Пищевод

Пищевод у здоровых людей обычно свободен от микроорганизмов или заселен очень мало. Сведения об индигенных обитателях пищевода на сегодня отсутствуют. Транзиторными представителями являются практически все микроорганизмы, поступающие сюда из ротовой полости (вместе со слюной, пищей и т.д.).

Желудок

До 70-х годов ХХ века большинство исследователей считало, что у здоровых людей микробиота в желудке либо отсутствует, либо крайне бедна и представлена некоторыми кислотоустойчивыми видами. Это связано с бактерицидными свойствами соляной кислоты, желудочного сока и протеолитического действия ферментов (пепсина).

В 1966 году Франклин и Шаруна выявили микроорганизмы в 82 % из 154 изученных проб в количестве 10 ³ КОЕ/мл содержимого.

В связи с кислой реакцией среды и высокой активностью гидролитических ферментов, неблагоприятных для развития микроорганизмов, в желудке прижилась специфическая кислотоустойчивая микробиота: дрожжи, сарцины (Sarcina ventriculi), грибы, лактобактерии, стафилококки, стрептококки, хеликобактер и другие, но не гнилостные бактерии (всего до 30 видов). Большая часть названных микроорганизмов поступает сюда из носоглотки.

При сдвигах рН в нейтральную сторону (в зависимости от характера питания и других физиологических или патологических причин) в желудке могут встречаться в незначительных количествах (не более 10³ в 1 мл) и другие бактерии.

В одних работах, лактобациллы желудка (палочки Боаса-Опплера) наиболее часто описываются у больных раком желудка. В других – говорится о том, что частота встречаемости лактобацилл в желудке здоровых людей не меньшая, чем у больных хроническим гастритом и раком желудка. В желудочном соке могут находится одновременно несколько видов лактобактерий. У людей превалируют Lactobacillus fermentum и L. acidophillus , но могут встречаться L. casei и L.brevis.

Появление гнилостных бактерий (кишечной палочки) и бактероидов, - признак нарушения нормальной функции желудочной секреции.

По последним данным – в состав нормальной микробиоты желудка входят разнообразные виды дрожжеподобных грибов.

Однако пока не решен окончательно вопрос, являются ли выявляемые бактериальные виды индигенными, или транзиторными, проникающими сюда из полости рта и дыхательных путей.

Тонкий кишечник

В тонком кишечнике размножению микроорганизмов препятствуют бактериостатическое действие желчи, секретов слизистой оболочки и секреторные иммуноглобулины класса А.

Микробиота тонкого кишечника изучена недостаточно, что обусловлено сложностью забора проб из данного участка. В литературе в основном приводятся результаты исследований материала, полученного на вскрытии (секционного материала). Однако после смерти человека происходит быстрое изменение экологических условий, резко снижающее достоверность результатов бактериологического посева. Метод получения проб во время хирургического вмешательства также не лишен недостатков - на результатах сказывается влияние голодания накануне операции, предварительная антибактериальная и механическая санация кишечника, наркоз и т.п. Проведение зондов влечет за собой инфицирование пробы получаемого содержимого микроорганизмами, находящимися в полостях через которые проходит зонд.

Обследование с помощью специальной капсулы двенадцатиперстной кишки 510 здоровых людей показало 69,7 % стерильных проб, в то же время при обследовании методом зонда таких проб оказалось 26,7 %.

В настоящее время показано, что проксимальный отдел тощей кишки практически стерилен у 33 % населения, в 67 % случаев отмечена средняя степень контаминации (10³ бактериальных клеток/мл).

По одним данным, здесь преимущественно обитают аэробы, число которых не превышает 10² –10³ кл/мл, несмотря на то, что ее содержимое имеет щелочную реакцию. По другим – факультативные и облигатные анаэробы - лактобактерии (чаще Lactobacillus fermentum), энтерококки, бифидумбактерии, кишечная палочка и некоторые другие, а также дрожжеподобные грибы. Однако присутствие кишечной палочки в тонком кишечнике расценивается как явление дисбактериоза.

В целом, микробиота тонкого кишесника - не обильная и довольно однообразная:

В ряде случаев, например, в связи с нарушением желудочной секреции, или с поражением слизистой оболочки кишечника в результате радиационного облучения, или вследствие заболевания печени, желчных путей и поджелудочной железы, или иммунодефицита, у людей развивается синдром избыточной колонизации тонкого кишечника. Он заключается в том, что в тонкой кишке резко увеличивается концентрация бактерий, аналогичной по видовому и количественному составу микробиоте толстого кишечника. Такое накопление в тонком кишечнике необычной для него микробиоты может привести к различным нарушениям его функции и к явлениям энтеральной недостаточности.

В нижних отделах тонкой кишки (илиоцекальный отдел) микробиота более многочисленная и по своему составу близка микробиоте толстой кишки.