- •Сборник лекций
- •Курс: Третий
- •2. Горизонтальный транспорт генов у бактерий в природных экосистемах и его роль в эволюции и систематике прокариот
- •4. Механизмы, контролирующие генетическую изоляцию бактериального генома.
- •5. Эволюция бактериального генома.
- •1. Терминология и номенклатура, используемые в систематике прокариот
- •2. Фенотипическая систематика
- •4. Хемотаксономическая систематика
- •5. Геносистематика
- •1. Основные проблемы филогении прокариот.
- •2. Понятие о молекуле - хронометре
- •3. Концепция к. Вуза о трех линиях эволюции, трех формах жизни
- •4. Дистанционно-матричный метод построения филогенетических деревьев и их конструкции (веерообразная и сильно разветвленная дихотомическая). Гипотеза о. Кандлера о трех типах независимых проклеток
- •5. Методологические ловушки в филогенетической систематике микроорганизмов
- •1. Принципы построения идентификационных схем.
- •2. Общие правила при идентификации бактерий
- •3. Деление царства прокариот на высшие таксоны. Характеристика отделов
- •4. Группы прокариотных организмов и их основные представители
- •1. Сравнительная характеристика прокариот и эукариот
- •2. Основные принципы систематики эукариотных микроорганизмов
- •3. Группы низших эукариот
- •4. Фаготрофия и симбиоз – основные элементы существования протистов
- •5. Основы классификации вирусов
- •Лекция 2.1. Молекулярные и структурные аспекты организации архей. Общая характеристика. Систематика.
- •I. Положение архебактерий в системе царств органического мира
- •2. Характерные особенности отдельных групп архебактерий
- •3. Молекулярная биология архебактерий
- •4. Метаболизм архебактерий.
- •5. Структурная организация геномов архебактерий
- •1. Аэробные сероокислящие бактерии
- •2. Анаэробные серовосстанавливающие бактерии
- •3. Галофильные архебактерии.
- •4. Термоацидофильные микоплазмы
- •Раздел 1.
- •Раздел 2.
- •Раздел 3.
- •Раздел 4.
- •1. Классификация метанообразующих бактерий
- •2. Культурально-морфологические свойства метаногенов
- •3. Тип питания и метаболизм метанообразущих бактерий
- •4. Механизм энергетических процессов у метанообразущих бактерий
- •5. Местообитание и практическое применение метаногенов.
- •1. Пигменты фотосинтезирующих эубактерий
- •2. Строение фотосинтетического аппарата эубактерий
- •3. Группы фотосинтезирующих эубактерий
- •3. Цианобактерии
- •5. Прохлорофиты
- •1. Пурпурные бактерии
- •2. Зеленые эубактерии
- •3. Гелиобактерии
- •4. Распространение фототрофных эубактерий в природе
- •1. Явление автотрофии в микробиологии. Характеристика физиологических групп аэробных хемоавтотрофов
- •2. Нитрифицирующие бактерии
- •3. Бактерии, окисляющие серу
- •4. Железобактерии
- •5. Водородные бактерии
- •6. Метаболическая основа хемоавтотрофии
- •Явление облигатной автотрофии
- •Подавление роста органическими соединениями
- •1. Общая характеристика и систематика метаноокисляющих бактерий
- •2. Морфология вегетативных клеток
- •3. Ультратонкое строение клеток
- •4. Окисление углеродных соединений как основное свойство метанотрофов
- •5. Свойства метанотрофов в свете практического применения
- •2. Молочнокислое брожение и бактерии вызывающие данный процесс
- •3. Эубактерии осуществляющие спиртовое брожение
- •4. Пропионовокислое брожение
- •5. Клостридии и маслянокислый тип брожения
- •1. Системы классификации и таксономия дрожжей
- •2. Строение дрожжевой клетки
- •3. Питание и метаболизм дрожжей
- •4. Генетика дрожжей
- •5. Микробиологические аспекты практического использования дрожжей
- •1. Общая характеристика и систематика актиномицетов
- •Краткая характеристика групп родов Группа 22. Нокардиоформные актиномицеты
- •Группа 23. Роды с многогнездными спорангиями
- •Группа 25. Стрептомицеты и близкие роды
- •Группа 26. Мадуромицеты
- •Группа 29. Другие роды
- •2. Морфология актиномицетов.
- •3. Характеристика актиномицетов по химическому составу и строению клеточных стенок.
- •4. Питательные потребности и условия культивирования актиномицетов.
- •1.Общая характеристика скользящих организмов
- •2. Миксобактерии
- •3. Алгицидные миксобактерии, не образующие плодовых тел
- •4. Группа цитофаг
- •5. Нитчатые скользящие хемогетеротрофы
- •6. Нитчатые бактерии, окисляющие соединения серы
- •1. Общая характеристика бактерий, образующих эндоспоры
- •2. Аэробные спорообразующие бактерии (Род Bacillus)
- •3. Анаэробные спорообразующие бактерии: род clostridium
- •4. Другие спорообразующие бактерии
- •5. Спорообразование
4. Группы прокариотных организмов и их основные представители
Группы основной категории I (грамотрицательные эубактерии, имеющие клеточную стенку)
1 Спирохеты Представители: Treponemapallidum - возбудитель сифилиса, Borrelia recurrentis — возбудитель возвратного тифа.
2 Аэробные/микроаэрофильные, подвижные, спиралевидные/ вибриоидные, грамотрицательные бактерии Bdellovibrio bacteriovorus - паразитирует внутри клеток других бактерий.
3 Неподвижные или, редко, подвижные, грамотрицательные, изогнутые бактерии
Включает семейство Spiromonaceae.
4 Грамотрицательные, аэробные/ микроаэрофильные палочки и кокки
Представители рода Pseudomonas повсеместно распространены в природе. Они постоянные обитатели воздуха, почв, морских и пресных вод, илов, сточных вод.
Азотобактер - первый аэробный микроорганизм, для которого была показана способность фиксировать молекулярный азот.
В род Rhizobium (клубеньковые бактерии) объединены бактерии, вызывающие образование клубеньков на корнях бобовых растений и способные фиксировать азот в условиях симбиоза с ними.
Бактерии, принадлежащие к роду Agrobacterium вызывают тканевые разрастания на стеблях различных растений, на основании чего они могут рассматриваться как внутриклеточные паразиты.
5 Факультативно анаэробные, грамотрицательные палочки
Наиболее изученный представитель — Escherichia соli.
К числу возбудителей тяжелых заболеваний человека принадлежат бактерии из родов Salmonella и Shigella.. Salmonella typhi — возбудитель брюшного тифа; разные виды Shigella — возбудители так называемой бактериальной дизентерии.
6 Грамотрицательные, анаэробные, прямые, изогнутые, и спиралевидные палочки
Основная таксономическая единица группы — семейство Bacteroidaceae. Основное место обитания — кишечник человека и животных, пищеварительный тракт насекомых. Некоторые виды патогенны и вызывают различные поражения кожных покровов, а также других органов и тканей тела.
7 Бактерии, осуществляющие диссимиляционное восстановление сульфата или серы
8 Анаэробные грамотрицательные кокки
Представлена одним семейством Veillonellaceae. В эту группу входят только паразиты теплокровных животных: обитатели пищеварительного тракта, ротовой полости и дыхательных путей человека и животных.
9 Риккетсии и хламидии
В состав группы включены два порядка: Rickettsiales и Chlamydiales.
Порядок Chlamydiales включает одно семейство Chlamydiaceae и один род Chlamydia. Хламидии — облигатные внутриклеточные паразиты позвоночных и человека.
10 Аноксигенные фототрофные бактерии
11 Оксигенные фототрофные бактерии
1 2 Аэробные хемолитотрофные бактерии и близкие организмы
13 Почкующиеся и/или образующие выросты бактерии
В эту группу входят бактерии, образующие состоящие из слизи отростки (стебельки), не связанные с цитоплазмой клетки, или нитевидные клеточные выросты — простеки
14 Бактерии, имеющие чехлы
Наиболее распространены представители родов Sphaerotilus и Leptothrix. Бактерии рода Sphaerotilus — типичные обитатели сточных вод. Они хорошо растут в проточной воде, богатой органическими веществами, а представители рода Leptothrix — в бедных органическими веществами местах с высоким содержанием железа.
15 Нефотосинтезирующие скользящие бактерии, не образующие плодовых тел
Основной по числу представителей — порядок Cytophagales.
16 Скользящие бактерии, образующие плодовые тела
Включает один порядок Myxococcales, подразделяющийся на 4 семейства. Миксобактерии образуют так называемые плодовые тела, внутри которых клетки переходят в покоящееся состояние.
Группы основной категории II (Грамположительные эубактерии, имеющие клеточные стенки)
17 Грамположительные кокки
Разрушая многие сложные органические вещества, выполняют функцию «мусорщиков». К этой же группе отнесен род Streptococcus, представители которого получают энергию, осуществляя гомоферментативное молочнокислое брожение, и род Leuconostoc; бактерии, входящие в его состав, осуществляют гетероферментативное молочнокислое брожение.
18 Образующие эндоспоры грамположительные палочки и кокки
Два из них (Bacillus и Clostridium) наиболее многочисленны и интересны. В. anthracis — возбудитель сибирской. С. tetani — возбудитель столбняка, С. perfringens и некоторые другие виды клостридиев — возбудители газовой гангрены, С. botulinum — продуцент экзотоксина, одного из самых сильных биологических ядов.
19 Не образующие спор грамположительные палочки правильной формы
Представители рода Lactobacillus, в составе которого около 50 видов, получают энергию в процессе гомоферментативного или гетероферментативного молочнокислого брожения.
20 Не образующие спор грамположительные палочки неправильной формы
Род Corynebacterium. Большая группа коринебактерий — возбудители болезней растений. Бактерии рода Arthrobacter — основные представители микрофлоры почвы, активно участвующие в разложении органических веществ.
21 Микобактерии
Объединены в семейство Мусоbacteriaceae и представлены одним родом Mycobacterium. М. tuberculosis — возбудитель туберкулеза, М. leprae — возбудитель проказы.
22-29 Актиномицеты
Группы основной категории III (эубактерии, лишенные клеточной стенки: микоплазмы, или молликуты)
30 Микоплазмы
Группы основной категории IV (Archaeobacteria)
31 Метаногены
32 Сульфатредуцирующие археи
33 Экстремально галофильные архебактерии (галобактерии)
34 Архебактерии, лишенные клеточной стенки
35 Экстремальные термофилы и гипертермофилы, метаболиэирующие S0
Контрольные вопросы:
1. Почему определитель бактерий Берджи не может быть использован для классификации микроорганизмов?
2. Назовите 6 этапов по идентификации микроорганизмов.
3. Какие признаки положены в основу построения схемы идентификации?
4. В чем определяется необходимость применения стандартизованных методик и тестов при разработке схемы идентификации?
5. Почему для целей идентификации важно разграничить «положительные» и «отрицательные» реакции микроорганизмов?
6. Какие существуют критерии чистоты культуры?
7. Назовите общие правила идентификации бактерий по определителю Берджи.
8. В чем заключается принцип деления царства прокариот на высшие таксоны?
9. Назовите основные отделы прокариот.
10. какое количество групп эубактерий представлено в определители Берджи?
11. Эубактерии, лишенные клеточной стенки какое отношение имеют к окраске по Граму?
12. К какой группе принадлежат актиномицеты?
13. На основании какого основного признака архебактерии выделены в самостоятельную группу?
14. Назовите группу прокариот к которой относится кишечная палочка?
СПЕЦКУРС «ЧАСТНАЯ МИКРОБИОЛОГИЯ. СИСТЕМАТИКА МИКРООРГАНИЗМОВ»
Лекция 1.5 Основные принципы систематики эукариотных микроорганизмов. Протисты и их биоразнообразие. Основы классификации вирусов.
План лекции:
Сравнительная характеристика прокариот и эукариот.
Основные принципы систематики эукариотных микроорганизмов.
Группы низших эукариот.
Фаготрофия и симбиоз – основные элементы существования протистов.
Основы классификации вирусов.
