- •Сборник лекций
- •Курс: Третий
- •2. Горизонтальный транспорт генов у бактерий в природных экосистемах и его роль в эволюции и систематике прокариот
- •4. Механизмы, контролирующие генетическую изоляцию бактериального генома.
- •5. Эволюция бактериального генома.
- •1. Терминология и номенклатура, используемые в систематике прокариот
- •2. Фенотипическая систематика
- •4. Хемотаксономическая систематика
- •5. Геносистематика
- •1. Основные проблемы филогении прокариот.
- •2. Понятие о молекуле - хронометре
- •3. Концепция к. Вуза о трех линиях эволюции, трех формах жизни
- •4. Дистанционно-матричный метод построения филогенетических деревьев и их конструкции (веерообразная и сильно разветвленная дихотомическая). Гипотеза о. Кандлера о трех типах независимых проклеток
- •5. Методологические ловушки в филогенетической систематике микроорганизмов
- •1. Принципы построения идентификационных схем.
- •2. Общие правила при идентификации бактерий
- •3. Деление царства прокариот на высшие таксоны. Характеристика отделов
- •4. Группы прокариотных организмов и их основные представители
- •1. Сравнительная характеристика прокариот и эукариот
- •2. Основные принципы систематики эукариотных микроорганизмов
- •3. Группы низших эукариот
- •4. Фаготрофия и симбиоз – основные элементы существования протистов
- •5. Основы классификации вирусов
- •Лекция 2.1. Молекулярные и структурные аспекты организации архей. Общая характеристика. Систематика.
- •I. Положение архебактерий в системе царств органического мира
- •2. Характерные особенности отдельных групп архебактерий
- •3. Молекулярная биология архебактерий
- •4. Метаболизм архебактерий.
- •5. Структурная организация геномов архебактерий
- •1. Аэробные сероокислящие бактерии
- •2. Анаэробные серовосстанавливающие бактерии
- •3. Галофильные архебактерии.
- •4. Термоацидофильные микоплазмы
- •Раздел 1.
- •Раздел 2.
- •Раздел 3.
- •Раздел 4.
- •1. Классификация метанообразующих бактерий
- •2. Культурально-морфологические свойства метаногенов
- •3. Тип питания и метаболизм метанообразущих бактерий
- •4. Механизм энергетических процессов у метанообразущих бактерий
- •5. Местообитание и практическое применение метаногенов.
- •1. Пигменты фотосинтезирующих эубактерий
- •2. Строение фотосинтетического аппарата эубактерий
- •3. Группы фотосинтезирующих эубактерий
- •3. Цианобактерии
- •5. Прохлорофиты
- •1. Пурпурные бактерии
- •2. Зеленые эубактерии
- •3. Гелиобактерии
- •4. Распространение фототрофных эубактерий в природе
- •1. Явление автотрофии в микробиологии. Характеристика физиологических групп аэробных хемоавтотрофов
- •2. Нитрифицирующие бактерии
- •3. Бактерии, окисляющие серу
- •4. Железобактерии
- •5. Водородные бактерии
- •6. Метаболическая основа хемоавтотрофии
- •Явление облигатной автотрофии
- •Подавление роста органическими соединениями
- •1. Общая характеристика и систематика метаноокисляющих бактерий
- •2. Морфология вегетативных клеток
- •3. Ультратонкое строение клеток
- •4. Окисление углеродных соединений как основное свойство метанотрофов
- •5. Свойства метанотрофов в свете практического применения
- •2. Молочнокислое брожение и бактерии вызывающие данный процесс
- •3. Эубактерии осуществляющие спиртовое брожение
- •4. Пропионовокислое брожение
- •5. Клостридии и маслянокислый тип брожения
- •1. Системы классификации и таксономия дрожжей
- •2. Строение дрожжевой клетки
- •3. Питание и метаболизм дрожжей
- •4. Генетика дрожжей
- •5. Микробиологические аспекты практического использования дрожжей
- •1. Общая характеристика и систематика актиномицетов
- •Краткая характеристика групп родов Группа 22. Нокардиоформные актиномицеты
- •Группа 23. Роды с многогнездными спорангиями
- •Группа 25. Стрептомицеты и близкие роды
- •Группа 26. Мадуромицеты
- •Группа 29. Другие роды
- •2. Морфология актиномицетов.
- •3. Характеристика актиномицетов по химическому составу и строению клеточных стенок.
- •4. Питательные потребности и условия культивирования актиномицетов.
- •1.Общая характеристика скользящих организмов
- •2. Миксобактерии
- •3. Алгицидные миксобактерии, не образующие плодовых тел
- •4. Группа цитофаг
- •5. Нитчатые скользящие хемогетеротрофы
- •6. Нитчатые бактерии, окисляющие соединения серы
- •1. Общая характеристика бактерий, образующих эндоспоры
- •2. Аэробные спорообразующие бактерии (Род Bacillus)
- •3. Анаэробные спорообразующие бактерии: род clostridium
- •4. Другие спорообразующие бактерии
- •5. Спорообразование
4. Фаготрофия и симбиоз – основные элементы существования протистов
Фаготрофия - способность организмов захватывать твердые частицы и проводить их через мембрану внутрь клетки. Такой способ питания принципиально невозможен для прокариот и соответственно исключил для них способность к эндосимбиозу. А у эукариот эта способность, в свою очередь, открыла путь к эндосимбиозу как; системному усложнению, в строении путем включения жертвы в состав организма и создания таким способом полифункционального объединения — «сообщества-организма», где отдельные компоненты теряют индивидуальность.
Фаготрофия требует наличия проницаемой мембраны на поверхности клетки или одном участке ее (цитостом) и пищеварительной вакуоли, которая движется внутри клетки. Верхний предел для рецикла пищеварительной вакуоли фаготрофных протистов составляет около 100 объемов клетки в час. Далее требуется эффективный механизм концентрирования взвеси. Для крупной добычи возможно хищничество. При пастбищном типе питания на газоне из обрастаний проблема захвата пищи решается просто, как это делают ползающие амебы, гораздо сложнее она для питания взвесью мелких частиц — фильтрацией или пассивной ловлей. Пассивная ловля обусловлена тем, что подвижная добыча сталкивается с внеклеточными придатками, как у солнечников, фораминифер, радиолярий. Для неподвижной добычи гидродинамическая задача решается созданием тока воды через внеклеточное ловчее приспособление — сеть слизистых придатков, как воротничок у хоанофлагеллят. Создание потока возможно для прикрепленного организма иначе он будет двигаться вместе с объемом воды, в котором находится. Сидячие организмы требуют разных усилий для создания потока параллельно или перпендикулярно поверхности. Скорость потока быстро падает у поверхности клетки, и поэтому необходимы дополнительные приспособления для улавливания частиц. Скорость, создаваемая жгутиком или ресничками, составляет 10-100 мкм/с и резко возрастает на расстоянии около 10 мкм от поверхности клетки. Продуктом работы фаготрофных фильтраторов является «прозрачная вода», лишенная рассеивающих свет частиц.
Попавшая в вакуоль пища должна быть гидролизована. Для внутриклеточного пищеварения имеются лизосомы — мембранные везикулы, отпочковывающиеся от аппарата Гольджи и содержащие гидролитические ферменты. Они сливаются с пищеварительной вакуолью и изливают в нее свое содержимое. В дополнение к обычным гидролазам у фагоцитов высших животных имеется возможность посредством миелопероксидазы продуцировать активные формы кислорода, осуществлять хаотическое расщепление полимеров на олигомерные остатки, что особенно важно для разрушения относительно устойчивых оболочек добычи.
У фаготрофов есть довольно четкая зависимость между размерами хищника и жертвы, примерно десятикратная.
Местообитание связано с размерами организма, скоростью его роста и подвижностью. В результате размер местообитания жгутикового составляет сантиметры. Минимальная плотность бактерий для роста бактериотрофных протистов составляет менее 105 клеток/мл.
Считается, что энергетический метаболизм протистов тот же, что и у всех организмов, обладающих митохондриями. Принимается, что это дыхание без существенных отклонений от нормы. Вместе с тем интерес представляют пищеварительные вакуоли, в которых происходит гидролиз полимеров вне цитоплазмы клетки. Объекты, вышедшие за пределы вакуолей, не могут быть переварены, поскольку это привело бы к разрушению и структурных компонентов хозяина.
Наиболее типичным явлением для протист является симбиоз с фототрофными организмами. Выгоды симбиоза более или менее очевидны, как выигрыш в подвижности и оптимизации положения, минеральном питании, использовании углекислоты от дыхания или кальцификации для фототрофа. Ассоциация становится автотрофной. Это особенно выгодно в олиготрофных водах, где циклы биогенов замыкаются в пределах наиболее выгодных диффузионных расстояний. Так, некоторые планктонные радиолярии содержат симбиотические динофлагелляты. То же справедливо для планктонных фораминифер с динофлагеллятами или празинофитами в наружной сети псевдоподий. Гигантские бентосные фораминиферы коралловых экосистем в олиготрофных тропических водах тоже содержат фотосимбионты. Наконец, сама экосистема коралловых рифов автотрофна.
Особую группировку составляют бактерии - эндосимбионты простейших в особенности инфузорий, но функция их далеко не ясна, и некоторые являются внутриклеточными паразитами.
Внимание вызвал симбиоз протестов с метаногенами, который дал первым возможность развиваться анаэробно. Значительную часть анаэробов, составляют протисты и грибы пищеварительного тракта, паразиты и некоторые свободноживущие организмы. В рубце жвачных число клеток протистов достигает 2.105 в см3. В насекомых есть инфузории.
Анаэробные протисты часто представляют единственных хищников в анаэробной зоне, если не считать роющих беспозвоночных, которые захватывают и анаэробный слой ила, отправляя его в свой пищеварительный тракт. Очень большое внимание было обращено на анаэробные протисты и их симбиоз с метаногенными архебактериями.
Основан анаэробиоз протистов на взаимодействии их. органелл, получивших название гидрогеносом, с экзо- или эндосимбиотическими метаногенами. Гидрогеносомы продуцируют водород, ацетат, углекислоту, представляющие стандартные субстраты для метаногенов. В инфузориях происхождение гидрогеносом и, соответственно, анаэробного способа существования, несомненно, вторично. Гидрогеносемы и метаногены образуют эндосимбиотическую структуру.
Более сложную систему представляют бентосные кишечнополостные. Например, склерактиновые кораллы представляют классический случай, симбиоза кишечно-полостных с фотосинтезирующими динофлагеллятами или зооксантеллами. В ткани коралла имеются овальные тела, представляющие сжатую массу бактерий.
