Раздел I регулировал доставку товаров из Москвы и внутренних городов в Архангельск и их вывоз из страны.

Его краткое содержание заключалось в следующем:

1. Для производства необходимых таможенных формальностей в отношении товаров, вывозимых из внутренних городов России к Архангельску, в Вологду к 1 апреля надлежало прибыть в качестве правительственных представителей купцам из Москвы, Ярославля, Костромы и Вологды по 2 человека от каждого города (всего 8 человек).

2. По прибытии в Вологду им следовало взять у вологодского таможенного головы «записные книги» на те товары, «которые с Москвы и со всех городов на Вологде написаны в отпуске к Архангельскому городу».

3. Затем уполномоченные знакомились с подлинными «росписями» товаров, которые русские и иностранные купцы намеревались везти из Вологды к Архангельску.

4. Начинался досмотр, устанавливалось соответствие товарной массы, готовой к погрузке, и информации, содержащейся в «росписях». Обнаруженные излишки подлежали конфискации.

5. По завершении досмотра производилась запись товара в специальную книгу. Купцу выдавалась выпись с печатью, разрешалась погрузка и отплытие в Архангельск.

6. С первым же судном в Архангельск отправлялись двое купцов-целовальников. Остальные прибывали туда по завершению оформления и отправки внешних судов. Все торгово-таможенные дела во время ярмарки в Архангельске решались гостем. Гость (таможенный голова) назначался из московской купеческой верхушки. Ему помогали целовальники из Устуга Великого, Каргополя и Соли Вычегодской – по 2 человека от каждого города.

7. По прибытии в Архангельск купец обязан был явиться в таможню и предъявить выпись из Вологды. Содержание выписи заносилось в таможенную книгу. «Выпись служила основанием для получения разрешения от таможни на разгрузку судна.

8. Досмотр производился во время разгрузки судна. Вновь устанавливалось соответствие выгружаемых товаров «выписи». Обнаруженные при этом излишки подлежали конфискации.

9. Если товары поступали в продажу, с них взыскивалось по 10 и 8 денег с рубля с «весчих» и «невесчих» товаров соответственно.

10. Целый ряд товаров был запрещен к вывозу частными лицами.

11. Все купленное иностранцами во внутренних русских городах подлежало оформлению в местных таможнях. При этом записывалось количество, ассортимент и цена товаров.

12. Когда купленные иностранцами русские товары привозились в Новгород, Псков, Архангельск или другой пограничный город и готовились к вывозу, их надлежало досматривать. Обнаруженные при этом излишки подлежали конфискации.

13. По завершении досмотра с этих товаров, предназначенных к вывозу, взималась проезжая пошлина в размере 1 гривны с рубля (10 %).

14. Поскольку в Уставе ничего не говорилось о последующем взимании экспортной (вывозной, отпускной) пошлины, можно предположить, что 10 % пошлина выступала ее заменителем.

15. Если иноземец покупал в порту или пограничном городе русские товары за валюту, он избавлялся от уплаты каких-либо пошлин и беспрепятственно вывозил купленное.

В разделе II Новоторгового устава предусматривалось таможенное регулирование внутренней торговли.

Его краткое содержание заключалось в следующем:

1. Внутренние таможенные сборы включали рублевую и перекупную пошлины и сборы частно-правового характера.

2. Основным внутренним сбором была определена рублевая пошлина, с которой к этому времени окончательно слились ранее упраздненные подужное, мыты, свальное, мостовое, гостиное и др. Ее размер согласно Уставу составлял 10 денег с рубля или 5 % с цены товара. Рублевая пошлина взималась лишь при том условии, когда, во-первых, товары предназначались для продажи, во-вторых, когда они привозились в город или селение, где существовала таможня.

3. Рублевая пошлина взималась с купца в два приема – вначале, как с покупателя, затем, как с продавца.

4. О характере контроля за перемещением товаров внутри страны свидетельствует следующее положение Устава: местный житель, купивший в своем городе товар беспошлинно, не мог следовать с ним в другой город, не явив в таможне. Таможенный голова должен быть записать предъявленный товар в отпускную книгу, и дать ему выпись с печатью и отпустить в другой город.

5. Приехав в другой город, купец должен быть подать выпись в таможне и пройти таможенный досмотр.

Ряд статей раздела II Новоторгового устава посвящались внутренней торговле и таможенной системе в целом и исходили из положений Уставной грамоты 1654 года, которая действовала наравне с ним.

Торговые дела были полностью исключены из ведомства воевод. Купцы освобождались от ответственности за поступки и халатное отношение к делу своих помощников и подчиненных.

Несмотря на то, что в Новоторговый устав не вошли статьи о провозах, мытной пошлине в Москве и гостиной пошлине, их взимание определялось нормами 1653 года.