- •Компьютерная технология квантово-химических расчетов с помощью программного пакета “gaussian” Методическое пособие
- •Введение
- •Строение электронной оболочки атома
- •Волновая функция электрона и стационарное уравнение Шредингера
- •1.2 Решение уравнения Шредингера для атома водорода и водородоподобных атомов
- •1.3 Многоэлектронные атомы
- •Аналитические аппроксимации атомных орбиталей и атомные базисные наборы
- •2.1 Метод молекулярных орбиталей (мо лкао)
- •Атомные псевдопотенциалы
- •II. Теория электронного строения молекул
- •В заключение этого раздела необходимо обратить внимание еще на одно весьма важное обстоятельство.
- •2.2 Теория возмущений Мёллера-Плессе
- •2.3 Теория функционала плотности
- •2.4 Полуэмпирические методы квантовой химии
- •2.5 Модель реакционного поля для учета эффектов сольватации
- •III. Порядок работы с программным пакетом квантово-химических расчетов “ гауссиан”
- •3.1 Структура файла исходных данных
- •0 1 (Спецификация молекулы)
- •Variables:
- •3.2 Структура выходного файла
- •Variables:
- •Initialization pass.
- •Isotopes: n-14,h-1,h-1,h-1
- •Item Value Threshold Converged? Maximum Force .043925 .000450 no
- •Virtual (a1) (e) (e) (e) (e) (a1) (a1) (e) (e) (a1)
- •Ir Inten -- 381.2474 22.7331 22.7331
- •22.61138 (Kcal/Mol)
- •Vibrational temperatures: 1230.35 2673.15 2673.15 5243.52 5468.34
- •Vibrational 22.653 .605 .172
- •3.3 Алгоритм составления z-матрицы
- •3.3.1. Использование внутренних координат атомов.
- •Variables:
- •Variables:
- •3.3.2 Использование декартовых координат атомов.
- •3.3.3 Смешанное использование внутренних и декартовых координат.
- •Variables:
- •3.3.4 Использование псевдоатомов.
- •Variables:
- •IV. Оптимизация молекулярной геометрии
- •Расчет молекулы при фиксированной геометрии
- •Оптимизация геометрии
- •V. Расчет путей химических реакций
- •5.1 Поверхность потенциальной энергии реакций
- •5.2 Поиск переходного состояния.
- •Variables:
- •Variable Old X -de/dx Delta X Delta X Delta X New X
- •Item Value Threshold Converged?
- •Variable Old X -de/dx Delta X Delta X Delta X New X
- •Item Value Threshold Converged?
- •Ir Inten -- 18.4533 18.9748 128.0921
- •1 Imaginary frequencies ignored.
- •Variables:
- •Variables:
- •Iteration 8
- •I X gradient displacement newx
- •Item value threshold converged?
- •Ir Inten -- 18.5781 18.9228 128.1958
- •1 Imaginary frequencies ignored.
- •5.3 Расчет пути химической реакции.
- •Irc calculation in mass-weighted internal coordinates
- •Variables:
- •VI. Учет влияния эффектов сольватации
- •Version: matrix inversion
- •174 Tesserae over a maximum of 1500
- •VII. Дополнительные сведения
- •7.1. Порядок следования разделов в исходном файле
- •7.2. Методы расчета, реализованные в Гауссиане
- •7.3. Встроенные базисные наборы и псевдопотенциалы атомов
- •7.4. Наиболее часто употребляемые директивы
- •7.4.1 Опции директивы Opt
- •7.4.2 Опции директивы Freq
- •7.4.3 Опции директивы scrf
- •7.4.4 Опции директивы scf
- •7.4.5 Опции директивы Pop
- •7.4.6 Опции директивы Guess
- •7.4.7 Опции директивы Geom
- •7.4.8 Опции директивы irc
- •7.5. Задание базисных наборов и псевдопотенциалов во входном файле
- •VIII. Заключение
В заключение этого раздела необходимо обратить внимание еще на одно весьма важное обстоятельство.
При проведении
расчетов методом ССП с использованием
приближения Рутаана (МО ЛКАО) по мере
расширения базиса атомных орбиталей
полная энергия системы будет стремиться
к предельному значению энергии ЕХФ,
которое отвечает приближению Хартри-Фока.
Однако эта энергия всегда будет выше
истинной энергии системы Еист
, определить
которую в рамках одноэлектронного
приближения не представляется возможным.
Причина такого различия состоит в том,
что при использовании в методе Хартри-Фока
одноэлектронного приближения истинный
кулоновский потенциал взаимодействия
электронов (
)
заменяется некоторым усредненным
потенциалом (
).
Такое усреднение приводит к неучету
скореллированности движения электронов
молекулы в каждый момент времени,
вследствие которой электроны должны
находиться как можно дальше друг от
друга, т.е. должна существовать кулоновская
корреляция электронов. Разность между
истинной энергией и энергией, которая
получается из расчета методом Хартри-Фока,
называют энергией корреляции:
Eкорр=Еист – ЕХФ (2.1.24)
Энергия корреляции не обусловлена каким-либо физическим взаимодействием, а является следствием не очень хорошей точности одноэлектронного приближения.
Следует отметить, что приближение Хартри-Фока, требуя антисимметричности электронной волновой функции, тем самым автоматически учитывает главный корреляционный эффект пар электронов с одинаковым спином. Такая корреляция электронов называется обменной. Однако движение электронов с противоположным спином остается нескоррелированным. Проблема учета электронной корреляции в настоящее время стала одной из важнейших для корректного описания электронного строения химических соединений. Полностью учесть энергию корреляции - довольно трудная задача, которую можно решить строго, лишь отказавшись от одноэлектронного приближения. Альтернативным способом и наиболее эффективным можно назвать метод конфигурационного взаимодействия (КВ), в котором в рамках одноэлектронного приближения полная электронная волновая функция представляется в форме не одного слейтеровского детерминанта, а в виде линейной комбинации нескольких детерминантов, отвечающих различным электронным конфигурациям. Тем не менее метод КВ и его различные упрощенные модификации требуют значительных компьютерных ресурсов, а поэтому применимы лишь для сравнительно небольших молекул. Рассмотрение различных вариантов учета КВ выходит за рамки данного пособия, поэтому в последующих двух разделах мы кратко опишем два других способа учета электронной корреляции, которые нашли широкое применение в последние годы: теория возмущений Мёллера-Плессе и теория функционала плотности.
2.2 Теория возмущений Мёллера-Плессе
Эта теория основана на применении стационарной теории возмущений, которая может быть использована, если полный гамильтониан системы можно разделить на две части:
H=H0+H1, (2.2.1)
причем величина H1, называемая возмущением, должна быть много меньше Н0 (т.е. <<1), а также если известно решение уравнения Шредингера системы с невозмущенным гамильтонианом Н0. Можно показать, что в этом случае возмущенная волновая функция и энергия могут быть выражены в виде рядов H1 по степеням :
(2.2.2)
E=E(0)+ E(1)+2E(2)+ 3E(3)+... (2.2.3)
Здесь
и E(0)
– невозмущенные волновая функция и
энергия, т.е. полученные из решения
уравнения Шредингера с невозмущенным
гамильтонианом Н0,
а
и E(1),
и E(2)
и т.д. – поправки к волновой функции и
энергии в первом, втором и т.д. порядке
теории возмущений, соответственно.
Подставляя (2.2.2) и (2.2.3) в уравнение
Шредингера с гамильтонианом (2.2.1),
получим:
(H0 + H1)( (0) + (1) +...) = ( E(0) + E(1) +...)( (0) + (1) +...) (2.2.4)
Раскрывая скобки и приравнивая коэффициенты при одинаковых степенях в левой и правой части, получим набор уравнений:
(H0 - E(0)) (0) = 0 (2.2.5)
(H0 - E(0))(1) = (E(1) - H1)(0) (2.2.6)
(H0 - E(0))(2) = (E(1) - H1)(1) + E(2)(0) (2.2.7)
. . . . . .
определяющих как невозмущенные волновую функцию и энергию, так и их поправки первого, второго и т.д. порядка.
Если принять что эффект электронной корреляции является малым возмущением к гамильтониану H0, то в рамках теории возмущений можно рассчитать поправки любого порядка к волновой функции и энергии, получаемым в приближении Хартри-Фока. Такой подход получил название метода Мёллера-Плессе (МР). Следует отметить, что наибольший вклад в энергию и волновые функции дают поправки четного порядка, т.е. второго (МР2), четвертого (МР4) и т.д. При этом время, необходимое для расчета таких поправок, резко возрастает с увеличением порядка. Поэтому обычно проводят расчеты с использованием порядка теории возмущений не выше четвертого. Такое приближение правомерно только в случае, когда ряд поправок сходится, т.е.:
Е(0) >> E(1) >> E(2) >> … (2.2.8)
Если же условие (2.2.8) не выполняется, то теория возмущений неприменима.
Широкое распространение получили подходы, в которых предварительно проводится оптимизация геометрии системы методом Хартри-Фока, а затем при полученной геометрии проводится расчет на уровне МР2 с целью уточнения полной энергии. Такую комбинацию методов принято обозначать как МР2/НF.
