- •Тема 1.1. Структурная организация белков. Этапы формирования нативной
- •Тема 1.2. Основы функционирования белков. Лекарства как лиганды, влияющие на функцию белков
- •Тема 1.3. Денатурация белков и возможность их спонтанной ренативации
- •Тема 1.4. Особенности строения и функционирования олигомерных белков на примере гемоглобина
- •2. Формирование пространственных структур и функционирование миоглобина.
- •Тема 1.5. Поддержание нативной конформации белков в условиях клетки
- •1. Молекулярные шапероны и их роль в предотвращении денатурации белков.
- •Тема 1.6. Многообразие белков. Семейства белков на примере иммуноглобулинов
- •Тема 1.7. Физико-химические свойства белков и методы их разделения
- •Тема 2.1. Свойства ферментов как белковых
- •2. Для ферментов характерны:
- •Тема 2.2. Активный центр: специфичность действия ферментов
- •Тема 2.3. Механизм действия ферментов
- •Тема 2.4. Кофакторы и коферменты
- •Тема 2.5. Классификация и номенклатура
- •Тема 2.6. Основы кинетики ферментативного
- •Тема 2.7. Ингибиторы активности ферментов
- •Тема 2.8. Регуляция активности ферментов
- •Тема 2.9. Применение ферментов в медицине
- •Тема 2.10. Энзимопатии
- •Тема 3.1. Строение и функции днк и рнк
- •Тема 3.2. Биосинтез днк (репликация)
- •I. Формирование репликативной вилки.
- •II. Синтез новых цепей днк.
- •III. Исключение праймеров. Завершение формирования отстающей цепи
- •II. Синтез новых цепей днк
- •III. Исключение праймеров. Завершение формирования отстающей цепи днк
- •Тема 3.3. Репарация ошибок и повреждений днк
- •Тема 3.4. Биосинтез рнк (транскрипция). Посттранскрипционные модификации рнк
- •Тема 3.5. Трансляция как механизм перевода генетической информации в фенотипические
- •Тема 3.6. Ингибиторы матричных биосинтезов: лекарственные препараты, яды и бактериальные токсины
- •Тема 3.7. Механизмы адаптивной регуляции активности генов у прокариотов и эукариотов
- •Тема 3.8. Механизмы, обеспечивающие разнообразие белков у эукариотов
- •Тема 3.9. Механизмы генетической изменчивости: эволюционная изменчивость, полиморфизм белков. Наследственные болезни
- •Тема 3.10. Использование рекомбинантных днк
- •Тема 4.1. Общая характеристика мембран.
- •Тема 4.2. Транспорт веществ через мембраны
- •3. Перенос макромолекул и частиц с участием мембран - эндоцитоз и экзоцитоз.
- •Тема 4.3. Трансмембранная передача сигналов
- •Тема 5.1. Взаимосвязь обмена веществ и энергии
- •Тема 5.2. Тканевое дыхание
- •Тема 5.3. Митохондриальная цепь переноса электронов
- •1. Перенос электронов на кислород происходит при участии системы переносчиков, локализованных во внутренней мембране митохондрий и образующих цепь переноса электронов (цпэ) (рис. 5.6).
- •Тема 5.4. Сопряжение тканевого дыхания и синтеза атф
- •4. Таким образом, трансформация энергии в организме проходит следующие этапы.
- •Тема 5.5. Дыхательный контроль
- •Тема 5.6. Разобщение дыхания и синтеза атф
- •Тема 5.7. Терморегуляторная функция дыхания
- •Тема 5.8. Ингибиторы дыхания
- •Тема 5.9. Заключительный этап катаболизма пищевых веществ. Специфические и общий пути
- •1. Первая реакция опк - реакция окислительного декарбоксилирования пирувата описывается следующим суммарным уравнением (рис. 5.14).
- •2. Ацетил-КоА, образовавшийся в реакции, катализируемой пдк, далее вступает в цитратный цикл (рис. 5.16).
- •Тема 5.10. Анаболические функции общего пути катаболизма (опк)
- •1. Метаболиты опк служат предшественниками в синтезе ряда веществ в организме: аминокислот, глюкозы, жирных кислот и других соединений (рис. 5.19).
- •2. Убыль метаболитов цитратного цикла восполняется с помощью анаплеротических («пополняющих») реакций, главной из которых является реакция карбоксилирования пирувата.
- •Тема 5.11. Регуляция энергетического обмена
- •Тема 5.12. Гипоэнергетические состояния
- •Тема 6.1. Основные углеводы пищи. Строение,
- •1. Основным источником углеводов организма являются углеводы пищи, к которым относится крахмал. Кроме того, в пище содержатся глюкоза, фруктоза, сахароза и лактоза.
- •Тема 6.2. Трансмембранный перенос глюкозы и других моносахаридов из кишечника в кровь и из крови в клетки тканей. Пути превращения
- •Тема 6.3. Синтез гликогена (гликогеногенез), мобилизация гликогена (гликогенолиз). Регуляция процессов
- •5. Регуляция метаболизма гликогена в печени.
- •Тема 6.4. Нарушения переваривания и всасывания углеводов, синтеза и распада гликогена
- •1. Причинами нарушений переваривания углеводов могут быть:
- •Тема 6.5. Катаболизм глюкозы: аэробный и анаэробный гликолиз. Аэробный распад глюкозы до со2 и н2о
- •2. В аэробном и анаэробном гликолизе можно выделить два этапа.
- •Тема 6.6. Биологическое значение катаболизма глюкозы. Регуляция процесса
- •3. Анаболическое значение катаболизма глюкозы.
- •4. Регуляция катаболизма глюкозы в скелетных мышцах. Основное значение гликолиза - синтез атф, поэтому его скорость должна коррелировать с затратами энергии в организме.
- •Тема 6.7. Пентозофосфатный путь превращения
- •Тема 6.8. Синтез глюкозы (глюконеогенез)
- •2. Большинство реакций гликолиза и глюконеогенеза являются обратимыми и катализируются одними и теми же ферментами (рис. 6.20). Четыре реакции глюконеогенеза необратимы.
- •4. Существенное влияние на глюконеогенез оказывает этанол. Метаболизм этанола на 90% происходит в печени.
- •Тема 6.9. Регуляция гликолиза и глюконеогенеза
- •1. Переключение метаболизма печени с гликолиза на глюконеогенез и наоборот происходит при помощи:
- •Тема 6.10. Регуляция содержания глюкозы в крови, гиперглюкоземия
- •Тема 7.1. Коллаген
- •Тема 7.2. Эластин
- •Тема 7.3. Гетерополисахариды межклеточного
- •Тема 7.4. Неколлагеновые структурные белки межклеточного матрикса
- •Тема 7.5. Структурная организация межклеточного матрикса (суставной хрящ, базальные мембраны, субэпителиальные слои)
- •Тема 10.1. Биосинтез и катаболизм пуриновых рибонуклеотидов. Заболевания, связанные с нарушением их метаболизма
- •3. Синтез нуклеозиддифосфатов (ндф) и нуклеозидтрифосфатов (нтф) происходит при участии атф и ферментов нуклеозидмонофосфат- илинуклеозиддифосфаткиназ (нмф- и ндф-киназы соответственно) (рис. 10.3).
- •4. Регуляция процесса. Амф, гмф, имф, ди- и трифосфаты адениловых и гуаниловых нуклеотидов ингибируют ключевые реакции своего синтезааллостерически по механизму отрицательной обратной связи.
- •2. Регуляция процесса. Активность ферментов синтеза пиримидиновых нуклеотидов регулируется аллостерически по механизму отрицательной обратной связи конечными продуктами умф и цтф:
- •Тема 10.3. Биосинтез дезоксирибонуклеотидов.
- •3. Синтез дТмф из дУмф катализирует тимидилатсинтаза с участием n5n10- метилен н4-фолата, за счет которого:
- •4. Количество ферментов рнРазы и тимидилатсинтазы регулируется на
- •5. Небольшое количество дезоксирибонуклеотидов может образовываться по «запасному» пути в реакциях, катализируемых тимидинкиназой и дезоксицитидинкиназой:
- •Тема 10.4. Механизмы действия противовирусных и противоопухолевых препаратов на ферменты синтеза рибо- и дезоксирибонуклеотидов
- •Тема 8.1. Строение и функции основных липидов организма человека
- •Тема 8. 2. Переваривание и всасывание жиров. Ресинтез жиров в клетках слизистой оболочки
- •Тема 8.3. Хиломикроны - транспортная форма экзогенных жиров
- •Тема 8.4. Биосинтез высших жирных кислот и его регуляция
- •2. Первая реакция синтеза жирных кислот - это превращение ацетил-КоА в малонил-КоА:
- •3. Последующие реакции синтеза жирных кислот катализируются ферментным комплексом - синтазой жирных кислот или пальмитатсинтазой. Конечным продуктом синтеза является пальмитиновая кислота.
- •5. Регуляция синтеза жирных кислот.
- •Тема 8.5. Биосинтез жиров в печени и жировой ткани. Регуляция синтеза жиров
- •5. Запасание жиров в жировой ткани - так называемое депонирование жиров - происходит в абсорбтивный период, когда увеличивается соотношение инсулин - глюкагон.
- •3. В печени жирные кислоты, необходимые для синтеза жиров, синтезируются в основном из продуктов катаболизма глюкозы. Далее синтез жиров идет через образование фосфатидной кислоты (рис. 8.13).
- •Тема 8.6. Ожирение
- •2. Первичное ожирение развивается в результате алиментарного дисбаланса - избыточной калорийности питания по сравнению с расходами энергии.
- •Тема 8.7. Мобилизация жира. Гормональная
- •2. Мобилизация жира происходит в основном под действием гормонов глюкагона и адреналина и представляет собой гидролиз жира в адипоцитах до жирных кислот и глицерола ферментом - гормончувствительной
- •Тема 8.8. Β-окисление высших жирных кислот - источник энергии для синтеза атф. Регуляция I -окисления
- •4. Регуляция β-окисления. Скорость процесса β-окисления зависит от ряда факторов:
- •Тема 8.9. Кетоновые тела: синтез и катаболизм.
- •1. К кетоновым телам относят три вещества: β-гидроксибутират, ацетоацетат и ацетон.
- •Тема 8.10. Производные полиеновых кислот - эйкозаноиды: строение, биосинтез и биологическое действие
- •6. Ингибиторами синтеза эйкозаноидов являются:
- •7. Роль эйкозаноидов в регуляции свертывания крови. В норме свертывающая и противосвертывающая системы крови пребывают в состоянии равновесия, при котором кровь находится в жидком состоянии,
- •Тема 8.11. Холестерол, биологические функции. Поступление с пищей и транспорт кровью экзогенного холестерола
- •Тема 8.12. Биосинтез холестерола и его регуляция
- •Тема 8.13. Биосинтез желчных кислот и их роль
- •Тема 8.14. Роль липопротеинов в транспорте
- •Тема 8.15. Типы дислипопротеинемий. Биохимические основы патогенеза и лечения
- •Тема 9.1. Роль белков в питании. Азотистый баланс
- •Тема 9.2. Переваривание белков в желудке и кишечнике, всасывание аминокислот
- •Тема 9.3. Трансаминирование и дезаминирование аминокислот
- •Тема 9.4. Обмен аммиака: источники, превращение в тканях
- •Тема 9.5. Орнитиновый цикл и его биологическая роль
- •Тема 9.6. Гипераммониемия и ее причины
- •Тема 9.7. Пути использования безазотистых остатков аминокислот
- •Тема 9.8. Биосинтез заменимых аминокислот
- •Тема 9.9. Обмен серина и глицина.
- •Тема 9.10. Обмен метионина. Реакции трансметилирования
- •Тема 9.11. Обмен фенилаланина, тирозина и гистидина в разных тканях
- •Тема 9.12. Заболевания, связанные с нарушением обмена фенилаланина и тирозина
- •Тема 9.13. Биогенные амины: синтез, инактивация, биологическая роль
- •Тема 11.1. Роль гомонов в регуляции метаболизма
- •Тема 11.2. Механизмы передачи гормональных сигналов в клетки
- •Тема 11.3. Строение и биосинтез гормонов
- •Тема 11.4. Регуляция обмена основных энергоносителей при нормальном ритме
- •Тема 11.5. Изменения метаболизма при гипо- и гиперсекреции гормонов
- •Тема 11.6. Изменения гормонального статуса и метаболизма при голодании и физической работе
- •Тема 11.7. Изменения гормонального статуса и метаболизма при сахарном диабете
- •Тема 11.8. Регуляция водно-солевого обмена
- •Тема 11.9. Регуляция обмена кальция и фосфатов. Строение, синтез и механизм действия паратгормона, кальцитриола и кальцитонина
- •Тема 12.1. Механизмы обезвреживания токсических веществ
- •Тема 12.2. Обезвреживание продуктов катаболизма аминокислот в кишечнике
- •Тема 12.3. Биотрансформация лекарств
- •Тема 12.4. Метаболизм и обезвреживание
- •Тема 12.5. Химический канцерогенез
- •Тема 13.1. Синтез гема и его регуляция
- •Тема 13.2. Обмен железа
- •Тема 13.3. Катаболизм гема
- •Тема 14.1. Метаболизм эритроцитов
- •Тема 14.2. Особенности метаболизма фагоцитирующих клеток
- •Тема 14.3. Основные биохимические механизмы
- •Тема 14.4. Основные свойства белковых фракций крови и значение их определения для диагностики заболеваний
Тема 2.6. Основы кинетики ферментативного
КАТАЛИЗА
1. Кинетика ферментативных реакций - это раздел энзимологии, изучающий зависимость скорости химических реакций, катализируемых ферментами, от химической природы реагирующих веществ и факторов окружающей среды.
|
Для измерения каталитической активности ферментов используют такие показатели, как скорость реакции или активность фермента. Скорость ферментативной реакции определяется уменьшением количества молекул субстрата или увеличением количества молекул продукта за единицу времени. Скорость ферментативной реакции является мерой каталитической активности фермента и обозначается как активность фермента.
На практике пользуются условными величинами, характеризующими активность фермента: 1 международная единица активности (МЕ) соответствует такому количеству фермента, которое катализирует превращение 1 мкмоль субстрата за 1 минуту при оптимальных условиях (температура 37°С, оптимальное значение рН раствора) проведения ферментативной
реакции. Эти единицы активности используют в медицинской и фармацевтической практике для оценки активности ферментов:
Для
оценки количества молекул фермента
среди других белков данной ткани
определяют удельную активность (Уд.Ак.)
фермента, численно равную количеству
превращенного субстрата (в мкмолях) за
единицу времени одним миллиграммом
(мг) белка (фермента, выделенного из
ткани):
По
удельной активности судят о степени
очистки фермента: чем меньше посторонних
белков, тем выше удельная активность.
2. Кинетику ферментативных реакций исследуют в оптимальных условиях проведения энзиматической реакции. Оптимальные условия индивидуальны для каждого фермента и определяются в первую очередь температурой, при которой проводится реакция, и значением рН раствора.
• Повышение температуры до определенных пределов оказывает влияние на скорость ферментативной реакции подобно тому, как влияет температура на любую химическую реакцию: с увеличением температуры повышается скорость ферментативной реакции. Однако скорость ферментативной химической реакции имеет свой температурный оптимум, превышение которого сопровождается понижением ферментативной активности, что связано с термической денатурацией белковой молекулы (рис. 2.15). Для большинства ферментов человека оптимальной температурой является 37-38 °С.
|
Рис.
2.15. Зависимость скорости ферментативной
реакции (V) от температуры
• Активность ферментов зависит от рН раствора, при котором протекает ферментативная реакция. Влияние рН на активность ферментов обусловлено изменением ионизации функциональных групп аминокислотных остатков данного белка и субстрата, обеспечивающих оптимальное образование фермент-субстратного комплекса. Для каждого фермента существует значение рН, при котором наблюдается его максимальная активность (рис. 2.16).
Рис.
2.16. Зависимость скорости ферментативной
реакции (V) от рН среды
3. Кинетические характеристики ферментативной реакции зависят от концентрации реагирующих веществ. Если концентрацию фермента оставить постоянной, изменяя только количество субстрата, то график скорости ферментативной реакции описывается гиперболой (рис. 2.17). При увеличении количества субстрата начальная скорость реакции возрастает. Когда фермент становится полностью насыщенным субстратом, т.е. происходит максимально возможное при данной концентрации фермента формирование фермент-субстратных комплексов, наблюдается наибольшая скорость образования продукта. Дальнейшее повышение концентрации субстрата не приводит к увеличению количества образующегося продукта, т.е. скорость реакции не возрастает. Данное состояние соответствует максимальной скорости реакции Vmax
Величина Vmax дает характеристику каталитической активности фермента и определяет максимальную возможность образования продукта при данной концентрации фермента и в условиях избытка субстрата; Vmax - величина, постоянная для данной концентрации фермента.
Рис.
2.17. Зависимость скорости реакции (V) от
концентрации субстрата S:
Vmax - максимальная скорость реакции при данной концентрации фермента в оптимальных условиях проведения реакции; Km - константа Михаэлиса
|
4. Основной кинетической характеристикой эффективности фермента является константа Михаэлиса - Km. Константа Михаэлиса численно равна концентрации субстрата, при которой достигается половина максимальной скорости. Km характеризует сродство данного фермента к данному субстрату и является величиной постоянной. Чем меньше Km, тем больше сродство фермента к данному субстрату, тем выше начальная скорость реакции, и наоборот, чем больше Km, тем меньше сродство фермента к субстрату и меньше начальная скорость реакции.
|
Модульная единица 2 РЕГУЛЯЦИЯ АКТИВНОСТИ ФЕРМЕНТОВ. МЕДИЦИНСКИЕ АСПЕКТЫ ЭНЗИМОЛОГИИ
