрагмент ДНК. Специфічність задається нуклеотидной послідовністю праймерів, що унеможливлює отримання помилкових результатів, на відміну від методу иммуноферментного аналізу, де нерідкі помилки у зв'язку з перехресно-реагуючими антигенами.
3.Висока чутливість Метод ПЛР дозволяє виявляти навіть одиничні клітини бактерій або вірусів. ПЛР-діагностика виявляє наявність збудників інфекційних захворювань в тих випадках, коли іншими методами (імунологічними, бактеріологічними, мікроскопічними) це зробити неможливо. Протягом декількох годин за допомогою ПЛР з одного фрагмента молекули ДНК можна отримати більше 50 млрд. ідентичних молекул. Таким чином, можна вивчити генетичний матеріал присутній в крихітних кількостях. Чутливість ПЛР-аналізу складає 10-100 клітин в пробі (чутливість імунологічних і мікроскопічних тестів - 1000-100000 клітин).
4.Универсальність процедури виявлення різних збудників. Матеріалом для дослідження методом ПЛР служить ДНК збудника. Метод заснований на виявленні фрагмента ДНК або РНК, що є специфічним для конкретного організму. Схожість хімічного складу усіх нуклеїнових кислот дозволяє застосовувати уніфіковані методи проведення лабораторних досліджень. Це дає можливість діагностувати декілька збудників з однієї біопроби. Як досліджуваний матеріал можуть використовуватися різні біологічні виділення (слиз, сеча, мокрота), соскобы епітеліальних клітин, кров, сироватка.
5. Висока швидкість отримання результату аналізу. Для проведення ПЛР-аналізу не вимагається виділення і вирощування культури збудника (як культуральні методи), що займає велику кількість часу. Уніфікований метод обробки біоматеріалу і детекции продуктів реакції, і автоматизація процесу ампліфікації дають можливість провести повний аналіз за 4-4.5 години.
6. Можливість діагностики не лише гострих, але і латентних інфекцій. Особливо ефективний метод ПЛР для діагностики важко культивованих, некультивованих і персистирующих форм мікроорганізмів, з якими часто доводиться стикатися при латентних і хронічних інфекціях, оскільки цей метод дозволяє уникнути складнощів, пов'язаних з вирощуванням таких мікроорганізмів в лабораторних умовах. Застосування ПЛР-діагностики також дуже ефективно відносно збудників з високою антигенною мінливістю і внутрішньоклітинних паразитів.45 Слід зазначити що методом ПЛР можливе виявлення збудників не лише в клінічному матеріалі, отриманому від хворого, але і в матеріалі, що отримується з об'єктів зовнішнього середовища (вода, грунт і так далі). Прості вимоги до умов зберігання транспортування матеріалу від пацієнта в лабораторію не вимагають збереження збудника в живому виді, в порівнянні з бактеріологічними і вірусологічними методами.