- •С.Б. Бокуть, в.Э. Сяхович практикум по общей и экологической биохимии
- •Часть III
- •Содержание
- •Лабораторная работа № 7
- •Углеводы
- •Классификация, структура и изомерия углеводов
- •Моносахариды или простые сахара
- •Стереоизомерия моносахаридов
- •Аномерия
- •Пиранозные и фуранозные кольцевые структуры моносахаридов
- •Сложные углеводы
- •Дисахариды
- •Олигосахариды
- •Полисахариды
- •Гомополисахариды
- •Химические свойства углеводов
- •Реакция с фуксин-сернистой кислотой
- •Реакция «серебряного зеркала»
- •Реакция Троммера на моносахариды
- •Реакция с фелинговой жидкостью
- •Реакция Ниландера
- •Реакция Барфеда (позволяет отличать восстанавливающие дисахариды от моносахаридов)
- •Метиленовая проба
- •Качественные реакции на углеводы р еакция Толленса (проба с нафторезорцином)
- •Реакция на углеводы с -нафтолом
- •Р еакция на сахара с антроном
- •Р еакция на кетозы
- •Контрольные вопросы
- •Литература
- •Тема: химические свойства углеводов Редуцирующая способность альдоз и некоторых дисахаридов Реакция «серебряного зеркала»
- •Оформление работы
- •Лабораторная работа № 8
- •Гликопротеины и протеогликаны
- •Гликопротеины
- •Моносахариды, обнаруживаемые в гликопротеинах
- •Нуклеотидсахара
- •Экзогликозидазы и эндогликозидазы
- •Классификация гликопротеинов
- •Процессинг олигосахаридной цепи
- •Регуляция гликозилирования гликопротеинов
- •Протеогликаны и гликозаминогликаны
- •Гиалуроновая кислота
- •Хондроитинсульфаты
- •Кератансульфат I и кератансульфат II
- •Гепарин
- •Гепарансульфат
- •Дерматансульфат
- •Функции гликозамингликанов и протеогликанов
- •Установление гликопротеиновой природы овальбумина и методы количественного определения углеводов Установление гликопротеиновой природы овальбумина
- •Литература
- •Тема: гликопротеины и протеогликаны Установление гликопротеиновой природы яичного альбумина Получение препарата яичного альбумина
- •Доказательство наличия углеводного фрагмента в яичном альбумине
- •Тема: методы количественного определения углеводов Определение концентрации глюкозы в крови орто-толуидиновым методом
- •Определение глюкозы в крови глюкозооксидазным методом
- •Оформление работы
- •Лабораторная работа № 9
- •Углеводный обмен
- •Гликолиз
- •Подготовительная стадия гликолиза
- •Фосфорилирование глюкозы
- •Превращение глюкозо-6-фосфата во фруктозо-6-фосфат
- •Фосфорилирование фруктозо-6-фосфата
- •Расщепление фруктозо-1,6-дифосфата
- •Взаимопревращение фосфотриоз
- •Стадия запасания энергии в гликолизе
- •Окисление глицеральдегид-3-фосфата
- •Перенос фосфатной группы от 1,3-дифосфоглицерата на adp
- •Превращение 3-фосфоглицерата в 2-фосфоглицерат
- •Дегидратация 2-фосфоглицерата
- •Перенос фосфатной группы с фосфоенолпирувата на adp
- •Восстановление пирувата до лактата
- •Итог гликолиза
- •Брожение
- •Метаболизм других важнейших сахаров Обмен моносахаридов
- •Обмен дисахаридов
- •Пентозофосфатный путь
- •Дыхание
- •Подготовительная стадия
- •Цикл Кребса
- •Итог цикла Кребса
- •Окислительное фосфорилирование
- •Изучение эффективности протекания гликолиза в миоцитах
- •Принципы методов Определение концентрации глюкозы глюкозооксидазным методом
- •Определение молочной кислоты с п-оксидифенилом
- •Контрольные вопросы
- •Литература
- •Тема: обмен углеводов Получение препарата мышечного экстракта для изучения гликолиза Приготовление мышечного гомогената
- •Получение мышечного экстракта
- •Гликолиз и его регуляция
- •Изучение влияния концентрации атр на скорость гликолиза
- •Изучение влияния уровня амр на скорость гликолиза
- •Изучение влияния цитрата на скорость гликолиза
- •Определение глюкозы в пробах глюкозооксидазным методом
- •Определение молочной кислоты по реакции с п-оксидифенилом
- •Оформление работы
- •Приложение 1. Структурные формулы основных моносахаридов
- •Часть III
Процессинг олигосахаридной цепи
При перемещении образовавшегося на 1-ом этапе первичного гликопротеина по каналам эндоплазматического ретикулума и цистернам комплекса Гольджи происходит «созревание» олигосахаридного фрагмента. Этот процесс включает в себя чередование реакций (с участием различных ферментов) удаления и присоединения определенных участков олигосахарида с формированием в конечном итоге той структуры, которая свойственна данному белку.
Присоединение олигосахарида протекает в шероховатом эндоплазматическом ретикулуме во время или после трансляции. Удаление Glc и некоторых периферических остатков Man также происходит в эндоплазматическом ретикулуме. Комплекс Гольджи состоит из цис-, медиальной и транс-цистерн. Везикулы, содержащие гликопротеины формируются в эндоплазматическом ретикулуме и переносятся в цис-цистерну Гольджи. Далее при продвижении белков от цис-цистерн к транс-цистернам происходит окончательное построение необходимого олигосахаридного фрагмента. Отметим также, что ферменты, участвующие в биосинтезе гликопротеинов, обладают различной локализацией в цистернах Гольджи.
Регуляция гликозилирования гликопротеинов
Гликозилирование гликопротеинов — это сложный процесс, в котором принимает участие большое количество ферментов. В настоящее время уже описано 7 отдельных GlcNAc-трансфераз, а теоретически их может быть еще больше. К регуляторным факторам первой стадии (то есть сборки и переноса олигосахаридов) биосинтеза N-связанных гликопротеинов относят 1) наличие соответствующих акцепторных центров в белках; 2) уровень Dol–P в ткани; 3) активность олигосахаридтрансферазы.
В регуляции процессинга участвуют многие факторы:
1) различные гидролазы и трансферазы играют важную роль в определении типа образующихся олигосахаридных цепей (например, сложных или высокоманнозных). Очевидно, что в отсутствие какой-нибудь трансферазы, в ткани не может синтезироваться соответствующая сахарная связь;
2) некоторые ферменты могут проявлять свою активность только после предварительного действия другого фермента. Например, для функционирования -маннозидазы II комплекса Гольджи необходимо предварительное действие GlcNAc-трансферазы I;
3) активность разных трансфераз может периодически увеличиваться и уменьшаться в ходе онтогенеза, что отчасти объясняет, каким образом на разных стадиях жизненного цикла организма образуются различные олигосахариды;
4) определенную регуляторную роль играют различия во внутриклеточной локализации отдельных гликозилтрасфераз. Например, если белок предназначен для включения в мембраны эндоплазматического ретикулума (например, гидроксиметилглутарил-(ГМГ)-СоА-редуктаза), он никогда не поступит в цистерны комплекса Гольджи и не будет взаимодействовать с локализованными там ферментами процессинга. В связи с этим не удивительно, что ГМГ-СоА-редуктаза принадлежит к высокоманнозным гликопротеинам (отщепление большинства остатков манноз происходит в комплексе Гольджи);
5) еще один важный фактор – это конформация белка. Близкородственные гликопротеины вирусов, инфицирующих одни и те же клетки, обладают различными типами олигосахаридных цепей. Наилучшее объяснение этого факта состоит, по-видимому, в том, что такие белки должны иметь различную конформацию, определяющую степень процессинга;
6) существуют значительные различия в наборе ферментов процессинга в клетках разных видов. Олигосахариды вируса Sindbis варьируют (от богатых маннозой до сложных) в зависимости от типа клетки хозяина, в которой размножается этот вирус;
7) в настоящее время большое внимание привлекают исследования активности ферментов процессинга гликопротеинов в различных типах раковых клеток. Показано, например, что данные клетки синтезируют олигосахаридные цепи, отличающиеся от таковых в здоровых клетках (обладающие высокой разветвленностью). Особый интерес представляет корреляция активности отдельных ферментов процессинга с метастатическими свойствами некоторых типов опухолевых клеток.
