- •С.Б. Бокуть, в.Э. Сяхович практикум по общей и экологической биохимии
- •Часть III
- •Содержание
- •Лабораторная работа № 7
- •Углеводы
- •Классификация, структура и изомерия углеводов
- •Моносахариды или простые сахара
- •Стереоизомерия моносахаридов
- •Аномерия
- •Пиранозные и фуранозные кольцевые структуры моносахаридов
- •Сложные углеводы
- •Дисахариды
- •Олигосахариды
- •Полисахариды
- •Гомополисахариды
- •Химические свойства углеводов
- •Реакция с фуксин-сернистой кислотой
- •Реакция «серебряного зеркала»
- •Реакция Троммера на моносахариды
- •Реакция с фелинговой жидкостью
- •Реакция Ниландера
- •Реакция Барфеда (позволяет отличать восстанавливающие дисахариды от моносахаридов)
- •Метиленовая проба
- •Качественные реакции на углеводы р еакция Толленса (проба с нафторезорцином)
- •Реакция на углеводы с -нафтолом
- •Р еакция на сахара с антроном
- •Р еакция на кетозы
- •Контрольные вопросы
- •Литература
- •Тема: химические свойства углеводов Редуцирующая способность альдоз и некоторых дисахаридов Реакция «серебряного зеркала»
- •Оформление работы
- •Лабораторная работа № 8
- •Гликопротеины и протеогликаны
- •Гликопротеины
- •Моносахариды, обнаруживаемые в гликопротеинах
- •Нуклеотидсахара
- •Экзогликозидазы и эндогликозидазы
- •Классификация гликопротеинов
- •Процессинг олигосахаридной цепи
- •Регуляция гликозилирования гликопротеинов
- •Протеогликаны и гликозаминогликаны
- •Гиалуроновая кислота
- •Хондроитинсульфаты
- •Кератансульфат I и кератансульфат II
- •Гепарин
- •Гепарансульфат
- •Дерматансульфат
- •Функции гликозамингликанов и протеогликанов
- •Установление гликопротеиновой природы овальбумина и методы количественного определения углеводов Установление гликопротеиновой природы овальбумина
- •Литература
- •Тема: гликопротеины и протеогликаны Установление гликопротеиновой природы яичного альбумина Получение препарата яичного альбумина
- •Доказательство наличия углеводного фрагмента в яичном альбумине
- •Тема: методы количественного определения углеводов Определение концентрации глюкозы в крови орто-толуидиновым методом
- •Определение глюкозы в крови глюкозооксидазным методом
- •Оформление работы
- •Лабораторная работа № 9
- •Углеводный обмен
- •Гликолиз
- •Подготовительная стадия гликолиза
- •Фосфорилирование глюкозы
- •Превращение глюкозо-6-фосфата во фруктозо-6-фосфат
- •Фосфорилирование фруктозо-6-фосфата
- •Расщепление фруктозо-1,6-дифосфата
- •Взаимопревращение фосфотриоз
- •Стадия запасания энергии в гликолизе
- •Окисление глицеральдегид-3-фосфата
- •Перенос фосфатной группы от 1,3-дифосфоглицерата на adp
- •Превращение 3-фосфоглицерата в 2-фосфоглицерат
- •Дегидратация 2-фосфоглицерата
- •Перенос фосфатной группы с фосфоенолпирувата на adp
- •Восстановление пирувата до лактата
- •Итог гликолиза
- •Брожение
- •Метаболизм других важнейших сахаров Обмен моносахаридов
- •Обмен дисахаридов
- •Пентозофосфатный путь
- •Дыхание
- •Подготовительная стадия
- •Цикл Кребса
- •Итог цикла Кребса
- •Окислительное фосфорилирование
- •Изучение эффективности протекания гликолиза в миоцитах
- •Принципы методов Определение концентрации глюкозы глюкозооксидазным методом
- •Определение молочной кислоты с п-оксидифенилом
- •Контрольные вопросы
- •Литература
- •Тема: обмен углеводов Получение препарата мышечного экстракта для изучения гликолиза Приготовление мышечного гомогената
- •Получение мышечного экстракта
- •Гликолиз и его регуляция
- •Изучение влияния концентрации атр на скорость гликолиза
- •Изучение влияния уровня амр на скорость гликолиза
- •Изучение влияния цитрата на скорость гликолиза
- •Определение глюкозы в пробах глюкозооксидазным методом
- •Определение молочной кислоты по реакции с п-оксидифенилом
- •Оформление работы
- •Приложение 1. Структурные формулы основных моносахаридов
- •Часть III
Моносахариды, обнаруживаемые в гликопротеинах
Несмотря на то, что в природных источниках обнаружено и описано более 200 различных моносахаридов, в составе олигосахаридных цепей, являющихся компонентами гликопротеинов присутствует менее 12 названий из общего числа этих моносахаридов (см. табл. 1, ниже). Строение большей части этих моносахаридов рассматривалось в предыдущей лабораторной работе. Однако следует уделить внимание некоторым модифицированным сахарам. Так, на концах олигосахаридных цепей в гликопротеинах часто присутствует N-ацетилнейраминовая кислота (NeuAc), обычно присоединенная к предерминированным остаткам галактозы (Gal) или N-ацетилгалактозамина (GalNAc). Другие перечисленные в табл. 1 моносахариды обычно занимают положения ближе к середине цепи.
Таблица 1
Структура моносахарида |
Примечание |
Глюкоза (Glc)
|
Присутствует на этапе биосинтеза N-связанных гликопротеинов, но не всегда обнаруживается в зрелых гликопротеинах |
Галактоза (Gal)
|
Часто занимает претерминальное положение перед NeuAc в N-связанных гликопротеинах. Обнаруживается также в трисахаридном ядре протеогликанов |
Манноза (Man)
|
Обычный сахар в N-связанных гликопротеинах |
N-ацетилнейраминовая кислота (NeuAc)
|
Часто служит терминальным сахаром в N- и O-связанных гликопротеинах. Известны и другие сиаловые кислоты, но NeuAc – главный вид этих соединений, обнаруживаемый у человека |
Фукоза (Fuc)
|
Может занимать наружную позицию в N- и O-связанных гликопротеинах или быть связанной с остатком GlcNAc, который присоединен к Asn в N-связанных гликопротеинах |
N-ацетилгалактозамин (GalNAc)
|
Присутствует и в N-, и в O-связанных гликопротеинах |
N-ацетилглюкозамин (GlcNAc)
|
Этот сахар присоединяется к полипептидной цепи N-связанных гликопротеинов через остаток Asn; он присутствует и в других частях олигосахаридных компонентов этих белков |
Нуклеотидсахара
Первым описанным нуклеотидсахаром было глюкозильное производное уридиндифосфата - уридиндифосфатглюкоза (UDP–GIc). Позже были обнаружены и другие нуклеотидсахара, участвующие в биосинтезе гликопротеинов, однако причины, по которым одни из них содержат UDP, а другие - гуанозиндифосфат (GDP) или цитидинмонофосфат (CMP), неясны. Многие, но не все реакции гликозилирования при биосинтезе гликопротеинов протекают с использованием этих соединений. Связь между фосфатной группой и сахарами имеет ангидридную природу и принадлежит к разряду богатых энергией связей с высоким потенциалом переноса групп. Сахара в этих соединениях являются «активированными» и при наличии необходимых трансфераз могут переноситься на те или иные акцепторы.
В цитозоле клеток при действии специфических трансфераз на соответствующие нуклеозидтрифосфаты образуются различные нуклеотидсахара. Например, образование уридиндифосфатгалактозы (UDP–Gal) требует протекания следующих двух реакций:
UTP + Глюкозо-1-фосфат
UDP–Glc + Пирофосфат
UDP–Glc
UDP–Gаl
Поскольку многие реакции гликозилирования протекают в просвете мембран комплекса Гольджи, нуклеотидсахара транспортируются через эти мембраны. Описаны транспортные системы, переносящие UDP–Gal, GDP–Man и CMP–NeuAc в цистерны комплекса Гольджи. Они представляют собой примеры систем антипорта; это означает, что приток одной молекулы нуклеотидсахара уравновешивается оттоком одной молекулы соответствующего нуклеотида (например, UMP, GMP или СМР), образовавшегося при расщеплении нуклеотидсахара. Такой механизм обеспечивает адекватную концентрацию каждого нуклеотидсахара внутри комплекса Гольджи. Например, UMP образуется из UDP–Gal следующим образом:
UDP–Gal + Белок
Белок–Gal + UDP
UDP
UMP + Pi
