- •Оглавление
- •Глава 1. Введение ……………………………………………………………………...
- •Глава 2. Физика макромолекул …………………………………………………………
- •Глава 3. Физика белка …………………………………………………………………...
- •Глава 4. Физика ферментов ……………………………………………………………..
- •Глава 5. Физика нуклеиновых кислот ………………………………………………….
- •Глава 6. Регуляция генной активности …………………………………………………
- •Предисловие
- •1.1. Физика и биология
- •Глава 1. Введение.
- •1. На атомно-молекулярном уровне с одной стороны,
- •2. И как целостных систем с другой.
- •1.2. Молекулярная биофизика и её задачи
- •1.3. Методы, используемые в молекулярной биофизике
- •Глава 2. Физика макромолекул.
- •2.1. Элементы стереохимии и поворотно-изомерная теория макромолекул
- •Изотактический полистирол Синдиотактический полистирол
- •Начала термодинамики
- •2.2. Внутреннее вращение и поворотная изомерия
- •2.3. Конформационная теория макромолекул
- •2.4. Поворотно-изомерная теория макромолекул
- •2.5. Объемные взаимодействия и переходы глобула-клубок в полимерных макромолекулах
- •Клубок и глобула
- •Переходы клубок-глобула
- •Замечания к разделу
- •2.6. Упругость полимерной цепи с исключенным объемом
- •2.7. Осмотическое давление полимерного раствора
- •2.8. Статистика линейных полимеров
- •Фракционирование полимеров
- •Глава 3. Физика белка.
- •3.1. Общая характеристика белков
- •3.2. Функции белков
- •3.3. Аминокислоты
- •3.4. Первичная структура
- •3.5. Вторичная структура
- •3.6. Третичная структура
- •3.7. Четвертичная структура
- •3.8. Физико-химические свойства белков
- •3.9. Простые и сложные белки
- •3.10. Химические реакции пептидов
- •3.11. Кислотно-основные свойства белков
- •3.12. Осаждение белков в виде солей
- •3.13. Растворимость белков
- •3.14. Растворы высокомолекулярных соединений
- •3.15. Влияние растворителя на растворимость белка
- •3.16. Влияние температуры на растворимость белка
- •3.17. Осмос и мембранное равновесие белков
- •3.18.Термодинамическое сродство полимера и растворителя
- •3.19. Диффузия
- •3.20. Характеристическая вязкость
- •3.21. Седиментация
- •3.22. Электрофоретическая подвижность
- •3.23. Конформационные переходы у пептидов
- •3.24. Метод Линдерштрема и Ланга
- •3.25. Метод измерения удельного вращения плоскости поляризации света
- •3.26. Поглощение света
- •3.27. Спектроскопия в инфракрасной области
- •3.28. Дисперсия оптической активности
- •3.29. Переходы “спираль-клубок”
- •3.30. Денатурация глобулярных белков
- •3.31. Метод Тенфорда определения разности свободной энергии денатурированного и нативного белка по денатурации в растворе мочевины
- •3.32. Калориметрические измерения денатурационных изменений в белках
- •Миоглобин
- •Гемоглобин
- •Транспорт газов
- •Гуморальный иммунитет гаммаглобулины
- •Классы иммуноглобулинов
- •Синтез иммуноглобулинов
- •Строение толстых и тонких нитей мышечного волокна
- •Элементарный акт мышечного сокращения
- •Рабочий цикл актомиозинового комплекса
- •Кооперативная и "индивидуальная трудовая деятельность" миозина
- •Глава 4. Физика ферментов.
- •4.1. Общая характеристика действия ферментов (определения)
- •4.2. Химическая кинетика и катализ
- •Катализ
- •4.3. Кинетика простых ферментативных реакций
- •4.4. Химические аспекты действия ферментов
- •4.5. Конформационные свойства ферментов
- •4.6. Физика фермент-субстратного взаимодействия
- •4.7. Электронно-конформационные взаимодействия
- •4.8. Ферментативная активность лизоцима
- •Глава 5. Физика нуклеиновых кислот.
- •5.1. Основная характеристика
- •5.2. Первичная структура
- •5.3. Состав днк
- •5.4. Состав рнк
- •5.5. Вторичная структура нуклеиновых кислот
- •5.6. Природа межнуклеотидных связей
- •5.7. Межнуклеотидная связь в днк
- •5.8. Конформационный анализ днк
- •5.9. Необычные структуры днк
- •5.10. Физические модели днк
- •5.11. Третичная структура днк
- •5.12. Межнуклеотидная связь в рнк
- •5.13. Макромолекулярная структура тРнк
- •5.14. Физико-химические свойства днк
- •Вязкость
- •Оптические свойства
- •5.15. Денатурация и ренатурация
- •5.16. Кинетика расплетания двойной спирали
- •5.17. Термодинамика плавления двойной спирали (переходов спираль - клубок)
- •5.18. Процессинг днк и рнк
- •5.19. Репликация
- •5.20. Транскрипция
- •5.21. Синтез белка
- •Глава 6. Регуляция генной активности.
- •6.1. Генетический код
- •6.2. Транспортные рнк и супрессия
- •6.3. Регуляция активности генов
- •Приложение жидкокристаллические формы нуклеиновых кислот
- •Конденсированное состояние высокомолекулярных двухцепочечных днк
- •Жидкокристаллическое состояние низкомолекулярных двухцепочечных днк
- •Жидкокристаллические дисперсии двухцепочечных днк
- •Жидкокристаллическое состояние днк в биологических системах
- •Практическое применение частиц жидкокристаллических дисперсий днк
- •Первые молекулярные моторы на основе днк
- •Новый метод хранения днк
- •Первый самособираемый нанотранзистор на днк основе
- •Жидкая форма днк
- •Сверхпроводимость днк
- •Рекомендуемая литература
Фракционирование полимеров
Фракционирование гетерогенных полимеров производят:
- используя их различия в растворимости, связанные с разными длинами цепи;
- с помощью ультрафильтрования через градуированные мембраны;
- с помощью хроматографии на колонках;
- с помощью ультрацентрифугирования.
В результате получают более гомогенные растворы полимеров, с более узким распределением.
Средние молекулярные массы
Закономерности, по которым данные физические свойства зависят от молекулярной массы, также определяют способ усреднения, который должен быть применен в каждом случае. Таким образом, при рассмотрении различных физических свойств мы неизбежно должны применить различные средние молекулярные массы. Особенно важны среднечисловая и средневесовая, встречаются также средневискозиметрическая и «Z-средняя» молекулярные массы.
Среднечисловая
получается путем суммирования количества
молекул каждого сорта, умноженных на
их молекулярную массу, и деления на
общее число молекул. Для любой смеси
молекул:
,
где Ni
– число молекул сорта i,
имеющихся в смеси, Mi
– их
молекулярная масса.
Вместо числа
молекул Ni
мы можем использовать число молей ni,
число молекул или молей в единице объема
или мольную долю. Удобно пользоваться
мольными долями
и
.
Если смесь представляет собой чистый полимерный образец, в котором молекулы различаются только по степени полимеризации, то х для различных сортов молекул будет меняться от 1 до и их молекулярные массы будут равны Мх=хМо так, что:
Среднечисловая степень полимеризации определяется также:
,
где Nx – число х-мерных молекул или их количество в единице объема.
Средневесовая
молекулярная масса.
получают путем сложения числа граммов
gi
полимера,
молекулы которого имеют молекулярную
массу Mi,
умноженного на эту молекулярную массу,
и деления на общую массу полимера в
граммах. Можно использовать также
концентрацию г/мл или весовую долю Wi
:
И если полимер состоит из одинаковых звеньев, то:
,
Средневесовая степень полимеризации:
,
где Wx – весовая доля.
Общее определение для можно записать другим способом.
Так как масса i-го сорта молекул gi, очевидно, равна NiMi/NA, то:
Используя выражения для Wx и Хх, полученные нами ранее для:
,
и
.
При р1
2
.
и встречаются очень часто. Реже более высокие формы средних величин:
Z-средний -
Z+1-средний -
Суммирование по всем возможностям i. Если образец полностью гомогенен, то во всех случаях
=
=
=
Разность вязкости
полимерного раствора и соответствующего
растворителя часто может быть
пропорциональна произведению весовой
концентрации и М,
где
- константа (0,5-2,0=).
Для гетерогенного образца получают
средневискозиметрический молекулярный
вес
.
= , если =1,0. При <1,0 является промежуточным между и .
