- •Оглавление
- •Глава 1. Введение ……………………………………………………………………...
- •Глава 2. Физика макромолекул …………………………………………………………
- •Глава 3. Физика белка …………………………………………………………………...
- •Глава 4. Физика ферментов ……………………………………………………………..
- •Глава 5. Физика нуклеиновых кислот ………………………………………………….
- •Глава 6. Регуляция генной активности …………………………………………………
- •Предисловие
- •1.1. Физика и биология
- •Глава 1. Введение.
- •1. На атомно-молекулярном уровне с одной стороны,
- •2. И как целостных систем с другой.
- •1.2. Молекулярная биофизика и её задачи
- •1.3. Методы, используемые в молекулярной биофизике
- •Глава 2. Физика макромолекул.
- •2.1. Элементы стереохимии и поворотно-изомерная теория макромолекул
- •Изотактический полистирол Синдиотактический полистирол
- •Начала термодинамики
- •2.2. Внутреннее вращение и поворотная изомерия
- •2.3. Конформационная теория макромолекул
- •2.4. Поворотно-изомерная теория макромолекул
- •2.5. Объемные взаимодействия и переходы глобула-клубок в полимерных макромолекулах
- •Клубок и глобула
- •Переходы клубок-глобула
- •Замечания к разделу
- •2.6. Упругость полимерной цепи с исключенным объемом
- •2.7. Осмотическое давление полимерного раствора
- •2.8. Статистика линейных полимеров
- •Фракционирование полимеров
- •Глава 3. Физика белка.
- •3.1. Общая характеристика белков
- •3.2. Функции белков
- •3.3. Аминокислоты
- •3.4. Первичная структура
- •3.5. Вторичная структура
- •3.6. Третичная структура
- •3.7. Четвертичная структура
- •3.8. Физико-химические свойства белков
- •3.9. Простые и сложные белки
- •3.10. Химические реакции пептидов
- •3.11. Кислотно-основные свойства белков
- •3.12. Осаждение белков в виде солей
- •3.13. Растворимость белков
- •3.14. Растворы высокомолекулярных соединений
- •3.15. Влияние растворителя на растворимость белка
- •3.16. Влияние температуры на растворимость белка
- •3.17. Осмос и мембранное равновесие белков
- •3.18.Термодинамическое сродство полимера и растворителя
- •3.19. Диффузия
- •3.20. Характеристическая вязкость
- •3.21. Седиментация
- •3.22. Электрофоретическая подвижность
- •3.23. Конформационные переходы у пептидов
- •3.24. Метод Линдерштрема и Ланга
- •3.25. Метод измерения удельного вращения плоскости поляризации света
- •3.26. Поглощение света
- •3.27. Спектроскопия в инфракрасной области
- •3.28. Дисперсия оптической активности
- •3.29. Переходы “спираль-клубок”
- •3.30. Денатурация глобулярных белков
- •3.31. Метод Тенфорда определения разности свободной энергии денатурированного и нативного белка по денатурации в растворе мочевины
- •3.32. Калориметрические измерения денатурационных изменений в белках
- •Миоглобин
- •Гемоглобин
- •Транспорт газов
- •Гуморальный иммунитет гаммаглобулины
- •Классы иммуноглобулинов
- •Синтез иммуноглобулинов
- •Строение толстых и тонких нитей мышечного волокна
- •Элементарный акт мышечного сокращения
- •Рабочий цикл актомиозинового комплекса
- •Кооперативная и "индивидуальная трудовая деятельность" миозина
- •Глава 4. Физика ферментов.
- •4.1. Общая характеристика действия ферментов (определения)
- •4.2. Химическая кинетика и катализ
- •Катализ
- •4.3. Кинетика простых ферментативных реакций
- •4.4. Химические аспекты действия ферментов
- •4.5. Конформационные свойства ферментов
- •4.6. Физика фермент-субстратного взаимодействия
- •4.7. Электронно-конформационные взаимодействия
- •4.8. Ферментативная активность лизоцима
- •Глава 5. Физика нуклеиновых кислот.
- •5.1. Основная характеристика
- •5.2. Первичная структура
- •5.3. Состав днк
- •5.4. Состав рнк
- •5.5. Вторичная структура нуклеиновых кислот
- •5.6. Природа межнуклеотидных связей
- •5.7. Межнуклеотидная связь в днк
- •5.8. Конформационный анализ днк
- •5.9. Необычные структуры днк
- •5.10. Физические модели днк
- •5.11. Третичная структура днк
- •5.12. Межнуклеотидная связь в рнк
- •5.13. Макромолекулярная структура тРнк
- •5.14. Физико-химические свойства днк
- •Вязкость
- •Оптические свойства
- •5.15. Денатурация и ренатурация
- •5.16. Кинетика расплетания двойной спирали
- •5.17. Термодинамика плавления двойной спирали (переходов спираль - клубок)
- •5.18. Процессинг днк и рнк
- •5.19. Репликация
- •5.20. Транскрипция
- •5.21. Синтез белка
- •Глава 6. Регуляция генной активности.
- •6.1. Генетический код
- •6.2. Транспортные рнк и супрессия
- •6.3. Регуляция активности генов
- •Приложение жидкокристаллические формы нуклеиновых кислот
- •Конденсированное состояние высокомолекулярных двухцепочечных днк
- •Жидкокристаллическое состояние низкомолекулярных двухцепочечных днк
- •Жидкокристаллические дисперсии двухцепочечных днк
- •Жидкокристаллическое состояние днк в биологических системах
- •Практическое применение частиц жидкокристаллических дисперсий днк
- •Первые молекулярные моторы на основе днк
- •Новый метод хранения днк
- •Первый самособираемый нанотранзистор на днк основе
- •Жидкая форма днк
- •Сверхпроводимость днк
- •Рекомендуемая литература
Рекомендуемая литература
Франк-Каменецкий М.Д. Самая главная молекула.- М.: Наука, 1990.
Волькенштейн М.В. Молекулы и жизнь. - М.: Наука, 1965.
Бреслер С.Е. Молекулярная биология. - Л.: Наука, 1973.
Волькенштейн М.В. Биофизика.- М.: Наука, 1988.
Волькенштейн М.В. Общая биофизика. - М.: Наука, 1978.
Рубин А.Б. Биофизика. В 2 т.- М.:ВШ., 1987.
Рубин А.Б. Теоретическая биофизика. - М.: Университет, 1999.
Эткинс П. Молекулы. - М.: Мир, 1991.
Зенгбуш П. Молекулярная и клеточная биология. В 3 т.-М.: Мир, 1982.
Зенгер В. Принципы структурной организации нуклеиновых кислот. - М.: Мир, 1987.
Перевод под редакцией М.В. Волькенштейна “Структура и стабильность биологических макромолекул” М., Мир, 1978 (Сборник статей из II тома серии “Биологические макромолекулы”)
Смосарев А.А. Биология с общей генетикой. - М.: Медицина, 1978.
Льюин Б. Гены. - М.: Мир, 1987.
Тагер А.А. Физическая химия полимеров. - М.: Химия, 1968.
Бартеньев Г.М., Зеленев Ю.В. Физика и механика полимеров. - М.: ВШ, 1983.
Волькенштейн М.В. Молекулярная биофизика. - М.: Наука, 1975.
Шантрен Ю. Биосинтез белков. - М.,1963.
Кушнер В.П. Коформационная изменчивость и денатурация полимеров. – Л.: Наука, 1977.
Перевод под редакцией Б. Хеймса, С. Хиггинса “Транскрипция и трансляция. Методы” М., Мир, 1987
Зотин А. И. ответственный редактор “Термодинамика биологических процессов” - М., Наука, 1976
Гросберг А.Ю., Хохлов А.Р. Статистическая физика макромолекул. - М.: Наука, 1989.
Тюдзе Р., Каван Т. Физическая химия полимеров. - М.: Химия, 1977.
Рубин А.Б. Термодинамика биологических процессов. - М.: Моск. Ун-т, 1984.
Бартеньев Г.М., Зеленев Ю. В. Курс физики полимеров. - Л.: Химия, 1976.
Фершт Э. Структура и механизм действия ферментов. - М.: Мир, 1980.
Шульц Г.Е., Ширмер Р.Х. Принципы структурной организации белков - М.: Мир, 1982.
Степанов М. Молекулярная биология. Структура и функции белков. - М.: ВШ, 1996.
Финкельштейн А.В., Птицын О.Б. Физика белка. - М.: Университет, 2002.
Франк-Каменецкий М.Д Структура ДНК. Эффекты последовательности. - США.: Энциклопедия. Наука жизни, 2002.
Оглезнева Н.Я. Медицинская и биологическая физика. - Омск, 1994.
Кантор И., Шиммел П. Биофизическая химия. В 3 т. - М.: Мир, 1984-1985.
Ленинджер А. Биохимия. т.1. - М.: Мир, 1986.
Рыбин И.А. Лекции по биофизике. – Свердловск: Свердловский ун-т, 1990.
Альбертс Б., Брей Д., Льюис Дж. Молекулярная биология клетки. В 3 т. - М.: Мир, 1994.
Гросберг А.Ю, Хохлов А.Р. Физика в мире полимеров. - М.: Наука, 1989.
Пташке Х. Переключение генов. - М.: Мир, 1988.
Костюк П.Г. Биофизика. - Киев, 1988.
Маррн Э. Биохимия человека. - М.: Мир, 1993.
Пригожин И.И. От возникающего к существующему. - М., 1985.
Рубин А.Б. Лекции по биофизике. - М.: МГУ, 1994.
Кольс О.Р. Биофизика ритмического возбуждения. - М.: МГУ, 1993.
Дюв К. Путешествие в мир живой клетки. - М.: Мир, 1987.
Рис Э., Стенберг М. От клеток к атомам. - М.: Мир, 1988.
Овчинников Ю. А. Биоорганическая химия. - М.: Просвещение, 1987.
Статьи:
Тихонов А.Н. Молекулярные моторы.// Соросовский образовательный журнал. – 1999. - №6.
Шайтан К.В. Конформационная подвижность белка с точки зрения физики.// Соросовский образовательный журнал. – 1999. - №5.
Шайтан К.В., Немухин А.В., Фирсов Д.А., Богдан Т.В., Тополь Н.А. Электронно-конформационные взаимодействия и значение эффективных зарядов на атомах в пептидах.// Молекулярная биология. – 1997. - т.31.
